24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2126 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2126  protein of unknown function DUF417  100 
 
 		 155 aa  301  3.0000000000000004e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4429  hypothetical protein  37.76 
 
 		 158 aa  88.6  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  0.190357 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2310  hypothetical protein  49.23 
 
 		 295 aa  87.4  6e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4152  hypothetical protein  41.18 
 
 		 279 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0783  hypothetical protein  37.91 
 
 		 162 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.906637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1189  hypothetical protein  38.89 
 
 		 146 aa  79.3  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.932269  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1251  hypothetical protein  34.93 
 
 		 145 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0355  hypothetical protein  36.76 
 
 		 285 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1526  membrane protein  38.3 
 
 		 147 aa  73.2  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.667  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4922  hypothetical protein  36.15 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000341805 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3718  hypothetical protein  32.45 
 
 		 186 aa  67.8  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00204077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3959  hypothetical protein  35.46 
 
 		 200 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0348068 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1875  putative inner membrane protein  36.64 
 
 		 171 aa  61.2  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.843828  normal  0.555208 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4907  hypothetical protein  38.53 
 
 		 276 aa  60.1  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8434  protein of unknown function DUF417  37.19 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5456  hypothetical protein  31.43 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5423  protein of unknown function DUF417  31.43 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3630  hypothetical protein  35.21 
 
 		 170 aa  57  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.225578 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0120  hypothetical protein  33.6 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.602554  normal  0.831461 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0118  hypothetical protein  33.08 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4327  hypothetical protein  28.28 
 
 		 171 aa  51.2  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.705923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5270  protein of unknown function DUF417  28.9 
 
 		 190 aa  46.6  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.139387  normal  0.0500775 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1271  hypothetical protein  27.33 
 
 		 207 aa  41.6  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.709898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4446  hypothetical protein  26.47 
 
 		 207 aa  40.8  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.128792  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>