More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1923 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_1923  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
374 aa  739    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2246  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  68.55 
 
 
374 aa  508  1e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.638485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2293  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  68.55 
 
 
374 aa  508  1e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.387023  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2285  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  68.55 
 
 
374 aa  508  1e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3834  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  67.73 
 
 
376 aa  501  1e-141  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0382059 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2562  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  66.67 
 
 
384 aa  504  1e-141  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12629  alpha-mannosyltransferase pimA  64.89 
 
 
378 aa  463  1e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2291  glycosyl transferase group 1  64.44 
 
 
374 aa  456  1e-127  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.470989  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3418  glycosyl transferase group 1  61.64 
 
 
378 aa  450  1e-125  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000166377  hitchhiker  0.0000275934 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2094  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  64.01 
 
 
375 aa  443  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0705287  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14970  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  60.27 
 
 
381 aa  414  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1353  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  54.3 
 
 
388 aa  387  1e-106  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.652721  normal  0.416501 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2407  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  53.19 
 
 
385 aa  377  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0928502 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17450  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  54.22 
 
 
402 aa  373  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.792945  normal  0.169163 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1787  glycosyl transferase group 1  56.28 
 
 
401 aa  374  1e-102  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0817969  normal  0.0689029 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3184  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  53.93 
 
 
404 aa  370  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2102  glycosyl transferase group 1  54.86 
 
 
388 aa  370  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.072579  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2345  glycosyl transferase group 1  52.56 
 
 
391 aa  362  6e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5152  glycosyl transferase group 1  52.88 
 
 
377 aa  362  8e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.011173  decreased coverage  0.000105469 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1374  glycosyl transferase group 1  50.27 
 
 
400 aa  360  2e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0717655  normal  0.0508272 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1660  glycosyl transferase group 1  54.52 
 
 
435 aa  360  3e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.208349  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1775  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  53.41 
 
 
386 aa  358  8e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00748025 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0821  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  54.59 
 
 
401 aa  354  1e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0720659  normal  0.0739715 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6124  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  50.95 
 
 
375 aa  354  2e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.176978  normal  0.382869 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2072  group 1 glycosyl transferase  52.28 
 
 
375 aa  349  6e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3062  glycosyl transferase group 1  55.01 
 
 
371 aa  344  1e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.147166  normal  0.246435 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1364  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  52.88 
 
 
388 aa  344  1e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.413913 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1788  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  53.39 
 
 
386 aa  339  5e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1983  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  53.85 
 
 
390 aa  332  5e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.636916  normal  0.0126496 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2101  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  52.16 
 
 
379 aa  332  6e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.445016  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1866  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  35.39 
 
 
396 aa  211  2e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15390  glycosyltransferase  37.47 
 
 
398 aa  199  7e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0605361  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4807  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  35.34 
 
 
372 aa  197  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4147  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  41.08 
 
 
379 aa  195  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4290  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  38.65 
 
 
375 aa  194  3e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.272713  normal  0.937919 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4300  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  39.4 
 
 
379 aa  189  5e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4278  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  39.4 
 
 
379 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54539  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1613  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  35.53 
 
 
775 aa  186  7e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2620  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  37.18 
 
 
385 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0978  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.17 
 
 
382 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000355781  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_851  glycosyltransferase  31.9 
 
 
382 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209144  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0869  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  30.83 
 
 
382 aa  171  2e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000612209  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1540  glycosyl transferase group 1  31.91 
 
 
370 aa  144  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0102267  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1445  glycosyl transferase group 1  31.32 
 
 
370 aa  142  8e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2418  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  31.32 
 
 
370 aa  142  8e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00701147  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1223  glycosyl transferase group 1  35 
 
 
355 aa  139  6e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.764713  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3661  glycosyl transferase group 1  34.32 
 
 
367 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3592  glycosyl transferase group 1  34.32 
 
 
367 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1460  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  31.43 
 
 
374 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114403  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3504  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  33.77 
 
 
367 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4328  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  30.83 
 
 
381 aa  125  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00438832  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  30.18 
 
 
370 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0448  glycosyl transferase group 1  31.09 
 
 
381 aa  118  1.9999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.504069 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  33.82 
 
 
406 aa  109  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05020  glycosyltransferase  33.94 
 
 
387 aa  107  3e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1287  glycosyl transferase group 1  28.46 
 
 
392 aa  105  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  29.5 
 
 
423 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  24.6 
 
 
380 aa  101  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  30.79 
 
 
362 aa  101  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0240  glucosyltransferase  24.87 
 
 
364 aa  100  5e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3891  glycosyl transferase group 1  30.97 
 
 
377 aa  99.8  6e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14972  normal  0.743624 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  25.62 
 
 
390 aa  99  1e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  30.43 
 
 
367 aa  98.6  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3569  glycosyl transferase, group 1  26.49 
 
 
369 aa  98.2  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798632  decreased coverage  0.00507344 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  27.42 
 
 
426 aa  98.2  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  25.38 
 
 
395 aa  97.8  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2935  glycosyl transferase group 1  29.81 
 
 
407 aa  95.9  9e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.577866  normal  0.524433 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  27.3 
 
 
408 aa  95.5  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  25.99 
 
 
410 aa  94.4  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2586  glycosyl transferase group 1  25.7 
 
 
384 aa  94  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.687638 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1500  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 
383 aa  93.6  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  28.78 
 
 
446 aa  93.2  6e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3115  group 1 glycosyl transferase  26.91 
 
 
374 aa  93.2  6e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  26.37 
 
 
373 aa  92.8  9e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  28 
 
 
419 aa  92.4  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2063  glycosyl transferase, group 1  27.23 
 
 
392 aa  91.7  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7048  putative O-antigen export system permease protein  32.47 
 
 
638 aa  90.9  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4841  glycosyl transferase, group 1  28.09 
 
 
374 aa  90.1  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000142373  normal  0.0561788 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0080  glycosyl transferase group 1  29.49 
 
 
404 aa  90.1  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1996  glycosyl transferase group 1  27.22 
 
 
364 aa  90.1  5e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  24.87 
 
 
393 aa  90.1  5e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  27.53 
 
 
376 aa  90.5  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  30.12 
 
 
403 aa  90.1  6e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  33.17 
 
 
396 aa  89.4  9e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1731  N-acetylglucosaminyl-phosphatidylinositol biosynthetic protein  24.87 
 
 
376 aa  89  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.183221  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  24.27 
 
 
536 aa  89.4  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3711  glycosyl transferase group 1  26.27 
 
 
376 aa  89  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202497  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2514  glycosyl transferase group 1  39.9 
 
 
351 aa  88.2  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0260745  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0898  hypothetical protein  32.67 
 
 
407 aa  88.2  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0966  glycosyl transferase group 1  29.44 
 
 
382 aa  87.8  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0155699  normal  0.836168 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  27.68 
 
 
413 aa  87.4  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  25.87 
 
 
419 aa  87  5e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  32.91 
 
 
392 aa  86.7  6e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1334  glycosyl transferase group 1  26.49 
 
 
385 aa  86.7  7e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2177  putative glycosyl transferase  31.87 
 
 
385 aa  85.9  9e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.010709  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0138  glycosyl transferase group 1  27.66 
 
 
405 aa  85.5  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  31.8 
 
 
383 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4083  glycosyl transferase group 1  27.09 
 
 
399 aa  85.5  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5718  glycosyl transferase, group 1  28.05 
 
 
411 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  27.04 
 
 
385 aa  85.1  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>