66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1496 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1496  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  100 
 
 		 193 aa  375  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0238853  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2950  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  50 
 
 		 206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146848 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2684  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  49.33 
 
 		 168 aa  143  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0764401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2654  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  49.33 
 
 		 168 aa  143  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2699  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  49.33 
 
 		 168 aa  143  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00896784 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1501  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  46.41 
 
 		 183 aa  135  3.0000000000000003e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3235  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  45.39 
 
 		 192 aa  129  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.58965  normal  0.310038 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1269  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  38.02 
 
 		 393 aa  63.9  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11930  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.99 
 
 		 363 aa  58.2  0.00000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.188259  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0570  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, FKBP-type  37.5 
 
 		 135 aa  57.4  0.0000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0427302 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2179  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  40.86 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0121928  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0769  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  34.17 
 
 		 135 aa  53.5  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00146936  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1922  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  38.54 
 
 		 322 aa  52.8  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000672335 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1828  FKBP-type peptidylprolyl isomerase  37.25 
 
 		 322 aa  51.2  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13970  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  30.97 
 
 		 401 aa  50.4  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.081322  normal  0.466348 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0929  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  32.03 
 
 		 134 aa  50.4  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.824794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4832  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  35.79 
 
 		 122 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2963  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  36.73 
 
 		 135 aa  50.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00371076  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1737  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  32.5 
 
 		 325 aa  49.7  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4537  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  35.79 
 
 		 122 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.267804  normal  0.561602 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4450  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  35.79 
 
 		 122 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.169235  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7175  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  35.24 
 
 		 124 aa  48.5  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.100043 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1271  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  35.11 
 
 		 122 aa  48.1  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0350  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  35.05 
 
 		 267 aa  47.4  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5011  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  34.74 
 
 		 120 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0206135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1337  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  32.98 
 
 		 253 aa  47.8  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.77077  normal  0.401003 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1694  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  33.65 
 
 		 122 aa  47.8  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0124693  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0709  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FkpA, FKBP-type  31.07 
 
 		 253 aa  46.6  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000225861 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01223  fkbp-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase; rotamase  37.25 
 
 		 324 aa  46.6  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0650575  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1060  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  35.42 
 
 		 133 aa  45.8  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.597651 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3226  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  36.63 
 
 		 327 aa  45.4  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.172675  normal  0.0108474 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2314  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  32.05 
 
 		 308 aa  45.4  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000175551  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2090  peptidyl-prolyl isomerase  37.89 
 
 		 243 aa  45.4  0.0005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2649  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  30 
 
 		 317 aa  45.1  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.302821  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2406  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  37.89 
 
 		 243 aa  45.4  0.0006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.747054  normal  0.689031 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1740  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  32.99 
 
 		 120 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.580811 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0505  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  40.74 
 
 		 261 aa  44.3  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1884  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  29.24 
 
 		 323 aa  43.9  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.241039  hitchhiker  0.00501682 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1773  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase 1  28.86 
 
 		 378 aa  44.3  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2430  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  35.42 
 
 		 124 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4454  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  39.51 
 
 		 263 aa  43.5  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4873  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  31.58 
 
 		 210 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.746078  normal  0.135441 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3970  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  33.67 
 
 		 222 aa  43.5  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.702234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2429  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  35.35 
 
 		 327 aa  43.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.358773  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1498  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  30.7 
 
 		 367 aa  42.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.169435  hitchhiker  0.000876054 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2429  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  34.34 
 
 		 320 aa  43.1  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0856  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  32.98 
 
 		 137 aa  43.1  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.407893  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0710  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, FKBP-type  31.78 
 
 		 195 aa  43.1  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000600105 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3274  Peptidylprolyl isomerase  33.66 
 
 		 142 aa  43.1  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108066  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1120  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  33.33 
 
 		 322 aa  43.1  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3238  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  35.58 
 
 		 250 aa  42.7  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000161464  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1328  Peptidylprolyl isomerase  36.36 
 
 		 253 aa  42.7  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.635947  normal  0.391085 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1574  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  31.71 
 
 		 134 aa  42.4  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0820216  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0105  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  32.32 
 
 		 144 aa  42.4  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0195939  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0990  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  34.34 
 
 		 135 aa  42  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2909  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  35.85 
 
 		 256 aa  42  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000221867  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6522  Peptidylprolyl isomerase  35.48 
 
 		 258 aa  42  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2611  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  33.68 
 
 		 235 aa  42  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000370807  normal  0.149177 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1075  peptidylprolyl isomerase  34 
 
 		 139 aa  42  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.94553 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0452  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  34.34 
 
 		 206 aa  41.6  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.304898  hitchhiker  0.00456401 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1537  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  32.61 
 
 		 124 aa  41.2  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.104701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4254  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  33.73 
 
 		 124 aa  41.2  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1277  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  34.65 
 
 		 318 aa  41.2  0.01  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.76357  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1245  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  34.65 
 
 		 318 aa  41.2  0.01  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.446078  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08130  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  33.33 
 
 		 134 aa  41.2  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.298894  normal  0.402814 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16150  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  34.44 
 
 		 127 aa  41.2  0.01  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0395566  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>