127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1153 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1153  protein of unknown function DUF692  100 
 
 		 297 aa  577  1.0000000000000001e-163  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.298078  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1559  hypothetical protein  47.97 
 
 		 266 aa  207  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0584838  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1735  hypothetical protein  44.74 
 
 		 460 aa  188  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0241629  decreased coverage  0.000466005 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3068  hypothetical protein  45.73 
 
 		 272 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.125457 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3295  hypothetical protein  45.73 
 
 		 272 aa  181  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000891733 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6045  hypothetical protein  33.47 
 
 		 283 aa  110  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0730342  normal  0.483974 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1262  hypothetical protein  28.47 
 
 		 318 aa  103  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.328602  normal  0.993463 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3398  hypothetical protein  31.25 
 
 		 303 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0783117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0527  hypothetical protein  29.2 
 
 		 292 aa  102  8e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.754891  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2208  hypothetical protein  25.36 
 
 		 287 aa  100  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0712  hypothetical protein  30.05 
 
 		 275 aa  97.4  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6305  hypothetical protein  33.93 
 
 		 280 aa  97.4  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.380484  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2180  hypothetical protein  25.36 
 
 		 287 aa  96.3  6e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4291  hypothetical protein  32.35 
 
 		 288 aa  94.7  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4401  hypothetical protein  32.35 
 
 		 288 aa  94.7  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0587  hypothetical protein  30.8 
 
 		 313 aa  94.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0642886  normal  0.716102 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4684  hypothetical protein  33.46 
 
 		 278 aa  94.7  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34246  normal  0.868171 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0735  hypothetical protein  29.3 
 
 		 294 aa  94.7  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.291211 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3130  hypothetical protein  29.93 
 
 		 292 aa  94.7  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0732  hypothetical protein  29.53 
 
 		 275 aa  94  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2533  hypothetical protein  31.67 
 
 		 309 aa  93.6  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00022761 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1430  hypothetical protein  31.92 
 
 		 307 aa  93.6  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.51935  normal  0.711146 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0992  hypothetical protein  34.08 
 
 		 277 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1775  hypothetical protein  25.27 
 
 		 281 aa  92.8  6e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00353  hypothetical protein  29.57 
 
 		 308 aa  92.8  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0724  hypothetical protein  25.68 
 
 		 289 aa  92.8  7e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0704  hypothetical protein  26.13 
 
 		 289 aa  92  9e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2222  hypothetical protein  27.8 
 
 		 278 aa  92  9e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.230612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002084  hypothetical protein  25.96 
 
 		 289 aa  91.3  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3406  hypothetical protein  25.87 
 
 		 310 aa  90.1  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.11414  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4400  hypothetical protein  30.3 
 
 		 278 aa  90.1  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1029  hypothetical protein  33.52 
 
 		 277 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.752115 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4647  hypothetical protein  28.9 
 
 		 298 aa  89.4  7e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3267  protein of unknown function DUF692  27.41 
 
 		 339 aa  89.4  7e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3962  hypothetical protein  35.33 
 
 		 296 aa  89  9e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.019618 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1004  hypothetical protein  27.37 
 
 		 290 aa  87.8  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.863702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1558  hypothetical protein  27.64 
 
 		 283 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.103302 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3694  hypothetical protein  28.26 
 
 		 279 aa  86.7  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0410237 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5938  hypothetical protein  27.27 
 
 		 308 aa  87  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2174  hypothetical protein  30.55 
 
 		 303 aa  86.3  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.356635  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2030  hypothetical protein  30.55 
 
 		 293 aa  85.9  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5128  hypothetical protein  30.17 
 
 		 307 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2688  hypothetical protein  31.79 
 
 		 297 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.118004  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1242  hypothetical protein  28.57 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.933604 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1723  hypothetical protein  27.76 
 
 		 283 aa  84.3  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2032  hypothetical protein  32.92 
 
 		 285 aa  84.7  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.392339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2959  hypothetical protein  32.06 
 
 		 298 aa  84.7  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0652339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0757  hypothetical protein  33.63 
 
 		 276 aa  84.3  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.380653 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01094  hypothetical protein  27.05 
 
 		 283 aa  84  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0997289  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3392  hypothetical protein  30 
 
 		 300 aa  84  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0944  hypothetical protein  23.58 
 
 		 284 aa  83.6  0.000000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.98615 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0303  hypothetical protein  29.06 
 
 		 296 aa  83.2  0.000000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.371477 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0120  hypothetical protein  25.42 
 
 		 290 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2190  hypothetical protein  33.52 
 
 		 277 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.84391  normal  0.86981 
 
 
-
 
NC_003296  RS02372  hypothetical protein  32.6 
 
 		 285 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.357992  normal  0.0533117 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1381  hypothetical protein  25.64 
 
 		 295 aa  80.5  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0499971  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3066  hypothetical protein  34.64 
 
 		 277 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.37853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2081  hypothetical protein  31.3 
 
 		 279 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2831  hypothetical protein  27.27 
 
 		 301 aa  79.3  0.00000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0904  hypothetical protein  25.09 
 
 		 312 aa  79  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3108  hypothetical protein  29.02 
 
 		 283 aa  77.8  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2900  hypothetical protein  26.6 
 
 		 282 aa  77  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2359  hypothetical protein  29.05 
 
 		 311 aa  77.4  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0967  hypothetical protein  26.01 
 
 		 319 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2852  hypothetical protein  29.68 
 
 		 281 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.972172  normal  0.24478 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1138  hypothetical protein  23.59 
 
 		 367 aa  75.1  0.000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1503  hypothetical protein  25.33 
 
 		 283 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.310146  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0846  hypothetical protein  24.78 
 
 		 311 aa  74.7  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2240  hypothetical protein  26.1 
 
 		 278 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000381376  hitchhiker  0.000876549 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2550  hypothetical protein  28.15 
 
 		 283 aa  73.9  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.446305  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4062  hypothetical protein  26.46 
 
 		 305 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1607  hypothetical protein  30.77 
 
 		 320 aa  73.6  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4790  hypothetical protein  28.51 
 
 		 300 aa  72.8  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1584  protein of unknown function DUF692  29.34 
 
 		 299 aa  72.4  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3153  hypothetical protein  26.77 
 
 		 280 aa  72.4  0.000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0753442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0028  hypothetical protein  26.43 
 
 		 283 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1554  hypothetical protein  30.22 
 
 		 280 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.220831 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1837  hypothetical protein  28.83 
 
 		 284 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3392  hypothetical protein  22.88 
 
 		 299 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3517  hypothetical protein  22.88 
 
 		 299 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.753401 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20741  hypothetical protein  24.23 
 
 		 292 aa  69.7  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.393994 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0773  hypothetical protein  27.78 
 
 		 316 aa  69.7  0.00000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.91386  normal  0.243423 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0025  hypothetical protein  25.55 
 
 		 283 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1533  hypothetical protein  25.55 
 
 		 283 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1178  hypothetical protein  25.55 
 
 		 283 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1458  hypothetical protein  25.55 
 
 		 283 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0045  hypothetical protein  25.55 
 
 		 283 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0031  hypothetical protein  25.55 
 
 		 283 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0031  hypothetical protein  25.55 
 
 		 283 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3297  hypothetical protein  28.33 
 
 		 277 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.867164 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1788  hypothetical protein  26.37 
 
 		 278 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000100134 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2398  hypothetical protein  28.33 
 
 		 277 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4743  protein of unknown function DUF692  30.68 
 
 		 293 aa  68.6  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.647545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2259  hypothetical protein  25.88 
 
 		 279 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000651935  normal  0.545232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2331  hypothetical protein  26.32 
 
 		 279 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000989316  normal  0.0101527 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1061  hypothetical protein  22.51 
 
 		 299 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00359459 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3296  hypothetical protein  22.96 
 
 		 299 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0811  hypothetical protein  25.66 
 
 		 313 aa  68.2  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.5627  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2450  hypothetical protein  25.88 
 
 		 279 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00881658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0989  hypothetical protein  29.43 
 
 		 276 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.449619  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>