62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0675 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0675  hypothetical protein  100 
 
 
207 aa  419  1e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0658  hypothetical protein  72.82 
 
 
211 aa  304  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.520841 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0247  hypothetical protein  72.33 
 
 
207 aa  303  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0462  adenylate cyclase  69.5 
 
 
210 aa  284  7e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2242  hypothetical protein  57.35 
 
 
210 aa  220  9.999999999999999e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.431066  hitchhiker  0.000831197 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12700  hypothetical protein  51.92 
 
 
212 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.457956  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1579  hypothetical protein  49.03 
 
 
218 aa  199  1.9999999999999998e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2481  hypothetical protein  48.02 
 
 
211 aa  192  2e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.639478  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1116  hypothetical protein  47.76 
 
 
208 aa  192  2e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2407  hypothetical protein  33.52 
 
 
168 aa  79  0.00000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0188  adenylate cyclase  30.81 
 
 
157 aa  74.7  0.0000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.302064  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26851  hypothetical protein  30.98 
 
 
166 aa  69.7  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2791  adenylate cyclase  29.14 
 
 
158 aa  68.9  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.530702  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1972  adenylate cyclase  32.18 
 
 
153 aa  67.8  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.103162  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1434  adenylate cyclase  30.81 
 
 
157 aa  67  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.393399  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0642  adenylate cyclase  29.55 
 
 
158 aa  65.9  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2731  adenylate cyclase  26.86 
 
 
155 aa  65.5  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0936811 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0645  adenylate cyclase  32.41 
 
 
154 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0967882  normal  0.674307 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1903  adenylate cyclase  30.46 
 
 
155 aa  63.5  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00185179  hitchhiker  0.00135379 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2092  adenylate cyclase  28.98 
 
 
154 aa  63.5  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218396  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01721  adenylate cyclase  27.47 
 
 
166 aa  63.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01731  hypothetical protein  26.44 
 
 
157 aa  63.2  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0285  hypothetical protein  32.95 
 
 
168 aa  62.8  0.000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01751  hypothetical protein  27.27 
 
 
165 aa  62.8  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.690829  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2454  hypothetical protein  28.33 
 
 
166 aa  62  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0920685  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02800  hypothetical protein  28.74 
 
 
158 aa  62  0.000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2714  adenylate cyclase  30.9 
 
 
162 aa  61.6  0.000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.668137 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2597  adenylate cyclase  29.48 
 
 
159 aa  61.2  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0157  hypothetical protein  24.43 
 
 
165 aa  60.5  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.769937  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1849  adenylate cyclase  30.64 
 
 
154 aa  59.7  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3881  adenylate cyclase  29.48 
 
 
156 aa  59.3  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2371  adenylate cyclase  31.4 
 
 
155 aa  57.8  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02281  hypothetical protein  23.39 
 
 
166 aa  57.4  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0794141  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1522  hypothetical protein  23.98 
 
 
166 aa  57  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3819  hypothetical protein  30.12 
 
 
164 aa  55.8  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.395833  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1305  adenylate cyclase  38.36 
 
 
166 aa  54.3  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185682  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0553  adenylate cyclase  36.99 
 
 
157 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2970  adenylate cyclase  28.05 
 
 
169 aa  54.7  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0485889  hitchhiker  0.0000193778 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01723  adenylate cyclase  26.95 
 
 
165 aa  54.7  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2577  adenylate cyclase  28.57 
 
 
156 aa  54.3  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1600  adenylate cyclase  30.86 
 
 
158 aa  53.9  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0254907  normal  0.933887 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6085  adenylate cyclase  30.18 
 
 
177 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0896962  decreased coverage  0.000860765 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0365  adenylate cyclase  27.17 
 
 
156 aa  51.2  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0254785  unclonable  0.0000000000318495 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3697  adenylate cyclase  30.3 
 
 
162 aa  50.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6440  adenylate cyclase  28.99 
 
 
158 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1469  adenylate cyclase  28.19 
 
 
165 aa  49.7  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.00690729  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1526  putative adenylate cyclase family protein  28.19 
 
 
165 aa  49.7  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.395104  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5726  adenylate cyclase  27.54 
 
 
182 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1325  adenylate cyclase  29.89 
 
 
156 aa  49.3  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.350465  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4035  adenylate cyclase  29.76 
 
 
161 aa  48.9  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1282  hypothetical protein  28.48 
 
 
151 aa  48.5  0.00007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3561  adenylate cyclase  26.7 
 
 
159 aa  48.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2545  adenylate cyclase  26.7 
 
 
159 aa  48.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1910  adenylate cyclase  28.57 
 
 
155 aa  47.8  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01841  hypothetical protein  24.14 
 
 
158 aa  48.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4257  adenylate cyclase  26.63 
 
 
157 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.699836  normal  0.359028 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0074  adenylate cyclase  32.34 
 
 
151 aa  46.6  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1805  adenylate cyclase  28.9 
 
 
159 aa  45.4  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.340802  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1263  adenylate cyclase  29.55 
 
 
157 aa  45.8  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.708704  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3398  adenylate cyclase  29.7 
 
 
162 aa  45.4  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0264802 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0182  adenylate cyclase  28.74 
 
 
179 aa  42.4  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.443467  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6613  adenylate cyclase  31.43 
 
 
187 aa  41.6  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107312  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>