More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1495 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_3594  phosphoglycerate kinase  85.93 
 
 
393 aa  687    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000956602 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1495  phosphoglycerate kinase  100 
 
 
394 aa  793    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.669202  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1532  Phosphoglycerate kinase  72.86 
 
 
403 aa  591  1e-168  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1817  phosphoglycerate kinase  72.36 
 
 
403 aa  588  1e-167  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.363039  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0289  phosphoglycerate kinase  71.65 
 
 
397 aa  559  1e-158  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.018111 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0670  phosphoglycerate kinase  70.81 
 
 
398 aa  551  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2425  phosphoglycerate kinase  71.07 
 
 
397 aa  549  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0295.1  phosphoglycerate kinase  71.07 
 
 
397 aa  549  1e-155  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.266807  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0037  phosphoglycerate kinase  71.07 
 
 
442 aa  549  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0995  phosphoglycerate kinase  71.07 
 
 
442 aa  549  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.157349  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0478  phosphoglycerate kinase  71.98 
 
 
403 aa  549  1e-155  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.716097  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5959  phosphoglycerate kinase  70.81 
 
 
398 aa  549  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0491  phosphoglycerate kinase  71.72 
 
 
403 aa  548  1e-155  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.29999  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0833  phosphoglycerate kinase  71.07 
 
 
442 aa  549  1e-155  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0663  phosphoglycerate kinase  71.07 
 
 
397 aa  550  1e-155  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.318598  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2657  phosphoglycerate kinase  70.81 
 
 
398 aa  548  1e-155  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.437017  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0591  phosphoglycerate kinase  71.07 
 
 
442 aa  549  1e-155  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0571  phosphoglycerate kinase  71.21 
 
 
419 aa  547  1e-154  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0838  phosphoglycerate kinase  70.81 
 
 
397 aa  547  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0106089  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0501  phosphoglycerate kinase  70.81 
 
 
418 aa  546  1e-154  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2628  phosphoglycerate kinase  70.56 
 
 
398 aa  547  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2548  phosphoglycerate kinase  70.56 
 
 
448 aa  542  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.142886  normal  0.863672 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2017  phosphoglycerate kinase  70.56 
 
 
470 aa  543  1e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2675  phosphoglycerate kinase  70.3 
 
 
398 aa  544  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0559  phosphoglycerate kinase  70.98 
 
 
398 aa  533  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0689  phosphoglycerate kinase  71.24 
 
 
397 aa  532  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.291639 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3277  phosphoglycerate kinase  70.98 
 
 
397 aa  530  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0459  phosphoglycerate kinase  70.47 
 
 
397 aa  528  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.307105 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5101  Phosphoglycerate kinase  69.37 
 
 
410 aa  527  1e-148  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3690  phosphoglycerate kinase  67.09 
 
 
397 aa  523  1e-147  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0828  phosphoglycerate kinase  67.34 
 
 
438 aa  520  1e-146  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4693  phosphoglycerate kinase  69.11 
 
 
397 aa  520  1e-146  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.517032  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1516  phosphoglycerate kinase  70.03 
 
 
396 aa  517  1.0000000000000001e-145  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0183024  decreased coverage  0.0000800022 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0355  phosphoglycerate kinase  66.08 
 
 
397 aa  513  1e-144  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0964391 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1987  phosphoglycerate kinase  67.68 
 
 
400 aa  513  1e-144  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.246493  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4078  phosphoglycerate kinase  69.47 
 
 
412 aa  511  1e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.942349 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3874  phosphoglycerate kinase  67.19 
 
 
397 aa  509  1e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3401  phosphoglycerate kinase  68.61 
 
 
397 aa  501  1e-141  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.780201  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4056  phosphoglycerate kinase  68.35 
 
 
397 aa  501  1e-141  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.352775  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4635  phosphoglycerate kinase  66.49 
 
 
443 aa  496  1e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2247  phosphoglycerate kinase  63.1 
 
 
393 aa  489  1e-137  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196121 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2388  Phosphoglycerate kinase  61.83 
 
 
392 aa  486  1e-136  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0256247 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3250  phosphoglycerate kinase  62.72 
 
 
401 aa  481  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.397382  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2851  Phosphoglycerate kinase  62.72 
 
 
401 aa  481  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.222311  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02116  phosphoglycerate kinase  62.66 
 
 
391 aa  482  1e-135  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.817646  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0407  phosphoglycerate kinase  60.97 
 
 
399 aa  481  1e-134  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.873778  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3216  phosphoglycerate kinase  62.15 
 
 
391 aa  477  1e-133  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.360603 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2891  phosphoglycerate kinase  61.83 
 
 
392 aa  474  1e-133  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2792  phosphoglycerate kinase  59.85 
 
 
393 aa  477  1e-133  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.259716  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2021  phosphoglycerate kinase  60.61 
 
 
391 aa  473  1e-132  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0161  phosphoglycerate kinase  59.54 
 
 
393 aa  472  1e-132  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.278455 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0386  phosphoglycerate kinase  59.85 
 
 
395 aa  474  1e-132  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1085  phosphoglycerate kinase  60.1 
 
 
391 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00353094  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0790  phosphoglycerate kinase  60.36 
 
 
391 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250302  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0246  phosphoglycerate kinase  60.41 
 
 
393 aa  465  9.999999999999999e-131  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000372515  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0876  phosphoglycerate kinase  60.1 
 
 
391 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000236749  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02757  phosphoglycerate kinase  61.07 
 
 
387 aa  462  1e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0767  Phosphoglycerate kinase  61.07 
 
 
387 aa  462  1e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.365965  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3063  phosphoglycerate kinase  61.07 
 
 
387 aa  462  1e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.18176  normal  0.182974 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3874  phosphoglycerate kinase  60.05 
 
 
391 aa  462  1e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3084  phosphoglycerate kinase  61.07 
 
 
387 aa  462  1e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03158  3-phosphoglycerate kinase  58.27 
 
 
391 aa  461  1e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2806  phosphoglycerate kinase  60.61 
 
 
392 aa  462  1e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.19528  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3254  phosphoglycerate kinase  61.07 
 
 
387 aa  462  1e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.533189  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02720  hypothetical protein  61.07 
 
 
387 aa  462  1e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0784  phosphoglycerate kinase  61.07 
 
 
387 aa  462  1e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.356928  normal  0.514456 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3351  phosphoglycerate kinase  60.81 
 
 
387 aa  461  1e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.63382  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0754  phosphoglycerate kinase  59.34 
 
 
391 aa  461  1e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.729853  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2842  phosphoglycerate kinase  58.88 
 
 
392 aa  462  1e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3023  Phosphoglycerate kinase  60.36 
 
 
393 aa  462  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0922941  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3242  phosphoglycerate kinase  60.56 
 
 
387 aa  459  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4223  phosphoglycerate kinase  61.07 
 
 
387 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3411  phosphoglycerate kinase  60.56 
 
 
387 aa  459  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.131845 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3339  phosphoglycerate kinase  60.05 
 
 
387 aa  459  9.999999999999999e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.128748  normal  0.470052 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3309  phosphoglycerate kinase  60.56 
 
 
387 aa  459  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3306  phosphoglycerate kinase  60.56 
 
 
387 aa  459  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170041  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0371  phosphoglycerate kinase  61.03 
 
 
387 aa  458  9.999999999999999e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3231  phosphoglycerate kinase  60.56 
 
 
387 aa  459  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.461045  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3038  phosphoglycerate kinase  59.85 
 
 
386 aa  461  9.999999999999999e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.586189  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3328  phosphoglycerate kinase  58.82 
 
 
391 aa  456  1e-127  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.465511  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0649  phosphoglycerate kinase  60.36 
 
 
391 aa  457  1e-127  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2757  phosphoglycerate kinase  60.36 
 
 
393 aa  457  1e-127  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0655  phosphoglycerate kinase  59.8 
 
 
387 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.729644  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3463  phosphoglycerate kinase  59.59 
 
 
391 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3816  phosphoglycerate kinase  58.78 
 
 
387 aa  454  1.0000000000000001e-126  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.795406  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3538  phosphoglycerate kinase  59.59 
 
 
391 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3657  phosphoglycerate kinase  59.59 
 
 
391 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.546887 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0849  phosphoglycerate kinase  58.78 
 
 
387 aa  454  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05590  phosphoglycerate kinase  59.54 
 
 
386 aa  453  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07190  phosphoglycerate kinase  60.05 
 
 
387 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0852  phosphoglycerate kinase  58.78 
 
 
387 aa  454  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00852625  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1041  phosphoglycerate kinase  58.1 
 
 
394 aa  450  1e-125  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0829  phosphoglycerate kinase  60.36 
 
 
391 aa  448  1e-125  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0435877  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0932  phosphoglycerate kinase  59.08 
 
 
391 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0460  phosphoglycerate kinase  59.8 
 
 
386 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2630  phosphoglycerate kinase  58.27 
 
 
414 aa  445  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.462751  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0554  phosphoglycerate kinase  58.27 
 
 
387 aa  445  1.0000000000000001e-124  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3898  phosphoglycerate kinase  58.02 
 
 
387 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.988788  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0878  phosphoglycerate kinase  59.29 
 
 
391 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0513  phosphoglycerate kinase  58.52 
 
 
387 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>