More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0113 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0113  ATP-binding region ATPase domain protein  100 
 
 
258 aa  526  1e-148  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  unclonable  0.00000000244487  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2198  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 
467 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1955  histidine kinase  36.26 
 
 
357 aa  72.8  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1928  histidine kinase  36.26 
 
 
357 aa  72.8  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2065  putative periplasmic sensor signal transduction histidine kinase, QseC  34.07 
 
 
467 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.278967 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10590  sensory histidine protein kinase  31.82 
 
 
488 aa  68.2  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32760  signal transduction histidine kinase  32.93 
 
 
449 aa  68.2  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0451  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.94 
 
 
488 aa  64.7  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0140  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.07 
 
 
620 aa  65.1  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000754265  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3783  Cache sensor signal transduction histidine kinase  38.16 
 
 
708 aa  64.3  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3106  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 
450 aa  64.3  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.119049  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6516  histidine kinase  25.69 
 
 
429 aa  62.8  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0252048 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2436  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  38.37 
 
 
888 aa  62.4  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.747553 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3794  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 
446 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000335712 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  24.77 
 
 
503 aa  62.4  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1594  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.51 
 
 
523 aa  62.4  0.000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.437577  normal  0.697312 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1565  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.94 
 
 
543 aa  62.4  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.379725  normal  0.789808 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2162  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  24.67 
 
 
745 aa  62  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.894867  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2483  sensor histidine kinase KdpD  38.1 
 
 
885 aa  62  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0250  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 
541 aa  62  0.000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2095  histidine kinase  35.48 
 
 
539 aa  60.5  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3336  two component sensor kinase  24.88 
 
 
473 aa  60.5  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3850  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.03 
 
 
371 aa  60.5  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1931  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.56 
 
 
591 aa  60.5  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7402  histidine kinase  35.8 
 
 
524 aa  61.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.13845  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2605  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  36.9 
 
 
892 aa  61.2  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0207  histidine kinase  23.47 
 
 
566 aa  60.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3845  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.88 
 
 
454 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.340802  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22730  putative two-component sensor  27.07 
 
 
445 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.172157  normal  0.0503129 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1477  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 
511 aa  60.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.635572  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 
612 aa  60.1  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1278  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.43 
 
 
460 aa  60.1  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00211916  normal  0.292462 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2273  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  32.54 
 
 
895 aa  59.7  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 
478 aa  60.1  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.897494  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3675  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.46 
 
 
466 aa  60.1  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1372  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 
510 aa  60.1  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.94557  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.49 
 
 
482 aa  59.7  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0091  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.04 
 
 
413 aa  59.7  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.70693  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3721  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.51 
 
 
481 aa  59.7  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2331  sensor histidine kinase  38.55 
 
 
466 aa  59.7  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02380  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  36.9 
 
 
466 aa  59.3  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.197859 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3766  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.32 
 
 
466 aa  59.7  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.120654 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4607  histidine kinase  35.19 
 
 
696 aa  59.7  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.998833  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3806  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 
533 aa  59.3  0.00000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.576691  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2323  histidine kinase  33.33 
 
 
497 aa  59.3  0.00000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5060  histidine kinase  27.01 
 
 
467 aa  58.9  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0718016  normal  0.845094 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3504  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  25.22 
 
 
745 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.280312  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.9 
 
 
429 aa  58.9  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1902  bacteriophytochrome histidine kinase  24.78 
 
 
745 aa  58.9  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.333534  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1920  putative two-component sensor  27.07 
 
 
445 aa  58.9  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4520  ATPase domain-containing protein  30.86 
 
 
471 aa  58.9  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.320419  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3416  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 
456 aa  58.5  0.00000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3428  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.76 
 
 
513 aa  58.5  0.00000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2713  putative two-component sensor  25.86 
 
 
471 aa  58.5  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0538735  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  33.33 
 
 
537 aa  58.2  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1680  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 
356 aa  58.2  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2385  histidine kinase  22.75 
 
 
442 aa  58.5  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247211  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0527  histidine kinase  26.9 
 
 
425 aa  58.2  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2266  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.7 
 
 
372 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00620911 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3591  sensor histidine kinase  35 
 
 
449 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.148051  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1814  heavy metal sensor kinase  30.08 
 
 
467 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0588654  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0208  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 
379 aa  58.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.47 
 
 
452 aa  58.5  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3401  histidine kinase  26.85 
 
 
361 aa  58.2  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.810153  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6336  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.68 
 
 
450 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.337613  normal  0.66239 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.93 
 
 
1352 aa  58.2  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1803  sensor histidine kinase  36.84 
 
 
450 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.43373  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2033  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.9 
 
 
797 aa  57.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1513  histidine kinase  33.93 
 
 
317 aa  57.4  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4664  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  20.49 
 
 
413 aa  57.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2541  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.42 
 
 
874 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1562  histidine kinase  33.93 
 
 
317 aa  57.4  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.92 
 
 
489 aa  57.4  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0262  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.07 
 
 
523 aa  57.4  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0343  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.12 
 
 
458 aa  57.4  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.769109  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5340  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.01 
 
 
465 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.81326 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3739  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.25 
 
 
492 aa  57.4  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2574  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.51 
 
 
512 aa  57  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0196  histidine kinase  28.71 
 
 
510 aa  57  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.447748  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1481  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  26.16 
 
 
446 aa  57  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0335199  normal  0.0698163 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0903  histidine kinase  34.18 
 
 
472 aa  57  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.442245  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4820  histidine kinase  40.51 
 
 
513 aa  57  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.780698  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3294  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 
432 aa  57.4  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4666  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 
514 aa  57  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.782496  normal  0.233494 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1072  histidine kinase  29.35 
 
 
354 aa  57  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1397  ATP-binding region ATPase domain protein  35.29 
 
 
498 aa  57  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3387  histidine kinase  29.35 
 
 
593 aa  57.4  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.11 
 
 
446 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0126885  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5347  sensory box histidine kinase YycG  24.54 
 
 
613 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000719997  hitchhiker  0.000000000000990225 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 
675 aa  56.6  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.223849 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3537  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 
609 aa  56.6  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1929  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 
594 aa  56.6  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3132  histidine kinase  28.42 
 
 
402 aa  56.6  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.752444  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1247  multisensor signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 
607 aa  56.6  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000186928  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2365  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.18 
 
 
734 aa  56.6  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.656612  hitchhiker  0.0000890263 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1481  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.77 
 
 
418 aa  56.2  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1949  putative 2-component sensor protein  28.18 
 
 
470 aa  56.2  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.610571  normal  0.744525 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0770  histidine kinase  27.49 
 
 
397 aa  56.2  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.102828  normal  0.523628 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 
453 aa  56.2  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1131  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.98 
 
 
760 aa  56.2  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>