More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1561 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1561  cell envelope-related transcriptional attenuator  100 
 
 
387 aa  769    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1774  cell envelope-related transcriptional attenuator  41.18 
 
 
400 aa  282  6.000000000000001e-75  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0243051  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0931  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.37 
 
 
397 aa  228  2e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00105119  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0953  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.24 
 
 
370 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0121722  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0905  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.58 
 
 
388 aa  142  7e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13390  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.36 
 
 
405 aa  109  7.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.557039  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4120  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.42 
 
 
445 aa  103  7e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000955467  unclonable  0.000000000378568 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0893  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.39 
 
 
453 aa  102  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.301121  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0400  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.02 
 
 
308 aa  101  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000257107  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2953  cell envelope-related transcriptional attenuator  30 
 
 
502 aa  99.8  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.873931 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2377  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.81 
 
 
344 aa  99.8  7e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00145979  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3223  cell envelope-like transcriptional attenuator  35.45 
 
 
471 aa  98.2  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1109  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.25 
 
 
481 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0411  cell envelope-like transcriptional attenuator  32.85 
 
 
472 aa  97.4  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.207765 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1138  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.25 
 
 
481 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.441684  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3892  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.37 
 
 
453 aa  97.4  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2873  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.33 
 
 
475 aa  97.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0754  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.46 
 
 
419 aa  96.7  6e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0493984  hitchhiker  0.0069249 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2095  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.68 
 
 
411 aa  95.5  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1005  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.33 
 
 
285 aa  95.5  1e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0727  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.94 
 
 
308 aa  94.7  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0775994  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2366  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.95 
 
 
319 aa  94.4  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000181907  unclonable  0.00000001 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1857  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.36 
 
 
456 aa  94.4  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.046941  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09711  membrane bound transcriptional regulator-like protein  33.71 
 
 
298 aa  94.4  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1572  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.85 
 
 
384 aa  93.6  5e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0072424  normal  0.757675 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4947  membrane-bound transcriptional regulator LytR  31.94 
 
 
304 aa  92  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0889022  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0378  transcriptional regulator  29.91 
 
 
408 aa  92  1e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0016641  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1451  transcription attenuator LytR  31.31 
 
 
327 aa  91.3  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2542  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.51 
 
 
509 aa  91.7  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1423  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.31 
 
 
327 aa  91.3  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.302612  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3735  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.26 
 
 
383 aa  90.5  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5288  transcription antiterminator, LytR family  39.77 
 
 
375 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000327862 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1360  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.59 
 
 
436 aa  90.1  6e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1875  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.96 
 
 
344 aa  90.1  7e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5306  LytR family transcription antiterminator  39.77 
 
 
377 aa  89.4  9e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5047  LytR family transcription antiterminator  39.77 
 
 
375 aa  89  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4877  LytR family transcriptional regulator  39.77 
 
 
375 aa  89  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4892  LytR family transcriptional regulator  39.77 
 
 
375 aa  89  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2679  cell envelope-like transcriptional attenuator  28.45 
 
 
503 aa  89  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5432  LytR family transcription antiterminator  39.77 
 
 
375 aa  89  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5566  membrane-bound transcriptional regulator LytR  28.78 
 
 
304 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5364  transcription antiterminator, LytR family  38.6 
 
 
377 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1641  cell envelope-related function transcriptional attenuator  30.37 
 
 
314 aa  88.6  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1252  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.02 
 
 
403 aa  88.2  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000912522  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1762  cell envelope-like transcriptional attenuator  27.92 
 
 
501 aa  87.8  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.103676  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5640  transcription antiterminator, LytR family  39.18 
 
 
372 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000247251 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3856  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.39 
 
 
451 aa  87  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5319  transcription antiterminator, LytR family  39.18 
 
 
374 aa  87  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3877  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.81 
 
 
497 aa  86.7  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2604  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.85 
 
 
471 aa  86.3  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.22991 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08290  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  28.26 
 
 
443 aa  86.7  7e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.154905  normal  0.235154 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3582  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.2 
 
 
492 aa  86.3  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0961  cell envelope-related function transcriptional attenuator  32.2 
 
 
337 aa  85.5  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.472241  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0932  transcriptional regulator, putative  35.26 
 
 
329 aa  85.1  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2090  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.31 
 
 
417 aa  85.5  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5387  membrane-bound transcriptional regulator LytR  29.72 
 
 
299 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1057  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.95 
 
 
333 aa  85.1  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0371332  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1157  transcriptional regulator  25.07 
 
 
334 aa  85.1  0.000000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000000266671  hitchhiker  6.72858e-19 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1208  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.59 
 
 
330 aa  84.7  0.000000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000721845  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3430  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.33 
 
 
439 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0225853  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2524  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.64 
 
 
492 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5436  membrane-bound transcriptional regulator LytR  28.18 
 
 
302 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1921  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.34 
 
 
406 aa  83.2  0.000000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.116318  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3112  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.15 
 
 
419 aa  82  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132049  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0638  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.77 
 
 
294 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3102  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.71 
 
 
311 aa  82  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01650  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  28 
 
 
512 aa  82  0.00000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.475151  hitchhiker  0.0000000000510123 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4529  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.59 
 
 
365 aa  81.6  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.25457  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1715  transcriptional regulator  27.62 
 
 
374 aa  82  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00565214 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2282  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.64 
 
 
389 aa  81.6  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.072814  hitchhiker  0.000000103578 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5058  membrane-bound transcriptional regulator LytR  29.38 
 
 
304 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5383  membrane-bound transcriptional regulator LytR  25.55 
 
 
302 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4992  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.05 
 
 
374 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20880  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain  27.63 
 
 
296 aa  80.5  0.00000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1973  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.2 
 
 
418 aa  80.1  0.00000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.554316  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5115  membrane-bound transcriptional regulator LytR  25.45 
 
 
303 aa  79  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5506  membrane-bound transcriptional regulator LytR  25.45 
 
 
303 aa  79  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00691653  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0187  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.05 
 
 
563 aa  79.3  0.0000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.234515 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1499  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.5 
 
 
329 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4961  membrane-bound transcriptional regulator LytR  25.45 
 
 
303 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0205697  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1232  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.82 
 
 
377 aa  78.2  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.113674  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2230  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.61 
 
 
417 aa  77  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0308391  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5355  membrane-bound transcriptional regulator LytR  25.09 
 
 
303 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1167  cell envelope-related protein transcriptional attenuator  25 
 
 
417 aa  76.6  0.0000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3243  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.73 
 
 
335 aa  76.6  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3272  membrane-bound transcriptional regulator LytR  30.73 
 
 
310 aa  76.3  0.0000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000512755  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2595  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.54 
 
 
313 aa  75.5  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3385  membrane-bound transcriptional regulator LytR  28.21 
 
 
313 aa  75.9  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0132  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.61 
 
 
426 aa  75.9  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.272824  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2378  cell envelope-related function transcriptional attenuator  32.81 
 
 
437 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0983623  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1965  cell envelope-related transcriptional attenuator  25.5 
 
 
487 aa  75.5  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000312518 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3796  membrane-bound transcriptional regulator LytR  26.85 
 
 
302 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000323774  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1864  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.4 
 
 
391 aa  75.1  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.383316  normal  0.036217 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09330  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain  30.37 
 
 
349 aa  75.1  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2795  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.66 
 
 
424 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000153391  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1838  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.43 
 
 
333 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00343174  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0152  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.56 
 
 
271 aa  74.7  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0762  transcriptional regulator  25.71 
 
 
489 aa  74.7  0.000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.245721  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3783  cell envelope-related transcriptional attenuator  26 
 
 
367 aa  74.3  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.1003  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2090  transcription regulator LytR-like protein  32.41 
 
 
437 aa  74.3  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.853394  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>