135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2944 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2944  hypothetical protein  100 
 
 
90 aa  187  5e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.807996  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2485  Fe(II) trafficking protein YggX  80 
 
 
91 aa  154  5.0000000000000005e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0570791  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2268  hypothetical protein  72.22 
 
 
90 aa  141  3e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2959  hypothetical protein  68.54 
 
 
93 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.269424  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2572  hypothetical protein  68.54 
 
 
93 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2696  hypothetical protein  72.94 
 
 
88 aa  138  3e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.62763 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1524  hypothetical protein  67.42 
 
 
90 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.384209  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2102  hypothetical protein  64.04 
 
 
90 aa  131  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.183711  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2229  hypothetical protein  64.04 
 
 
90 aa  131  3e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2624  hypothetical protein  66.29 
 
 
91 aa  130  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.804415 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0381  hypothetical protein  62.22 
 
 
90 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1511  hypothetical protein  65.17 
 
 
90 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.309754 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1490  hypothetical protein  63.33 
 
 
91 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0380307  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5466  hypothetical protein  63.33 
 
 
91 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5920  hypothetical protein  63.33 
 
 
91 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2157  hypothetical protein  63.33 
 
 
91 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220709  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2175  hypothetical protein  63.33 
 
 
91 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1114  hypothetical protein  63.33 
 
 
91 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.158096  normal  0.927439 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1836  hypothetical protein  62.22 
 
 
91 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.703285  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1752  hypothetical protein  61.11 
 
 
91 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2778  hypothetical protein  61.11 
 
 
91 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2261  hypothetical protein  61.11 
 
 
91 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.283774  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3058  hypothetical protein  61.11 
 
 
91 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.141568  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2644  hypothetical protein  61.11 
 
 
91 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.593  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2700  hypothetical protein  61.11 
 
 
91 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0938348  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1533  hypothetical protein  61.11 
 
 
91 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.795875  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2067  hypothetical protein  62.22 
 
 
91 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3583  hypothetical protein  62.92 
 
 
90 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.507536 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1798  hypothetical protein  59.55 
 
 
90 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.716542  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1142  hypothetical protein  65.88 
 
 
90 aa  125  2.0000000000000002e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1924  hypothetical protein  59.55 
 
 
90 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.441849  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2982  hypothetical protein  62.22 
 
 
90 aa  124  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2194  hypothetical protein  61.11 
 
 
91 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.609831  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1850  Fe(II) trafficking protein YggX  68.18 
 
 
93 aa  124  4.0000000000000003e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.302914  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2071  hypothetical protein  62.5 
 
 
114 aa  124  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.152399  normal  0.926717 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1372  hypothetical protein  57.3 
 
 
91 aa  124  6e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0133  hypothetical protein  61.11 
 
 
109 aa  123  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1222  hypothetical protein  59.55 
 
 
90 aa  122  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0856  hypothetical protein  62.5 
 
 
90 aa  122  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1235  hypothetical protein  63.64 
 
 
91 aa  122  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2423  hypothetical protein  59.55 
 
 
93 aa  122  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1132  hypothetical protein  59.77 
 
 
90 aa  122  2e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0024  hypothetical protein  61.54 
 
 
91 aa  121  3e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.828588  normal  0.104747 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1002  hypothetical protein  59.77 
 
 
90 aa  121  3e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0880728  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2067  hypothetical protein  61.8 
 
 
90 aa  121  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.436295  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2344  hypothetical protein  60.67 
 
 
90 aa  120  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1169  hypothetical protein  62.5 
 
 
91 aa  120  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0980986  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1077  hypothetical protein  62.5 
 
 
91 aa  120  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0121  hypothetical protein  62.5 
 
 
90 aa  120  7e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000208752  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3047  hypothetical protein  64.04 
 
 
90 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.45877  normal  0.0178408 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1263  hypothetical protein  61.63 
 
 
90 aa  119  9.999999999999999e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.339369  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0687  hypothetical protein  60.23 
 
 
91 aa  118  3e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.166712  normal  0.641044 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4642  hypothetical protein  60.67 
 
 
90 aa  116  7.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.451223  hitchhiker  0.0000118597 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1902  hypothetical protein  60 
 
 
89 aa  113  8.999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1891  hypothetical protein  60 
 
 
89 aa  113  8.999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0533  hypothetical protein  57.78 
 
 
90 aa  110  5e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000920147  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01429  hypothetical protein  59.76 
 
 
88 aa  110  5e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.25922  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2491  hypothetical protein  60.23 
 
 
91 aa  110  6e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.427029  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1179  hypothetical protein  59.3 
 
 
92 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000882261  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1250  hypothetical protein  59.3 
 
 
92 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00387926  normal  0.782101 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1180  hypothetical protein  59.3 
 
 
92 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000191738  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1324  hypothetical protein  58.14 
 
 
92 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000513126  normal  0.0116062 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3040  hypothetical protein  58.14 
 
 
92 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000474974  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2701  hypothetical protein  58.14 
 
 
92 aa  108  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0665477  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3054  hypothetical protein  58.14 
 
 
92 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00037558  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3197  hypothetical protein  58.14 
 
 
92 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000564871  normal  0.56493 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1057  hypothetical protein  53.41 
 
 
105 aa  108  3e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.977359  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0938  hypothetical protein  52.81 
 
 
90 aa  107  4.0000000000000004e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0002  hypothetical protein  55.56 
 
 
90 aa  107  7.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000338126  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1107  hypothetical protein  59.3 
 
 
92 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000149514  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3369  hypothetical protein  56.98 
 
 
92 aa  106  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1668  hypothetical protein  52.22 
 
 
91 aa  106  1e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00283  hypothetical protein  56.67 
 
 
90 aa  105  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2699  hypothetical protein  55.68 
 
 
91 aa  105  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000360658  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0075  hypothetical protein  56.82 
 
 
90 aa  105  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.206235  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1218  hypothetical protein  59.3 
 
 
92 aa  105  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000284712  normal  0.540197 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3964  hypothetical protein  53.93 
 
 
90 aa  104  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.82757  normal  0.502915 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2874  hypothetical protein  54.44 
 
 
92 aa  104  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.429816  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002445  hypothetical protein  54.44 
 
 
90 aa  104  4e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000631832  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0336  hypothetical protein  53.33 
 
 
90 aa  103  6e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.11522 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03592  hypothetical protein  55.56 
 
 
90 aa  103  6e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1122  hypothetical protein  55.81 
 
 
92 aa  102  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000145882  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1443  hypothetical protein  50 
 
 
92 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0818  hypothetical protein  51.11 
 
 
90 aa  102  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0152  hypothetical protein  51.11 
 
 
90 aa  102  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.957602  hitchhiker  0.0000034562 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0819  hypothetical protein  51.11 
 
 
90 aa  102  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.668361  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1544  hypothetical protein  52.33 
 
 
89 aa  101  4e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.251513  normal  0.581544 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3367  hypothetical protein  52.22 
 
 
90 aa  101  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0165991 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3408  hypothetical protein  51.69 
 
 
90 aa  101  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.070297  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0881  hypothetical protein  51.69 
 
 
90 aa  100  6e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4044  hypothetical protein  52.22 
 
 
90 aa  100  6e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.846372  normal  0.136015 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3027  Fe(II) trafficking protein YggX  51.69 
 
 
90 aa  100  6e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0733  Protein-tyrosine-phosphatase  51.11 
 
 
91 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3207  Fe(II) trafficking protein YggX  50.56 
 
 
90 aa  99  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.261297  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02755  hypothetical protein  51.11 
 
 
91 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.115186  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68000  hypothetical protein  52.81 
 
 
90 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0291982  normal  0.0102639 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5885  hypothetical protein  52.81 
 
 
90 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3308  hypothetical protein  51.11 
 
 
91 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0752  hypothetical protein  51.11 
 
 
91 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.493276  normal  0.0113195 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3105  hypothetical protein  51.11 
 
 
91 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00252238 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>