88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2435 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2435  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  100 
 
 
113 aa  226  6e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.250291  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0832  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  66.96 
 
 
113 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.737175  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0821  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  45.54 
 
 
117 aa  113  1.0000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1879  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  35.34 
 
 
115 aa  61.6  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2143  PemK family protein  35.09 
 
 
120 aa  61.2  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2105  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  35.09 
 
 
120 aa  61.2  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2894  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  33.62 
 
 
116 aa  60.8  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.219474  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2605  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  37.21 
 
 
109 aa  59.3  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2165  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  35.34 
 
 
116 aa  58.5  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000312533  decreased coverage  0.0000125897 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1681  PemK family transcriptional regulator  34.21 
 
 
120 aa  58.5  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1348  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  34.48 
 
 
116 aa  58.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000815798  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0309  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.03 
 
 
116 aa  58.2  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1185  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  36.61 
 
 
106 aa  57.4  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.660905 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1737  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  35.71 
 
 
115 aa  57.4  0.00000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0291  PemK family protein  32.73 
 
 
117 aa  56.2  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0212  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  33.62 
 
 
116 aa  55.5  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.200733  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1093  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  33.62 
 
 
116 aa  55.5  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3743  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.48 
 
 
116 aa  55.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000296135  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12814  hypothetical protein  32.2 
 
 
118 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000412903  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01740  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  33.33 
 
 
116 aa  55.1  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0256  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.03 
 
 
124 aa  54.7  0.0000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000117261  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1424  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  35.63 
 
 
88 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.905577  normal  0.0149694 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4547  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.74 
 
 
112 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal  0.653702 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0024  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  37.5 
 
 
107 aa  54.3  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0286  PemK family protein  31.82 
 
 
117 aa  54.3  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.2389  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0269  transcriptional regulator, PemK family  32.76 
 
 
116 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.76825  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5056  transcriptional regulator, PemK family  32.76 
 
 
116 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.213232  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0232  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.76 
 
 
116 aa  54.7  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2924  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.76 
 
 
116 aa  54.3  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.13253  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0906  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  34.26 
 
 
133 aa  54.3  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000297621  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2699  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.76 
 
 
116 aa  53.5  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0038479  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2503  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  34.58 
 
 
109 aa  53.5  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0118079  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0240  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.76 
 
 
116 aa  53.5  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0228  pemK-like protein  32.76 
 
 
116 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0288  transcriptional regulator, PemK family  32.76 
 
 
116 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0226  pemK-like protein  32.76 
 
 
116 aa  53.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0266  transcriptional regulator, PemK family  32.76 
 
 
116 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0254  PemK family transcriptional regulator  32.76 
 
 
116 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.725358  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0240  PemK family transcriptional regulator  32.76 
 
 
116 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0745  growth inhibitor, PemK-like protein  28.18 
 
 
110 aa  52.8  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0274  PemK family transcriptional regulator  32.76 
 
 
116 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2312  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.51 
 
 
117 aa  52  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.113933  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0966  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.03 
 
 
116 aa  52  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0359  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.76 
 
 
116 aa  52  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1876  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  28.95 
 
 
109 aa  52.8  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36390  PemK-like protein  33.63 
 
 
107 aa  51.6  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5446  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  33.33 
 
 
123 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3378  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  34.91 
 
 
109 aa  50.8  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1901  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.93 
 
 
147 aa  50.8  0.000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00690873  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5889  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  33.33 
 
 
119 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000397508 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4757  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  36.47 
 
 
115 aa  50.1  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.424428  normal  0.0249219 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1194  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.17 
 
 
107 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.300764 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2436  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.17 
 
 
128 aa  49.7  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2470  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.14 
 
 
107 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3399  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.43 
 
 
117 aa  49.3  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.398521  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4949  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.71 
 
 
123 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2247  PemK family protein  30.91 
 
 
109 aa  48.5  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.191111  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3432  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  36.36 
 
 
107 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.328509  normal  0.0986406 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6740  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  35.48 
 
 
106 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1640  toxin-antitoxin addiction module toxin component MazF (an endoRNAse)  33.93 
 
 
118 aa  48.9  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0998854  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7291  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.17 
 
 
123 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.141248  normal 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0033  PemK-like protein  31.82 
 
 
110 aa  48.1  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5455  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  33.33 
 
 
107 aa  47  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.724766  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0346  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.25 
 
 
199 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0974  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  29.09 
 
 
116 aa  46.2  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.836231  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2715  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  27.43 
 
 
119 aa  46.6  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0883325 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0352  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  34.18 
 
 
97 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1071  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  37.5 
 
 
121 aa  46.2  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2646  MazE/toxin transcriptional modulator MazF  32.97 
 
 
114 aa  45.1  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0795384  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2564  PemK family protein  31.46 
 
 
112 aa  44.7  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1811  toxin-antitoxin addiction module toxin component MazF (an endoRNAse)  32.74 
 
 
121 aa  44.7  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0166728  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1144  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  35.59 
 
 
115 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1011  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  25.66 
 
 
107 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1971  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  40.43 
 
 
114 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2437  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  27.52 
 
 
107 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5124  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  34.15 
 
 
108 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.067207 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0164  stable plasmid inheritance protein PemK  33.7 
 
 
121 aa  41.6  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000268925  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2716  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.91 
 
 
111 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3598  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  34.52 
 
 
108 aa  41.6  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1319  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.93 
 
 
117 aa  41.6  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00212253  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5408  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  28.18 
 
 
119 aa  41.6  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.414606  normal 
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4177  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.03 
 
 
107 aa  41.2  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.150234  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0586  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.9 
 
 
114 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.354124  normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4955  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  22.41 
 
 
118 aa  40.8  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1718  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  35.48 
 
 
118 aa  40.8  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341117  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0041  mRNA endonuclease-like protein PemK  29.81 
 
 
105 aa  40.8  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1052  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  25.89 
 
 
119 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248436  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0676  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  43.64 
 
 
111 aa  40  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.91371  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>