16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2750 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2750  hypothetical protein  100 
 
 		 347 aa  696    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.612222  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4390  hypothetical protein  42.77 
 
 		 291 aa  223  4e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3347  hypothetical protein  45.25 
 
 		 291 aa  205  1e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.444208  normal  0.658581 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0295  hypothetical protein  41.59 
 
 		 337 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8996  hypothetical protein  43.97 
 
 		 285 aa  199  6e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0300  hypothetical protein  34.71 
 
 		 311 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0160  hypothetical protein  30.9 
 
 		 329 aa  122  9e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.261624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0169  hypothetical protein  30.97 
 
 		 279 aa  116  6e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000153902 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0098  hypothetical protein  30.46 
 
 		 276 aa  100  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.364761 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7206  hypothetical protein  29.47 
 
 		 276 aa  95.1  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0284604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5980  hypothetical protein  27.48 
 
 		 304 aa  92.4  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.476931 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37780  hypothetical protein  27.13 
 
 		 302 aa  82.8  0.000000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.245305 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6841  hypothetical protein  29.78 
 
 		 293 aa  81.3  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0628  hypothetical protein  25.55 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0418  hypothetical protein  24.78 
 
 		 317 aa  61.6  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01940  hypothetical protein  26.01 
 
 		 300 aa  51.6  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>