More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1447 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1447  ABC-type multidrug transport system ATPase component  100 
 
 
329 aa  654    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.767356  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4171  ABC transporter related protein  68.4 
 
 
326 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3883  ABC transporter related  57.01 
 
 
321 aa  344  1e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.837023  normal  0.151879 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0095  ABC transporter related  56.85 
 
 
333 aa  317  2e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4201  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  58.46 
 
 
323 aa  317  2e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3136  ABC transporter related protein  57.45 
 
 
332 aa  310  2.9999999999999997e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.526568  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1776  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  52.47 
 
 
319 aa  300  3e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.179608 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1447  ABC transporter related protein  58.1 
 
 
319 aa  299  5e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.54316  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0785  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  48.92 
 
 
324 aa  295  7e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3246  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  47.04 
 
 
321 aa  284  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.328861 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0120  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  51.68 
 
 
338 aa  283  4.0000000000000003e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0230448  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1532  ABC transporter related protein  49.39 
 
 
333 aa  280  2e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2410  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  48.75 
 
 
320 aa  270  4e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1122  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.77 
 
 
320 aa  249  4e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1957  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  46.73 
 
 
326 aa  248  9e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000359693  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0061  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.11 
 
 
338 aa  246  4.9999999999999997e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00188149  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0967  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.84 
 
 
348 aa  243  1.9999999999999999e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2158  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.34 
 
 
325 aa  238  8e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0364  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.01 
 
 
334 aa  238  1e-61  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1381  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.23 
 
 
327 aa  237  2e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000774362  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0867  hypothetical protein  45.63 
 
 
341 aa  237  2e-61  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.229197 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.69 
 
 
327 aa  235  9e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.154202  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6125  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.3 
 
 
403 aa  230  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.555099  normal  0.897652 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2865  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.02 
 
 
333 aa  228  1e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0475  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.62 
 
 
333 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0408472 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2408  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.26 
 
 
325 aa  225  8e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000647943  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0665  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.59 
 
 
341 aa  224  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5104  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.97 
 
 
324 aa  224  1e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0010745  normal  0.559357 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39000  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  41.67 
 
 
322 aa  224  2e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.447872 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06461  putative multidrug efflux ABC transporter  40.99 
 
 
337 aa  224  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.645354 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.01 
 
 
339 aa  224  2e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3573  ABC transporter, ATP-binding protein  36.78 
 
 
330 aa  223  3e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.366392  normal  0.0689174 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4160  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.25 
 
 
339 aa  223  3e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.144366 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2562  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.31 
 
 
328 aa  223  4e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.518295 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1352  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.1 
 
 
331 aa  222  6e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.467202  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2039  ABC transporter-like protein protein  38.32 
 
 
339 aa  222  8e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0036  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.88 
 
 
325 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.81 
 
 
322 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1167  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.97 
 
 
324 aa  220  3e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1594  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.19 
 
 
323 aa  220  3e-56  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.658594  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1526  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.41 
 
 
330 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00601366  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3548  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.19 
 
 
335 aa  219  5e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.381902 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0560  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.05 
 
 
324 aa  218  1e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0537  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.67 
 
 
321 aa  217  2e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708923  hitchhiker  0.0000144488 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3407  ABC transporter related protein  55.31 
 
 
246 aa  218  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23251  normal  0.480251 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.29 
 
 
323 aa  217  2e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2587  ABC transporter related  40.52 
 
 
339 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5717  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.56 
 
 
332 aa  217  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3519  ABC transporter related  40.52 
 
 
339 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0191  ABC transporter-like  39.31 
 
 
339 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0494849 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0783  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.38 
 
 
324 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0222  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  38.22 
 
 
330 aa  216  5e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.834743  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1208  ABC transporter related  39.76 
 
 
339 aa  216  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.697219  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1840  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.56 
 
 
322 aa  216  5.9999999999999996e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1780  multidrug ABC transporter  39.67 
 
 
337 aa  215  8e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1529  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  39.06 
 
 
328 aa  215  9e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.113333 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0919  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.23 
 
 
342 aa  214  9.999999999999999e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05031  putative multidrug efflux ABC transporter  39.34 
 
 
337 aa  214  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.123969 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1343  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.66 
 
 
411 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.557493  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0452  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.56 
 
 
309 aa  213  3.9999999999999995e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000639628  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1482  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.81 
 
 
344 aa  213  4.9999999999999996e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000625937  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0043  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.76 
 
 
337 aa  212  7.999999999999999e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1472  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  41.72 
 
 
371 aa  212  9e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.487769  normal  0.269585 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1503  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.61 
 
 
343 aa  212  9e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.59692  normal  0.310998 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30720  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  39.56 
 
 
353 aa  211  1e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.933735  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2297  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  41.98 
 
 
325 aa  211  1e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.422878  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2101  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.77 
 
 
335 aa  211  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2148  ATPase  39.21 
 
 
340 aa  211  2e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.96125  normal  0.315511 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3717  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.82 
 
 
380 aa  210  2e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0867076  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4872  ABC transporter related  38.68 
 
 
339 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0040  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.26 
 
 
321 aa  211  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4189  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.19 
 
 
307 aa  210  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22040  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  40.25 
 
 
345 aa  210  3e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0339  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.93 
 
 
351 aa  210  3e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.261155  hitchhiker  0.00121447 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04471  putative multidrug efflux ABC transporter  40.52 
 
 
337 aa  210  3e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.797798  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1698  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.27 
 
 
338 aa  209  4e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8157  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.99 
 
 
314 aa  209  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0498  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.94 
 
 
360 aa  209  5e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5082  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.68 
 
 
314 aa  209  5e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.682082 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07240  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  38.18 
 
 
332 aa  209  6e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.44685 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0379  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.41 
 
 
321 aa  209  7e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0686  ABC transporter, ATP-binding protein  38.34 
 
 
345 aa  208  9e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.541745  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1123  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.58 
 
 
331 aa  207  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.716234  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.94 
 
 
317 aa  207  2e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3923  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.94 
 
 
342 aa  206  3e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.011393  normal  0.0153683 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2020  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  40.78 
 
 
359 aa  207  3e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197661  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1742  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  41.14 
 
 
319 aa  207  3e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0557624  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  34.59 
 
 
327 aa  206  4e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1751  ATPase  40.18 
 
 
337 aa  206  5e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.253958  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1019  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.13 
 
 
328 aa  206  5e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35766  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1508  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.64 
 
 
323 aa  206  5e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4022  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.8 
 
 
326 aa  206  6e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.393228  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0243  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.06 
 
 
316 aa  206  6e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0708774  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3915  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  40.48 
 
 
327 aa  205  7e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4032  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.5 
 
 
338 aa  205  7e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.631221  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05041  putative multidrug efflux ABC transporter  34.88 
 
 
338 aa  205  7e-52  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.288968  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05111  putative multidrug efflux ABC transporter  35.19 
 
 
338 aa  205  7e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4093  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.96 
 
 
312 aa  205  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.132087  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4080  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.18 
 
 
350 aa  204  1e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.754321  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3104  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.67 
 
 
323 aa  204  1e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.54604  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>