182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_R0033 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_R0044  tRNA-Pro  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0033  tRNA-Pro  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.216286  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0034  tRNA-Pro  98.65 
 
 
74 bp  139  1e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.199678  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0033  tRNA-Pro  98.65 
 
 
74 bp  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00710383  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0016  tRNA-Pro  98.65 
 
 
74 bp  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0015  tRNA-Pro  98.65 
 
 
74 bp  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0316324  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0004  tRNA-Pro  97.3 
 
 
74 bp  131  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.14749  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0020  tRNA-Pro  97.3 
 
 
77 bp  131  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAProVIMSS1309349  tRNA-Pro  97.3 
 
 
74 bp  131  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.521011 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAProVIMSS1309076  tRNA-Pro  97.3 
 
 
74 bp  131  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0047  tRNA-Pro  97.3 
 
 
74 bp  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAProVIMSS1309142  tRNA-Pro  97.3 
 
 
74 bp  131  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.165714  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAProVIMSS1309152  tRNA-Pro  97.3 
 
 
74 bp  131  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0034  tRNA-Pro  95.95 
 
 
74 bp  123  6e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.870471  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0019  tRNA-Pro  95.95 
 
 
74 bp  123  6e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000000100673  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0017  tRNA-Pro  95.95 
 
 
74 bp  123  6e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAProVIMSS1309195  tRNA-Pro  95.95 
 
 
74 bp  123  6e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0101473 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAProVIMSS1309295  tRNA-Pro  95.95 
 
 
74 bp  123  6e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.339192 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0005  tRNA-Pro  90 
 
 
77 bp  83.8  0.000000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0005  tRNA-Pro  89.39 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1637  tRNA-Pro  88.52 
 
 
74 bp  65.9  0.000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.590858  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0057  tRNA-Pro  88.52 
 
 
74 bp  65.9  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0026  tRNA-Pro  86.76 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0027  tRNA-Pro  88.14 
 
 
74 bp  61.9  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.719402  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0052  tRNA-Pro  88.14 
 
 
74 bp  61.9  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0014  tRNA-Pro  88.14 
 
 
74 bp  61.9  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.267148 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0019  tRNA-Pro  88.14 
 
 
74 bp  61.9  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0007  tRNA-Pro  88.14 
 
 
74 bp  61.9  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0018  tRNA-Pro  88.14 
 
 
74 bp  61.9  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.471036  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0032  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0025005  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0063  tRNA-Pro  85.29 
 
 
77 bp  56  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305975  normal  0.0658798 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0049  tRNA-Pro  87.5 
 
 
77 bp  56  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0541281  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0064  tRNA-Pro  85.29 
 
 
77 bp  56  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.713183  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0049  tRNA-Pro  87.5 
 
 
77 bp  56  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.925267  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0009  tRNA-Pro  85.29 
 
 
77 bp  56  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0093  tRNA-Pro  87.5 
 
 
77 bp  56  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0049  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  56  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.106855  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0067  tRNA-Pro  85.29 
 
 
77 bp  56  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.750062  normal  0.274534 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0001  tRNA-Pro  85.29 
 
 
77 bp  56  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0207392  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0025  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  56  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.102908  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0037  tRNA-Pro  85.29 
 
 
77 bp  56  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201404  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0023  tRNA-Pro  100 
 
 
74 bp  56  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal  0.736236 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0066  tRNA-Pro  85.29 
 
 
77 bp  56  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.645419 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0049  tRNA-Pro  85.29 
 
 
77 bp  56  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.241293 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t10  tRNA-Pro  96.77 
 
 
74 bp  54  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0829003  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0086  tRNA-Asn  96.77 
 
 
84 bp  54  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36270  tRNA-Pro  85.07 
 
 
74 bp  54  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.973598 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0019  tRNA-Pro  96.77 
 
 
77 bp  54  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0076  tRNA-Pro  96.77 
 
 
78 bp  54  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.77205  normal  0.0987165 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0087  tRNA-Pro  96.77 
 
 
78 bp  54  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0037  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  54  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.217744 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA40  tRNA-Pro  96.77 
 
 
78 bp  54  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0135525  normal  0.0275356 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0774  tRNA-Pro  96.77 
 
 
79 bp  54  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.631  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0011  tRNA-Pro  96.77 
 
 
77 bp  54  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.11857  normal  0.0548204 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0048  tRNA-Pro  96.77 
 
 
77 bp  54  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.255642  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Pro-2  tRNA-Pro  96.67 
 
 
77 bp  52  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.043428  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2326  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.261307  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0053  tRNA-Pro  83.78 
 
 
77 bp  52  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000194568  unclonable  8.89969e-24 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0022  tRNA-Pro  96.67 
 
 
77 bp  52  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000263342  normal  0.454307 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0022  tRNA-Pro  83.78 
 
 
77 bp  52  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.367488  normal  0.0190369 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0019  tRNA-Pro  83.78 
 
 
77 bp  52  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000000286409  normal  0.184276 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0036  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0014  tRNA-Pro  83.78 
 
 
77 bp  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000112048 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  96.55 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Pro-2  tRNA-Pro  96.55 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0041  tRNA-Pro  96.55 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0647014 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0020  tRNA-Pro  100 
 
 
74 bp  50.1  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0027  tRNA-Pro  96.55 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00912814 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0034  tRNA-Pro  96.55 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0051  tRNA-Pro  96.55 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.659123  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0013  tRNA-Pro  85.96 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000629989  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0023  tRNA-Pro  96.55 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0002  tRNA-Pro  96.55 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.815773  normal  0.273413 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0023  tRNA-Pro  96.55 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000446356  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0033  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.981305 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0020  tRNA-Pro  100 
 
 
74 bp  50.1  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00576144  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0025  tRNA-Pro  100 
 
 
74 bp  50.1  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.349516 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2606  tRNA-Pro  96.55 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.834732  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0063  tRNA-Pro  96.55 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt38  tRNA-Pro  96.43 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt38  tRNA-Pro  96.43 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0067  tRNA-Pro  96.43 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.912761 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0018  tRNA-Pro  96.43 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.161643  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0009  tRNA-Pro  96.43 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0009  tRNA-Pro  96.43 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.687606  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0029  tRNA-Pro  96.43 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.115718 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0053  tRNA-Pro  100 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00100217  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1470  tRNA-Pro  96.43 
 
 
79 bp  48.1  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.203252  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0044  tRNA-Pro  96.43 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.408268  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28740  tRNA-Pro  96.43 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000230263  hitchhiker  0.00000000587474 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0051  tRNA-Pro  96.43 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60200  tRNA-Pro  96.43 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0046  tRNA-Pro  96.43 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0243465 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0012  tRNA-Pro  96.43 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.488167  normal  0.183255 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0009  tRNA-Pro  96.43 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.565399  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0060  tRNA-Pro  96.43 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.108577  normal  0.0545385 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2512  tRNA-Pro  96.43 
 
 
79 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.899251  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0008  tRNA-Pro  96.43 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0008  tRNA-Pro  85 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.382627 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0026  tRNA-Pro  96.43 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>