18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4892 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4892  transposase  100 
 
 
101 aa  203  7e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1335  transposase  76.92 
 
 
71 aa  101  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.499821  normal  0.75872 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5336  Transposase and inactivated derivatives-like protein  36.36 
 
 
318 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.904971  normal  0.192286 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2468  transposase  38.54 
 
 
120 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0632  transposase  64.44 
 
 
66 aa  60.5  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.777589  hitchhiker  0.00697344 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0634  transposase  34.38 
 
 
126 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000000359175  normal  0.423888 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5259  transposase  34.38 
 
 
126 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00757713  normal  0.158269 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5112  transposase  34.38 
 
 
126 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.483905 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3299  transposase  34.38 
 
 
126 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.161029  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3019  transposase  34.38 
 
 
126 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.935123  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1767  transposase  34.38 
 
 
126 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.676201 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1182  transposase  34.38 
 
 
126 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0591  transposase  34.38 
 
 
126 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.2665  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5177  Transposase and inactivated derivatives-like protein  34.38 
 
 
262 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.169691  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1155  ISSpo6, transposase orf A  28.12 
 
 
125 aa  40  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4014  ISSpo6, transposase orf A  28.12 
 
 
125 aa  40  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3438  ISSpo6, transposase orf A  28.12 
 
 
125 aa  40  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1189  ISSpo6, transposase orf A  28.12 
 
 
125 aa  40  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>