12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4670 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4670  hypothetical protein  100 
 
 
427 aa  853    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.127337  normal  0.151455 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2404  FHA domain-containing protein  51.82 
 
 
489 aa  350  2e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210357  hitchhiker  0.0000326037 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0549  hypothetical protein  46.94 
 
 
501 aa  345  7e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0405  hypothetical protein  53.62 
 
 
507 aa  345  8.999999999999999e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.690282 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4672  hypothetical protein  48.31 
 
 
796 aa  339  4e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2246  hypothetical protein  46.63 
 
 
479 aa  330  3e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.48024 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2184  FHA domain-containing protein  46.37 
 
 
479 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2050  hypothetical protein  43.79 
 
 
487 aa  291  1e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0330  hypothetical protein  28.16 
 
 
435 aa  140  3.9999999999999997e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0586242  normal  0.17839 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1996  hypothetical protein  27.61 
 
 
464 aa  130  4.0000000000000003e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.339818  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23491  hypothetical protein  27.69 
 
 
480 aa  109  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.425384 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3300  hypothetical protein  24.64 
 
 
272 aa  73.9  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.765579 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>