15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4541 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0051  hypothetical protein  100 
 
 
59 aa  122  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0112  hypothetical protein  100 
 
 
59 aa  122  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.231935  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1200  hypothetical protein  100 
 
 
59 aa  122  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1222  hypothetical protein  100 
 
 
59 aa  122  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0799625  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4541  hypothetical protein  100 
 
 
59 aa  122  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.48654  normal  0.235257 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4828  hypothetical protein  100 
 
 
59 aa  122  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00539737  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0795  IS1 transposase  40 
 
 
321 aa  41.2  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.419049  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1101  insertion element protein  49.02 
 
 
108 aa  41.2  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.684255  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3317  hypothetical protein  48.57 
 
 
469 aa  40.8  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.540223  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3693  IS1 transposase  40.91 
 
 
229 aa  40.8  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00714444  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1444  putative transposase  46.15 
 
 
108 aa  40.4  0.009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.663333 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0265  IS1 transposase  43.59 
 
 
233 aa  40  0.01  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.878281 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0700  IS1 transposase  43.59 
 
 
233 aa  40  0.01  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1525  IS1 transposase  43.59 
 
 
233 aa  40  0.01  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1938  IS1 transposase  43.59 
 
 
233 aa  40  0.01  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>