13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3988 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_3988    100 
 
 		 348 bp  690    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.221865  normal  0.705684 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4778  IS4 family transposase  92.5 
 
 		 150 bp  167  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.140721 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1150    87.25 
 
 		 660 bp  145  9e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.37378  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2975    87.16 
 
 		 716 bp  143  3.9999999999999997e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.569025  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0280    87.77 
 
 		 430 bp  141  1e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0110    85.71 
 
 		 661 bp  131  1.0000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.456103  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2368    85.11 
 
 		 687 bp  113  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2117    84.62 
 
 		 437 bp  109  5e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00222872  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1511    85.27 
 
 		 743 bp  105  8e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0271821  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2988    83.78 
 
 		 726 bp  103  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1517    86.11 
 
 		 228 bp  95.6  8e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000430883  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2576  transposase IS4  82.71 
 
 		 1320 bp  81.8  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0273  transposase IS4  89.29 
 
 		 171 bp  63.9  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>