20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3401 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3401  hypothetical protein  100 
 
 
215 aa  448  1e-125  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.184425 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2244  hypothetical protein  66.35 
 
 
215 aa  311  3.9999999999999997e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.165984  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4860  hypothetical protein  63.51 
 
 
218 aa  290  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.766899 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4491  hypothetical protein  44.55 
 
 
218 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4427  hypothetical protein  44.55 
 
 
218 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2255  hypothetical protein  38.5 
 
 
217 aa  172  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000606865  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4108  hypothetical protein  39.81 
 
 
214 aa  167  1e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.485946  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2583  hypothetical protein  39.13 
 
 
210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11761  hypothetical protein  36.21 
 
 
228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.162957 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13851  hypothetical protein  34.3 
 
 
224 aa  119  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.755223 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0943  hypothetical protein  33.52 
 
 
224 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0171975  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18031  hypothetical protein  32.39 
 
 
219 aa  115  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1820  hypothetical protein  31.44 
 
 
221 aa  112  4.0000000000000004e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0835  hypothetical protein  32.3 
 
 
222 aa  103  2e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13711  hypothetical protein  31.13 
 
 
217 aa  102  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.108275  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13621  hypothetical protein  29.72 
 
 
217 aa  101  9e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13411  hypothetical protein  29.55 
 
 
214 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.656438  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1270  hypothetical protein  27.36 
 
 
218 aa  92.4  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.102394  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2442  hypothetical protein  22.96 
 
 
208 aa  47.8  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000422697  normal  0.651442 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2168  hypothetical protein  23.83 
 
 
215 aa  46.2  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0018571  normal  0.1932 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>