16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3366 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3366  hypothetical protein  100 
 
 
87 aa  179  2e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.504831  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1241  hypothetical protein  58.97 
 
 
83 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1271  hypothetical protein  58.97 
 
 
83 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00344296  hitchhiker  0.00936719 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2102  hypothetical protein  58.44 
 
 
83 aa  103  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000872957 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0454  hypothetical protein  57.32 
 
 
91 aa  102  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.28328  normal  0.117172 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3402  hypothetical protein  55.13 
 
 
87 aa  96.3  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3677  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 
1448 aa  59.3  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114945  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0542  TPR repeat-containing protein  40.58 
 
 
994 aa  58.9  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.397005  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0209  Tetratricopeptide domain protein  35.44 
 
 
552 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000260586 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4136  Tetratricopeptide domain protein  35.62 
 
 
1219 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4460  TPR repeat-containing protein  32.97 
 
 
1247 aa  46.2  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0317978  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  38.16 
 
 
1507 aa  44.7  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2481  TPR repeat-containing protein  35.16 
 
 
1321 aa  44.7  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.834883  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4959  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 
1544 aa  43.5  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117684  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0447  TPR repeat-containing protein  26.76 
 
 
129 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0460  hypothetical protein  26.76 
 
 
129 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.119748  normal  0.060469 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>