152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0803 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0803  hypothetical protein  100 
 
 
634 aa  1249    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.165447  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  40.28 
 
 
1363 aa  157  5.0000000000000005e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  32.74 
 
 
595 aa  148  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  30.14 
 
 
946 aa  82.4  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  30.43 
 
 
1400 aa  72.8  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  28.1 
 
 
4334 aa  68.2  0.0000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1247  Hemolysin-type calcium-binding region  28.39 
 
 
965 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06445  bifunctional hemolysin-adenylate cyclase  26.57 
 
 
860 aa  62.8  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1512  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  25.91 
 
 
2107 aa  62.8  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.821841  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  27.73 
 
 
1279 aa  60.1  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  26.88 
 
 
556 aa  59.7  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  25.84 
 
 
1415 aa  59.7  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.46 
 
 
588 aa  59.3  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4929  hemolysin-type calcium-binding region  26.17 
 
 
2097 aa  58.2  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  31.49 
 
 
2105 aa  58.2  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1355  hemolysin-type calcium-binding region  26.01 
 
 
623 aa  57.4  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.530325  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5278  peptidase domain-containing protein  26.18 
 
 
1112 aa  57.4  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  32.8 
 
 
1544 aa  57  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.31 
 
 
1795 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1879  Hemolysin-type calcium-binding region  27.27 
 
 
2836 aa  55.5  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  29.57 
 
 
615 aa  55.5  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  37.74 
 
 
1197 aa  55.1  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0360  hemolysin-type calcium-binding region  35.48 
 
 
243 aa  55.1  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.624774 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0262  Hemolysin-type calcium-binding region  37.5 
 
 
729 aa  54.3  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2777  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.34 
 
 
1372 aa  54.3  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.878054  decreased coverage  0.00575711 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.5 
 
 
2678 aa  54.3  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.21 
 
 
1884 aa  54.3  0.000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  36.79 
 
 
526 aa  53.9  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3993  hemolysin-type calcium-binding protein  26.19 
 
 
1112 aa  53.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.515402  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  26.82 
 
 
2467 aa  53.5  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  35.67 
 
 
1895 aa  53.1  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  24.2 
 
 
2807 aa  52.8  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  42 
 
 
1532 aa  52.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7966  Hemolysin-type calcium-binding region  33.15 
 
 
341 aa  53.1  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  28.49 
 
 
1499 aa  52  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  34.06 
 
 
1424 aa  52.4  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  26.4 
 
 
1079 aa  52  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.86 
 
 
2346 aa  51.6  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0991  hypothetical protein  41.18 
 
 
679 aa  51.6  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  36.64 
 
 
3954 aa  51.6  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  25.68 
 
 
2911 aa  52  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  24.84 
 
 
2198 aa  51.2  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  33.96 
 
 
421 aa  51.2  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0274  Hemolysin-type calcium-binding region  38.95 
 
 
232 aa  51.2  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  40.78 
 
 
2667 aa  50.8  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3435  hemolysin-type calcium-binding region  34.97 
 
 
219 aa  50.8  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489484  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1979  Animal heme peroxidase  25.98 
 
 
3587 aa  50.8  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3509  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  39 
 
 
202 aa  50.4  0.00009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  32.48 
 
 
260 aa  50.4  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3154  hemolysin-type calcium-binding region  39 
 
 
202 aa  50.4  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0996816 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1113  hemolysin-type calcium-binding region; RTX toxin  38.61 
 
 
437 aa  50.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1919  hypothetical protein  39.77 
 
 
1526 aa  50.1  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.369591  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0488  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.47 
 
 
577 aa  50.4  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.718847  normal  0.491604 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  27.13 
 
 
2954 aa  50.1  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2775  hemolysin-type calcium-binding region  40.59 
 
 
437 aa  50.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.256809  normal  0.811903 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4711  putative secreted calcium-binding protein  31.68 
 
 
219 aa  50.4  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.779916  normal  0.14825 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  38.24 
 
 
1534 aa  50.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  36.28 
 
 
1164 aa  50.1  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  42.17 
 
 
1156 aa  49.7  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1599  hemolysin-type calcium-binding region  36.04 
 
 
303 aa  49.3  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0042965  normal  0.464742 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2793  Hemolysin-type calcium-binding region  32.47 
 
 
361 aa  49.7  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0234899  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3007  hemolysin-type calcium-binding region  31.16 
 
 
363 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.448328  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1592  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  25.25 
 
 
1789 aa  49.3  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0018  RTX C- domain protein  38.53 
 
 
998 aa  49.7  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1895  hypothetical protein  32.9 
 
 
850 aa  49.3  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0996991 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2570  hemolysin-type calcium-binding region  32.47 
 
 
361 aa  49.7  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.804479  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  35.71 
 
 
795 aa  48.9  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  30.8 
 
 
833 aa  48.9  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.08 
 
 
3427 aa  48.9  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  27.48 
 
 
485 aa  48.5  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1441  Ig family protein  27.99 
 
 
2245 aa  48.9  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.195412  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1662  heme peroxidase  25.29 
 
 
3587 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0158  Hemolysin-type calcium-binding protein  25.52 
 
 
1145 aa  48.5  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2502  Hemolysin-type calcium-binding region  28.92 
 
 
361 aa  48.1  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263018  normal  0.592505 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0263  hypothetical protein  35.79 
 
 
742 aa  48.1  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  37.35 
 
 
460 aa  48.1  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  26.88 
 
 
4800 aa  48.1  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  38.64 
 
 
5839 aa  48.1  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2776  hemolysin-type calcium-binding toxin  39.6 
 
 
280 aa  48.1  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.784877 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  34.45 
 
 
4798 aa  47.8  0.0006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0424  hemolysin-type calcium-binding region  37.36 
 
 
1017 aa  47.8  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316008  normal  0.221114 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0797  hypothetical protein  33.71 
 
 
300 aa  47.8  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.141041  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1995  Hemolysin-type calcium-binding region  27.6 
 
 
257 aa  47.8  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0203272  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0419  hemolysin-type calcium-binding region  37.36 
 
 
1022 aa  47.4  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13810  Alginate lyase  35.87 
 
 
417 aa  47.4  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  26.31 
 
 
824 aa  47.8  0.0007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06446  hypothetical protein  41.49 
 
 
959 aa  47.8  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1963  hypothetical protein  31.82 
 
 
1306 aa  47.4  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  40 
 
 
980 aa  47.8  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  27.13 
 
 
2689 aa  47.4  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0797  outer membrane adhesin like proteiin  37.86 
 
 
1141 aa  47.4  0.0008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000422857  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  31.36 
 
 
1287 aa  47.4  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  36.47 
 
 
1855 aa  47.4  0.0009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  52.17 
 
 
1180 aa  47  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0616  peptidase, metallopeptidases  32.28 
 
 
745 aa  46.6  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  39.05 
 
 
938 aa  47  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2318  hypothetical protein  31.14 
 
 
262 aa  46.6  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.571521  hitchhiker  0.00750441 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2705  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  34.43 
 
 
517 aa  47  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2710  hemolysin-type calcium-binding region  33.12 
 
 
327 aa  47  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0827574  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3922  hemolysin-type calcium-binding protein  31.03 
 
 
313 aa  47  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>