21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0052 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1484    99.83 
 
 
591 bp  1164    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.1243 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4925    99.66 
 
 
591 bp  1156    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4864    100 
 
 
591 bp  1172    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4848    99.83 
 
 
591 bp  1164    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4739    100 
 
 
591 bp  1172    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0875709  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4734    100 
 
 
591 bp  1172    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.455594  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3414    99.83 
 
 
591 bp  1164    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2954    99.83 
 
 
591 bp  1164    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0871656  normal  0.0609062 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2541    100 
 
 
591 bp  1172    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0723522  hitchhiker  0.00230732 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2194    99.65 
 
 
567 bp  1108    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.165637  normal  0.249207 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2029    100 
 
 
591 bp  1172    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.231537 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0009    99.82 
 
 
561 bp  1104    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.503812  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1394    100 
 
 
591 bp  1172    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1007    100 
 
 
591 bp  1172    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.969308 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0992    100 
 
 
591 bp  1172    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.193632 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0933    100 
 
 
591 bp  1172    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271995  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0617    100 
 
 
591 bp  1172    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00738142 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0052    100 
 
 
591 bp  1172    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0038    100 
 
 
591 bp  1172    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.570878  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0032    100 
 
 
591 bp  1172    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0541    100 
 
 
153 bp  303  3e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0545961  normal  0.108321 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>