34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2663 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2663  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
354 aa  689    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000329487  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2860  aminoglycoside phosphotransferase  38.39 
 
 
336 aa  219  7.999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.24363  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0078  aminoglycoside phosphotransferase  38.93 
 
 
366 aa  168  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1721  aminoglycoside phosphotransferase  29.72 
 
 
335 aa  55.1  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.496446  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0714  aminoglycoside phosphotransferase  26.07 
 
 
334 aa  53.9  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2288  homoserine kinase  23.18 
 
 
413 aa  48.5  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.031693 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0151  aminoglycoside phosphotransferase  28.06 
 
 
374 aa  47.8  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3396  homoserine kinase  33.02 
 
 
323 aa  47  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0246  serine/threonine protein kinase  26.67 
 
 
328 aa  46.6  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000015453  hitchhiker  0.000046436 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3097  homoserine kinase  27.12 
 
 
310 aa  46.2  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.421511  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2695  homoserine kinase  27.12 
 
 
310 aa  46.2  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.759704  hitchhiker  0.000011123 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0389  serine/threonine protein kinase  26.27 
 
 
324 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.87305  normal  0.288216 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3660  homoserine kinase  26.72 
 
 
332 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.285712  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3867  homoserine kinase  26.72 
 
 
332 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0733816  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4497  homoserine kinase  26.72 
 
 
332 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.165757  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4127  aminoglycoside phosphotransferase  24.56 
 
 
328 aa  44.3  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03694  hypothetical protein  24.56 
 
 
328 aa  44.3  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.617644  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4331  serine/threonine protein kinase  24.08 
 
 
328 aa  44.3  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03745  predicted kinase  24.56 
 
 
328 aa  44.3  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.673887  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4377  serine/threonine protein kinase  24.56 
 
 
328 aa  44.3  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000124881  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4082  serine/threonine protein kinase  24.56 
 
 
328 aa  44.3  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000811117  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4156  serine/threonine protein kinase  26.22 
 
 
328 aa  43.9  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0206015  hitchhiker  0.0000791829 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4240  serine/threonine protein kinase  26.22 
 
 
328 aa  43.9  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00616333  normal  0.232925 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0546  homoserine kinase  24.43 
 
 
321 aa  43.9  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0997708  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5299  serine/threonine protein kinase  26.22 
 
 
328 aa  43.9  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.281627  normal  0.624144 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1376  aminoglycoside phosphotransferase  34.55 
 
 
311 aa  43.9  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.332208  normal  0.0870793 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4313  homoserine kinase  26.28 
 
 
321 aa  43.9  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.275031 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2295  serine/threonine protein kinase  30.77 
 
 
327 aa  43.5  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.182492  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2229  homoserine kinase  25 
 
 
332 aa  43.5  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.344859 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3331  homoserine kinase  29.17 
 
 
334 aa  43.1  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.726424  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3235  homoserine kinase  25.86 
 
 
332 aa  43.1  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0395685 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3764  homoserine kinase  25.86 
 
 
332 aa  43.1  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.208899  decreased coverage  0.000313402 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2520  serine/threonine protein kinase  25.79 
 
 
332 aa  43.1  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.549925  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0600  homoserine kinase  25 
 
 
331 aa  42.7  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>