More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1453 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1453  ABC transporter related protein  100 
 
 
248 aa  485  1e-136  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00421209  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1328  ABC transporter related  43.3 
 
 
328 aa  175  5e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207377  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1321  ABC transporter-like protein  48.48 
 
 
288 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.251104 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6974  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding component  45.78 
 
 
345 aa  171  6.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1233  ABC transporter related  44.23 
 
 
340 aa  170  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1930  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  39.92 
 
 
262 aa  168  7e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0780137  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2777  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  46.79 
 
 
332 aa  168  7e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1788  ABC transporter related  40.69 
 
 
303 aa  168  7e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  41.81 
 
 
258 aa  168  8e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4848  Sigma 54 interacting domain protein  46.95 
 
 
253 aa  167  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.627338 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4372  ABC transporter related  46.95 
 
 
253 aa  167  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.191075 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1680  ABC transporter ATP-binding protein  44.58 
 
 
249 aa  166  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.391829  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0546  ABC transporter related  44.35 
 
 
245 aa  166  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4324  ABC transporter related  47.09 
 
 
368 aa  166  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0269619  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3415  ABC transporter related protein  42.34 
 
 
354 aa  166  4e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00408185  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1722  ABC transporter ATP-binding protein  41.96 
 
 
329 aa  165  5e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.109279 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3906  ABC transporter related  46.92 
 
 
315 aa  166  5e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.118447  normal  0.091795 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3997  ABC transporter related  41.96 
 
 
329 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0225535  normal  0.167206 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1829  ABC transporter related protein  38.94 
 
 
376 aa  165  5.9999999999999996e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000162246  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0701  sulfate ABC transporter ATP-binding protein  44.81 
 
 
348 aa  165  5.9999999999999996e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19520  ABC transporter ATP-binding protein  44.17 
 
 
249 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5128  ABC transporter related  43.15 
 
 
256 aa  165  5.9999999999999996e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.012319  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0482  ABC transporter related protein  40.18 
 
 
255 aa  164  8e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0621  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  44.81 
 
 
348 aa  164  8e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0827201  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2449  ABC transporter related  43.4 
 
 
255 aa  164  9e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.259885 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1639  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  43.36 
 
 
372 aa  164  9e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3485  putative nitrate transport system ATP-binding protein  42.49 
 
 
308 aa  164  9e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3171  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  45.45 
 
 
333 aa  164  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.659319  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1314  ABC transporter related  42.41 
 
 
329 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.159195  normal  0.508 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3479  sulphate transport system permease protein 1  45.87 
 
 
343 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1864  ABC transporter related  42.41 
 
 
361 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2681  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  43.64 
 
 
344 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.255864  normal  0.491584 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3542  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  45.87 
 
 
343 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3492  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  45.87 
 
 
343 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.993193  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3872  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  45.29 
 
 
340 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.213483 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02515  sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein CysA  45.54 
 
 
346 aa  163  2.0000000000000002e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  40.68 
 
 
304 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6201  ABC transporter related  41.95 
 
 
245 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.102037 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4034  ABC transporter related  46.53 
 
 
276 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.105857 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6521  ABC transporter related  46.53 
 
 
270 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4115  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  42.04 
 
 
357 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6755  ABC transporter related  46.53 
 
 
270 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0664482 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1031  ABC transport system, ATP-binding protein  40.78 
 
 
339 aa  163  2.0000000000000002e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1048  sulphate transport system permease protein 1  44.89 
 
 
348 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1159  sulphate transport system permease protein 1  44.89 
 
 
348 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.940545 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6033  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.17 
 
 
349 aa  163  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1271  ABC transporter related  41.96 
 
 
329 aa  162  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0543066 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2948  sulfate/thiosulfate transporter subunit  42.92 
 
 
364 aa  162  4.0000000000000004e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.579552  normal  0.586693 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1680  sulphate transport system permease protein 1  44.29 
 
 
338 aa  162  4.0000000000000004e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.070095  normal  0.46795 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1539  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  43.33 
 
 
264 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4264  ABC transporter related  46.95 
 
 
255 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0906906  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4503  ABC transporter related protein  46.48 
 
 
267 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0833  ABC transporter related  45.97 
 
 
246 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.557912  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1148  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  41.26 
 
 
364 aa  162  5.0000000000000005e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  40.6 
 
 
304 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1157  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  39.91 
 
 
372 aa  161  7e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.602801  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1143  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  40.81 
 
 
364 aa  161  8.000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2794  sulfate/thiosulfate transporter subunit  42.92 
 
 
365 aa  161  8.000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2577  sulfate/thiosulfate transporter subunit  42.92 
 
 
365 aa  161  8.000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1384  ABC transporter related protein  45.34 
 
 
277 aa  161  8.000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0283767 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6344  ABC transporter related  45.45 
 
 
270 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.942875  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4023  ABC transporter related  43.78 
 
 
316 aa  161  8.000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0969  ABC transporter related  45.62 
 
 
362 aa  161  8.000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0177973  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1239  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  42.92 
 
 
365 aa  161  9e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.525663  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1580  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  41.1 
 
 
372 aa  161  9e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.203005  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1257  sulfate/thiosulfate transporter subunit  42.92 
 
 
365 aa  161  9e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109195 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2558  sulfate/thiosulfate transporter subunit  42.92 
 
 
365 aa  161  9e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4007  sulphate transport system permease protein 1  44.44 
 
 
349 aa  161  9e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.451546 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2708  sulfate/thiosulfate transporter subunit  42.92 
 
 
365 aa  161  9e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.882672  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4484  ABC transporter-related protein  42.41 
 
 
330 aa  160  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.495687 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1682  ABC transporter-like  40.62 
 
 
329 aa  161  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677404  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3652  sulfate/thiosulfate transporter subunit  42.92 
 
 
365 aa  161  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.992152  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1639  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  45.5 
 
 
359 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3465  ABC transporter related  47.44 
 
 
241 aa  160  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.158921  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1383  ABC transporter related  47.57 
 
 
368 aa  161  1e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7199  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate/sulfonates)  47.12 
 
 
278 aa  160  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2065  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  41.23 
 
 
351 aa  160  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.981525  normal  0.53005 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5476  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  49.06 
 
 
376 aa  161  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.351267  normal  0.0358165 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7481  ABC transporter ATP-binding protein  44.39 
 
 
267 aa  161  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0421656  normal  0.0607667 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2534  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  40.53 
 
 
354 aa  160  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0417932  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3339  ABC transporter related  49.23 
 
 
260 aa  160  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00741331  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02322  sulfate/thiosulfate transporter subunit  42.92 
 
 
365 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2490  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  41.1 
 
 
240 aa  160  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4664  ABC transporter related  41.26 
 
 
274 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.456657 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0876  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  41.49 
 
 
278 aa  160  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.190681  hitchhiker  0.00187528 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3183  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  41.78 
 
 
353 aa  160  2e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0268964  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1574  ABC transporter related  41.75 
 
 
247 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.212668  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0571  ABC transporter related  44.39 
 
 
267 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.260264  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02283  hypothetical protein  42.92 
 
 
365 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1223  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  43.3 
 
 
369 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.243512  normal  0.134553 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3450  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  42.27 
 
 
351 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0239  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  42.99 
 
 
402 aa  160  2e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.986406  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1182  ABC transporter related  41.47 
 
 
262 aa  160  2e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  44.59 
 
 
352 aa  160  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.699687  normal  0.061822 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21910  putative ATP-binding component of ABC transporter  42.41 
 
 
331 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000308593 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4329  ABC transporter related  41.15 
 
 
243 aa  160  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.413281  normal  0.920294 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1968  sulphate transport system permease protein 1  44.64 
 
 
378 aa  160  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1327  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  43.58 
 
 
378 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.657677  normal  0.141247 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1958  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  43.58 
 
 
378 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2140  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  43.58 
 
 
378 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0391853 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>