27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1240 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1240  cell division protein-like  100 
 
 		 302 aa  616  1e-175  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000193817  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1694  cell division protein ZipA  23.05 
 
 		 298 aa  67  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000842049  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0680  cell division protein ZipA  30.1 
 
 		 365 aa  62.8  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0264468  normal  0.885253 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2439  cell division protein ZipA, putative  29.73 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.734169  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1800  cell division protein ZipA  30.88 
 
 		 288 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000542289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004154  cell division protein ZipA  25.29 
 
 		 318 aa  57.8  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000297505  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3839  cell division protein ZipA  30.22 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.533942  normal  0.453684 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4275  cell division protein ZipA  30.22 
 
 		 317 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.230657  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30300  cell division protein ZipA  28.78 
 
 		 285 aa  55.8  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00228143  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3601  cell division protein ZipA  30.22 
 
 		 294 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00102901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44670  cell division protein ZipA  29.5 
 
 		 289 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000166616  normal  0.1254 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1593  cell division protein ZipA  30.22 
 
 		 297 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.953645  normal  0.0582904 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01311  cell division protein ZipA  25.37 
 
 		 323 aa  55.5  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3805  cell division protein ZipA  29.5 
 
 		 290 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0491  cell division protein ZipA  26.95 
 
 		 291 aa  53.9  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000677143  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2747  cell division protein ZipA  29.5 
 
 		 273 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0209511  normal  0.778206 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3657  cell division protein ZipA, putative  27.94 
 
 		 288 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1818  cell division protein ZipA  27.94 
 
 		 287 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00237692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1879  cell division protein ZipA  29.06 
 
 		 410 aa  50.8  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1880  cell division protein ZipA  25.9 
 
 		 378 aa  48.1  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00963367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1775  cell division protein ZipA  25.34 
 
 		 444 aa  47.4  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000785839  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2025  cell division protein ZipA  29.21 
 
 		 267 aa  46.2  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0277053  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3467  putative cell division protein ZipA  29.89 
 
 		 380 aa  45.4  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.592721  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0371  cell division protein ZipA  29.31 
 
 		 335 aa  45.1  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1166  cell division protein ZipA  20.47 
 
 		 338 aa  44.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00263828  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2848  cell division protein ZipA  22.54 
 
 		 311 aa  43.1  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000011699  unclonable  0.0000000149917 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01849  putative cell division protein ZipA  28.05 
 
 		 532 aa  43.1  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000720227  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>