44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0949 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0949  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  309  1e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.811465  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0376  protein of unknown function DUF302  46 
 
 		 148 aa  152  1e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1896  hypothetical protein  50 
 
 		 135 aa  145  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1260  hypothetical protein  45.7 
 
 		 157 aa  137  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001057  putative inner membrane or exported protein  43.06 
 
 		 148 aa  138  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0512  hypothetical protein  41.78 
 
 		 152 aa  133  9e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.915743  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1673  hypothetical protein  43.75 
 
 		 172 aa  132  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00536019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2096  hypothetical protein  42.47 
 
 		 150 aa  129  9e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1941  hypothetical protein  42.97 
 
 		 172 aa  129  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2735  hypothetical protein  46.34 
 
 		 131 aa  128  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3845  protein of unknown function DUF302  48.6 
 
 		 133 aa  125  3e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0744952 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4835  hypothetical protein  44.59 
 
 		 197 aa  120  5e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1369  crcB family protein  46.08 
 
 		 254 aa  118  3e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1325  camphor resistance protein CrcB  46.08 
 
 		 270 aa  118  3e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1764  protein of unknown function DUF302  39.23 
 
 		 154 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2075  hypothetical protein  45.61 
 
 		 150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2874  hypothetical protein  44.72 
 
 		 143 aa  110  5e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1823  hypothetical protein  43.24 
 
 		 131 aa  110  8.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2556  hypothetical protein  42.02 
 
 		 150 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.299096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3395  hypothetical protein  42.97 
 
 		 160 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.614366  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05960  hypothetical protein  36.5 
 
 		 306 aa  104  5e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0678707  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1380  protein of unknown function DUF302  40 
 
 		 179 aa  102  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8087  protein of unknown function DUF302  35.34 
 
 		 163 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1779  hypothetical protein  30.82 
 
 		 151 aa  95.1  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6375  protein of unknown function DUF302  40.78 
 
 		 165 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0349  periplasmic protein  36.29 
 
 		 168 aa  86.3  1e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.112084  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5442  hypothetical protein  35.16 
 
 		 138 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821645  normal  0.0692077 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5867  hypothetical protein  32.03 
 
 		 202 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.244323  normal  0.372797 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4909  domain of unknown function superfamily  31.67 
 
 		 122 aa  73.9  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4835  hypothetical protein  31.67 
 
 		 122 aa  74.3  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.770482  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4859  hypothetical protein  31.67 
 
 		 122 aa  74.3  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.103571 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4759  hypothetical protein  34.65 
 
 		 122 aa  73.6  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.61827  normal  0.706872 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4906  hypothetical protein  34.65 
 
 		 122 aa  73.6  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0532643 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1665  hypothetical protein  35.56 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8650  protein of unknown function DUF302  33.33 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0543  protein of unknown function DUF302  36.25 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2794  hypothetical protein  33.94 
 
 		 147 aa  67.4  0.00000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.4262  normal  0.709682 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1272  hypothetical protein  26.05 
 
 		 121 aa  67  0.00000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0007  protein of unknown function DUF302  30.71 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.120765 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1972  protein of unknown function DUF302  29.13 
 
 		 123 aa  63.5  0.0000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1559  protein of unknown function DUF302  33.75 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.874349  normal  0.0163758 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3562  hypothetical protein  32.53 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2704  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.556991  normal  0.238987 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3413  hypothetical protein  33.8 
 
 		 80 aa  47  0.00009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>