More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_R0002 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_R0002  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0002  tRNA-Ala  93.33 
 
 		 76 bp  109  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0028  tRNA-Ala  94.12 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.408156  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0028  tRNA-Ala  94.12 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.139647  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0553  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2493  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2178  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2450  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ala-4  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ala-5  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ala-6  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ala-7  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t1783  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0080  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0020  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2608  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2571  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0410  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0182  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0169  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0029  tRNA-Ala  92.65 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0034  tRNA-Ala  92.65 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.151795  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0103  tRNA-Ala  90.67 
 
 		 78 bp  93.7  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00163997  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5618  tRNA-Ala  90.67 
 
 		 78 bp  93.7  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0269583  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0010  tRNA-Ala  90.67 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0029  tRNA-Ala  90.67 
 
 		 78 bp  93.7  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5641  tRNA-Ile  90.67 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5644  tRNA-Ala  90.67 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5641  tRNA-Ala  90.67 
 
 		 78 bp  93.7  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.105844  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0033  tRNA-Ala  90.67 
 
 		 78 bp  93.7  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.362537  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0003  tRNA-Ala  90.67 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5625  tRNA-Ala  90.67 
 
 		 78 bp  93.7  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0342896  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  90.67 
 
 		 79 bp  93.7  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ala-4  tRNA-Ala  90.67 
 
 		 79 bp  93.7  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.511469  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  90.67 
 
 		 79 bp  93.7  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  90.67 
 
 		 79 bp  93.7  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ala-5  tRNA-Ala  90.67 
 
 		 79 bp  93.7  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  90.67 
 
 		 79 bp  93.7  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.520164  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ala-4  tRNA-Ala  90.67 
 
 		 79 bp  93.7  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0026  tRNA-Ala  90.67 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0248198  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0003  tRNA-Ala  90.67 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0026  tRNA-Ala  90.67 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0540884  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0010  tRNA-Ala  90.67 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  90.67 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00147071  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  90.67 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.132549  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0008  tRNA-Ala  90.67 
 
 		 78 bp  93.7  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5287  tRNA-Ala  90.67 
 
 		 78 bp  93.7  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.231328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5311  tRNA-Ala  90.67 
 
 		 78 bp  93.7  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.124894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0009  tRNA-Ala  90.67 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0003  tRNA-Ala  90.67 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_R0072  tRNA-Ala  90.67 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.665456  hitchhiker  0.000486615 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0082  tRNA-Ala  90.67 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0009  tRNA-Ala  90.67 
 
 		 78 bp  93.7  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0348385  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5734  tRNA-Ala  90.54 
 
 		 78 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000108147  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  90.54 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000677485  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ala-5  tRNA-Ala  90.54 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000396068  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ala-4  tRNA-Ala  90.54 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.265738  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ala-6  tRNA-Ala  90.54 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000288872  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  90.54 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000494003  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  90.54 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00200718  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4569  tRNA-Ala  90.54 
 
 		 78 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000675831  normal  0.111562 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5026  tRNA-Ala  90.54 
 
 		 78 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000587824  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0862  tRNA-Ala  90.54 
 
 		 78 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000933142  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0220  tRNA-Ala  90.54 
 
 		 78 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000245454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5811  tRNA-Ala  90.54 
 
 		 78 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00210274  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0787  tRNA-Ala  90.54 
 
 		 78 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3879199999999999e-31 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4995  tRNA-Ala  90.54 
 
 		 78 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0055  tRNA-Ala  94.83 
 
 		 73 bp  91.7  2e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.882837  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0135  tRNA-Ala  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00338984  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0106  tRNA-Ala  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000506231  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5655  tRNA-Ala  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000213498  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5696  tRNA-Ala  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000731558  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5724  tRNA-Ala  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000745652  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0131  tRNA-Ala  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000907835  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0041  tRNA-Ala  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928737  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  90.41 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000729752  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  90.41 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000114514  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ala-5  tRNA-Ala  90.41 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000442244  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0064  tRNA-Ala  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0041  tRNA-Ala  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.66128  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0102  tRNA-Ala  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00179656  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5140  tRNA-Ala  90.41 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00011996  normal  0.803313 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0196  tRNA-Ala  90.41 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000704358  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000936426  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ala-4  tRNA-Ala  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000418225  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ala-5  tRNA-Ala  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000357086  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0175  tRNA-Ala  90.41 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0809338 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5658  tRNA-Ala  90.41 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000863381  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0018  tRNA-Ala  91.18 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000012168  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0050  tRNA-Ala  91.18 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00215399  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6151  tRNA-Ala  89.33 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.140064  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5401  tRNA-Ala  89.33 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0384247  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0065  tRNA-Ala  89.33 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0054  tRNA-Ala  89.33 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.755946  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0016  tRNA-Ala  89.33 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000390105  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0813  tRNA-Ala  89.33 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4844  tRNA-Ala  89.33 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.054319  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>