72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2492 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2492  hypothetical protein  100 
 
 
117 aa  235  1e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.211569 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2405  protein of unknown function DUF552  49.28 
 
 
162 aa  75.9  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.251598 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0903  protein of unknown function DUF552  46.58 
 
 
172 aa  73.6  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.10359  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2876  hypothetical protein  47.95 
 
 
167 aa  72.8  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17566  normal  0.55064 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3057  hypothetical protein  51.47 
 
 
165 aa  73.2  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0387073  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1079  protein of unknown function DUF552  46.38 
 
 
160 aa  73.2  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.208009  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6101  protein of unknown function DUF552  47.76 
 
 
203 aa  72.8  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.608193  normal  0.0861444 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13540  hypothetical protein  47.06 
 
 
210 aa  72  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.270166  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1577  protein of unknown function DUF552  41.98 
 
 
176 aa  72  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.110571 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2921  protein of unknown function DUF552  40.45 
 
 
177 aa  72.4  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00244461  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5091  hypothetical protein  47.76 
 
 
192 aa  72  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.153174  hitchhiker  0.00267894 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1421  hypothetical protein  47.76 
 
 
187 aa  72  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00683826  normal  0.0780457 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1289  protein of unknown function DUF552  49.25 
 
 
162 aa  71.6  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.187686  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22750  hypothetical protein  48.53 
 
 
165 aa  72  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.515425  normal  0.0364691 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1600  protein of unknown function DUF552  45.95 
 
 
164 aa  71.6  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.164455  normal  0.658376 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1116  hypothetical protein  45.21 
 
 
210 aa  71.2  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.287152  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10860  hypothetical protein  47.76 
 
 
162 aa  70.5  0.000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0170593  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3193  protein of unknown function DUF552  40.24 
 
 
187 aa  70.5  0.000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.749912  normal  0.0831123 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1412  hypothetical protein  43.84 
 
 
175 aa  70.5  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.102677 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1576  hypothetical protein  41.98 
 
 
178 aa  70.5  0.000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.135091  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3321  hypothetical protein  44.05 
 
 
126 aa  68.9  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1024  hypothetical protein  45.07 
 
 
175 aa  68.2  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.695466  hitchhiker  0.00825865 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8946  hypothetical protein  42.86 
 
 
130 aa  68.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3256  protein of unknown function DUF552  46.27 
 
 
267 aa  66.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4006  hypothetical protein  43.02 
 
 
193 aa  66.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0827549  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16510  hypothetical protein  44.78 
 
 
190 aa  66.2  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0809047  normal  0.0399309 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5757  protein of unknown function DUF552  42.65 
 
 
215 aa  64.3  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3250  hypothetical protein  46.27 
 
 
220 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3312  hypothetical protein  46.27 
 
 
220 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0545033 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3261  hypothetical protein  46.27 
 
 
220 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.289859  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2994  hypothetical protein  46.27 
 
 
224 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0342705 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3517  hypothetical protein  46.27 
 
 
210 aa  63.5  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0721193  normal  0.0710032 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3011  protein of unknown function DUF552  38.54 
 
 
255 aa  63.5  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0137  hypothetical protein  38.04 
 
 
159 aa  63.2  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0371341  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12177  hypothetical protein  44.78 
 
 
241 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.899747  normal  0.644491 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3434  hypothetical protein  36.63 
 
 
226 aa  62.4  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.447555  hitchhiker  0.00630531 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0457  cell division family protein  43.28 
 
 
152 aa  61.6  0.000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27340  hypothetical protein  39.71 
 
 
210 aa  60.8  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1316  protein of unknown function DUF552  29.13 
 
 
167 aa  59.7  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000581957  normal  0.957732 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3208  hypothetical protein  41.79 
 
 
229 aa  59.7  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.305959 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2640  protein of unknown function DUF552  41.54 
 
 
222 aa  57  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.340811  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3796  protein of unknown function DUF552  40 
 
 
202 aa  55.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.423363  normal  0.506334 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1486  hypothetical protein  31.94 
 
 
186 aa  53.5  0.0000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0332876  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1200  cell division protein  35.94 
 
 
144 aa  53.5  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3522  protein of unknown function DUF552  38.71 
 
 
197 aa  52  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.613225  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2548  hypothetical protein  34.38 
 
 
156 aa  47.8  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.232838  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1905  protein of unknown function DUF552  31.75 
 
 
142 aa  47  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1491  cell division protein  26.87 
 
 
149 aa  47  0.00008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0492  protein of unknown function DUF552  31.37 
 
 
226 aa  47  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.042492  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4000  ylmF protein  32.81 
 
 
156 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000660664  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1035  protein of unknown function DUF552  31.25 
 
 
144 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000196256  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3750  ylmF protein  32.81 
 
 
156 aa  46.2  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0779289  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3641  hypothetical protein  32.81 
 
 
156 aa  46.2  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000538076  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3658  hypothetical protein  32.81 
 
 
156 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.176518  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4038  hypothetical protein  32.81 
 
 
156 aa  46.2  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00196777  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3726  hypothetical protein  32.81 
 
 
156 aa  46.2  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0030403  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3951  ylmF protein  32.81 
 
 
156 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591858  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3944  ylmF protein  32.81 
 
 
156 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0064006  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1241  ylmF protein  32.81 
 
 
156 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000979962  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3913  ylmF protein  32.81 
 
 
156 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000167056 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1238  protein of unknown function DUF552  25.26 
 
 
179 aa  45.4  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.342775  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0791  hypothetical protein  24.71 
 
 
155 aa  45.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000158069  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0594  hypothetical protein  27.91 
 
 
138 aa  44.7  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195332  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4046  protein of unknown function DUF552  23.53 
 
 
149 aa  43.9  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00125634  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1471  protein of unknown function DUF552  29.69 
 
 
210 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000000569683  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2060  cell division protein  26.92 
 
 
196 aa  41.6  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1016  protein of unknown function DUF552  23.81 
 
 
144 aa  41.2  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1273  hypothetical protein  24.42 
 
 
187 aa  41.2  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000107088  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1248  hypothetical protein  24.42 
 
 
187 aa  41.2  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120045  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1821  hypothetical protein  26.56 
 
 
149 aa  40.8  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000225081  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2107  hypothetical protein  26.56 
 
 
149 aa  40.8  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000203247  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5696  hypothetical protein  32.26 
 
 
124 aa  40  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>