18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1912 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1912  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
283 aa  536  1e-151  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.106645 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3218  hypothetical protein  48.07 
 
 
298 aa  194  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42082  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1726  aminoglycoside phosphotransferase  49.64 
 
 
308 aa  187  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000439943  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6624  aminoglycoside phosphotransferase  52.78 
 
 
290 aa  187  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5623  aminoglycoside phosphotransferase  45.17 
 
 
261 aa  146  5e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.575003 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4996  hypothetical protein  46.02 
 
 
251 aa  143  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.601635  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5084  hypothetical protein  46.02 
 
 
251 aa  143  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.272123 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5377  hypothetical protein  46.02 
 
 
251 aa  143  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225647  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4966  hypothetical protein  52.08 
 
 
341 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1755  aminoglycoside phosphotransferase  31.58 
 
 
307 aa  45.8  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1539  aminoglycoside phosphotransferase  32.52 
 
 
303 aa  45.4  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.791397  normal  0.0213289 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2091  aminoglycoside phosphotransferase  31.58 
 
 
308 aa  45.4  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.100856  normal  0.0330473 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1106  aminoglycoside phosphotransferase  30.16 
 
 
303 aa  44.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.577893  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1555  aminoglycoside phosphotransferase  30.26 
 
 
273 aa  43.5  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312642  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4742  hypothetical protein  32.81 
 
 
313 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2945  aminoglycoside phosphotransferase  32.05 
 
 
263 aa  42.7  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.263618  normal  0.221507 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0851  trehalose synthase  34.67 
 
 
1108 aa  42.4  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1107  serine/threonine protein kinase  30.97 
 
 
329 aa  42  0.01  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>