More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2728 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_2728  hypothetical protein  100 
 
 
192 aa  383  1e-106  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.825234 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2380  hypothetical protein  38.85 
 
 
305 aa  94.4  9e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.691759  normal  0.155983 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08019  Pfs, NACHT and Ankyrin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G01020)  37.42 
 
 
1156 aa  87.8  9e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.596222  hitchhiker  0.00162932 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2488  Ankyrin  39.49 
 
 
196 aa  84.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5090  Ankyrin  42.11 
 
 
135 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.325044  normal  0.0672645 
 
 
-
 
NC_002978  WD0514  ankyrin repeat-containing protein  34.05 
 
 
469 aa  82.8  0.000000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.919326  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_5133  predicted protein  35.95 
 
 
184 aa  80.1  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.648247  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1435  hypothetical protein  37.76 
 
 
1585 aa  80.1  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.015567 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08304  conserved hypothetical protein  36.6 
 
 
1198 aa  79.3  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0000526329 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0685  Ankyrin  41.04 
 
 
140 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0219  Ankyrin  37.5 
 
 
382 aa  79  0.00000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.41533e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4314  ankyrin  37.74 
 
 
426 aa  79  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327235  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2151  Ankyrin  31.63 
 
 
490 aa  78.6  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.712677 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  39.1 
 
 
1402 aa  78.2  0.00000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1887  ankyrin  36.54 
 
 
321 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.959203 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00782  ankyrin repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_1G14510)  34.52 
 
 
1139 aa  76.6  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0550  ankyrin repeat-containing protein  36.6 
 
 
329 aa  76.3  0.0000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1071  ankyrin  43.3 
 
 
342 aa  76.3  0.0000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1000  ankyrin  35.62 
 
 
494 aa  76.3  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0703  hypothetical protein  34.34 
 
 
762 aa  75.5  0.0000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1071  hypothetical protein  36.96 
 
 
347 aa  74.7  0.0000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1284  ankyrin  39.35 
 
 
870 aa  74.3  0.0000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.226002  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0173  Ankyrin  37.84 
 
 
149 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.947078  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1384  ankyrin  37.58 
 
 
235 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309496  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3569  ankyrin  38.92 
 
 
227 aa  74.3  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00419939 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3439  ankyrin  38.18 
 
 
337 aa  73.2  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41623  hitchhiker  0.000120862 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  32.91 
 
 
2413 aa  73.2  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2259  ankyrin repeat-containing signal peptide protein  39.55 
 
 
250 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0980373  normal  0.483285 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1943  Ankyrin  39.55 
 
 
241 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.579391 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2193  ankyrin  34.32 
 
 
219 aa  72.8  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.862508 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4090  hypothetical protein  36.65 
 
 
427 aa  72.4  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0155  Ankyrin  37.88 
 
 
149 aa  72  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2346  Ankyrin  38.03 
 
 
173 aa  71.6  0.000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.176279  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4250  ankyrin  42.55 
 
 
237 aa  71.6  0.000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.379983 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3408  ankyrin  36.88 
 
 
231 aa  71.2  0.000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.90032  normal  0.939091 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1799  ankyrin  39.42 
 
 
236 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.912311 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1729  ankyrin  34.53 
 
 
172 aa  71.2  0.000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1484  hypothetical protein  35.95 
 
 
790 aa  71.2  0.000000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1827  ankyrin  38.69 
 
 
236 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0395685  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0382  ankyrin repeat protein  33.96 
 
 
891 aa  70.5  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3006  ankyrin  33.52 
 
 
222 aa  70.5  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3435  ankyrin repeat-containing protein  40.91 
 
 
141 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2199  ankyrin repeat-containing protein  32.79 
 
 
442 aa  70.9  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1347  Ankyrin  35.58 
 
 
404 aa  70.9  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2256  ankyrin  37.41 
 
 
187 aa  70.1  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.410202  normal  0.75483 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1618  Ankyrin  37.41 
 
 
187 aa  70.1  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1096  ankyrin  35.17 
 
 
1061 aa  70.1  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0912242  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1046  ankyrin  36.55 
 
 
257 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.398559  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0363  hypothetical protein  33.56 
 
 
2171 aa  69.3  0.00000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.082224 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5190  ankyrin repeat-containing protein  35.76 
 
 
236 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.210108 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0162  ankyrin  40.15 
 
 
141 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2205  Ankyrin  35.25 
 
 
191 aa  69.7  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00267936  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1913  ankyrin repeat-containing protein  38.52 
 
 
236 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0270531 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2318  Ankyrin  30.18 
 
 
217 aa  69.3  0.00000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0824  ankyrin  30.73 
 
 
266 aa  68.9  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132529  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3392  ankyrin  35.58 
 
 
247 aa  68.9  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0097583 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6189  ankyrin repeat-containing protein  38.52 
 
 
236 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385081  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1890  ankyrin repeat-containing protein  38.52 
 
 
236 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0277934  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1317  hypothetical protein  32.32 
 
 
536 aa  68.6  0.00000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1450  Ankyrin  25.43 
 
 
253 aa  68.2  0.00000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01130  conserved hypothetical protein  32.9 
 
 
1030 aa  67.8  0.00000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.329359  normal  0.12831 
 
 
-
 
NC_002978  WD0385  ankyrin repeat-containing protein  34.88 
 
 
542 aa  67.8  0.00000000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.317443  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2061  hypothetical protein  34.4 
 
 
584 aa  67  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0104  ankyrin  36.59 
 
 
151 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0393  hypothetical protein  34.9 
 
 
821 aa  67.4  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1185  ankyrin repeat-containing protein  37.04 
 
 
235 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2316  ankyrin repeat-containing protein  37.04 
 
 
242 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.482363  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0147  ankyrin repeat-containing protein  33.75 
 
 
954 aa  67  0.0000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1421  ankyrin repeat-containing protein  37.04 
 
 
235 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.89673  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0911  hypothetical protein  41.61 
 
 
931 aa  66.6  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0380613 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3392  ankyrin repeat-containing protein  37.04 
 
 
235 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1912  ankyrin repeat-containing protein  37.04 
 
 
235 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2438  ankyrin repeat-containing protein  37.04 
 
 
242 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.75875  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0071  ankyrin repeat-containing protein  36.02 
 
 
224 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2158  ankyrin repeat-containing protein  36.43 
 
 
240 aa  67  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2388  ankyrin  38.35 
 
 
217 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.751385 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3164  ankyrin  32.17 
 
 
173 aa  66.6  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.139563  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2277  ankyrin repeat-containing protein  37.04 
 
 
240 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2666  ankyrin  45.45 
 
 
237 aa  66.2  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.931958  hitchhiker  0.000000569803 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3277  ankyrin  38.06 
 
 
140 aa  65.9  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1581  hypothetical protein  37.01 
 
 
157 aa  66.2  0.0000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1797  ankyrin repeat-containing protein  30.05 
 
 
483 aa  66.2  0.0000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0015  ankyrin  32.26 
 
 
194 aa  65.9  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.189305  hitchhiker  0.00296993 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1283  ankyrin  38.26 
 
 
214 aa  66.2  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27436  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2899  ankyrin  41.58 
 
 
442 aa  66.2  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0204269  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0458  Ankyrin  37.96 
 
 
161 aa  66.2  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510961  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2634  ankyrin  34.36 
 
 
269 aa  65.9  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0366745  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2051  hypothetical protein  34.4 
 
 
583 aa  65.9  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1348  Ankyrin  31.25 
 
 
345 aa  65.5  0.0000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0228  hypothetical protein  32.26 
 
 
750 aa  65.1  0.0000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.871268 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2662  ankyrin  40.69 
 
 
756 aa  65.5  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.116239 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1634  ankyrin repeat-containing protein  37.27 
 
 
1116 aa  65.1  0.0000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0269822  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1380  ankyrin  33.56 
 
 
216 aa  65.1  0.0000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3138  ankyrin  35.92 
 
 
208 aa  65.1  0.0000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4177  ankyrin  34.53 
 
 
175 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1860  ankyrin  34.53 
 
 
181 aa  64.7  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.43131 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5275  Ankyrin  33.81 
 
 
178 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.667111 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5420  ankyrin  31.67 
 
 
274 aa  64.7  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0324  ankyrin repeat-containing protein  37.12 
 
 
142 aa  64.7  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1250  ankyrin  32.03 
 
 
144 aa  64.3  0.0000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>