More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0980 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0980  ABC-type transport system ipermease component  100 
 
 		 264 aa  517  1e-146  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0674411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2592  ABC-type transport system ipermease component  38.96 
 
 		 269 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.338315  normal  0.186973 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1216  protein of unknown function DUF140  38.96 
 
 		 269 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1817  ABC-type transport system ipermease component  34.8 
 
 		 266 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.677101  normal  0.663369 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0554  ABC-type transport system ipermease component  37.55 
 
 		 287 aa  137  3.0000000000000003e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.423145 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1224  ABC-type transport system ipermease component  34.2 
 
 		 266 aa  133  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2917  ABC-type transport system ipermease component  33.33 
 
 		 267 aa  119  4.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.68083  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1789  ABC-type transport system ipermease component  32.05 
 
 		 267 aa  113  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.047158 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2659  ABC-type transport system ipermease component  33.48 
 
 		 267 aa  110  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0263164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0012  ABC-type transport system ipermease component  34.38 
 
 		 249 aa  102  4e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000582511 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1896  hypothetical protein  29.95 
 
 		 258 aa  87  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000620774  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1965  protein of unknown function DUF140  27.7 
 
 		 270 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2748  hypothetical protein  31.03 
 
 		 265 aa  79.7  0.00000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1899  hypothetical protein  30.65 
 
 		 262 aa  79.3  0.00000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1968  hypothetical protein  32.02 
 
 		 263 aa  76.3  0.0000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.901024  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0033  hypothetical protein  27.88 
 
 		 258 aa  73.2  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000645659  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0238  hypothetical protein  28.81 
 
 		 263 aa  72.8  0.000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.871926 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0889  protein of unknown function DUF140  27.88 
 
 		 262 aa  70.9  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.106766  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0385  protein of unknown function DUF140  32.38 
 
 		 260 aa  70.1  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.231981 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3401  hypothetical protein  30.81 
 
 		 263 aa  67.8  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3121  hypothetical protein  30.1 
 
 		 258 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.605648  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1074  hypothetical protein  29.89 
 
 		 393 aa  65.9  0.0000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1886  protein of unknown function DUF140  33.56 
 
 		 328 aa  63.9  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2769  hypothetical protein  28.06 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3258  hypothetical protein  30.1 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0680  hypothetical protein  32.14 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.75671 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3342  hypothetical protein  32.14 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.279252 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2961  hypothetical protein  28.22 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.597784  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3953  hypothetical protein  32.14 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0097  hypothetical protein  28.87 
 
 		 265 aa  63.9  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.180124  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0342  hypothetical protein  29.59 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.610119 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2692  hypothetical protein  29.08 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327255  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0722  hypothetical protein  32.14 
 
 		 261 aa  63.5  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0333  hypothetical protein  29.59 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0415  hypothetical protein  29.08 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.177362  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0679  hypothetical protein  32.14 
 
 		 261 aa  63.5  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.876279  normal  0.100522 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3661  hypothetical protein  32.14 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0857577  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0714  protein of unknown function DUF140  32.14 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504036 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0723  hypothetical protein  32.14 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0693  hypothetical protein  32.14 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  27.83 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0394  hypothetical protein  28.93 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2870  hypothetical protein  34.09 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4446  hypothetical protein  28.7 
 
 		 265 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2749  ABC-type transport system, permease component  31.03 
 
 		 386 aa  62.8  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3513  ABC transporter, inner membrane subunit  28.93 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4140  hypothetical protein  26.91 
 
 		 265 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0318  hypothetical protein  28.93 
 
 		 255 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.256439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2119  hypothetical protein  32.81 
 
 		 258 aa  62  0.000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2785  hypothetical protein  28.76 
 
 		 260 aa  62  0.000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00892683  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0023  transporter, putative  27.62 
 
 		 250 aa  62  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0760  protein of unknown function DUF140  37.23 
 
 		 266 aa  62  0.000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1494  protein of unknown function DUF140  29.24 
 
 		 375 aa  62  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000338364  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002410  uncharacterized ABC transporter permease component YrbE  31.54 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2297  hypothetical protein  32.85 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.346227  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3393  hypothetical protein  30.72 
 
 		 259 aa  62  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0208  protein of unknown function DUF140  27.14 
 
 		 268 aa  61.6  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00143644  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0096  protein of unknown function DUF140  28.04 
 
 		 262 aa  61.6  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.0000150492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3080  hypothetical protein  30.77 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2222  hypothetical protein  29.04 
 
 		 259 aa  61.6  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.12831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0402  hypothetical protein  34.68 
 
 		 258 aa  61.6  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.738566  normal  0.849154 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1976  hypothetical protein  35.66 
 
 		 250 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5027  ABC transporter permease  28.63 
 
 		 265 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0408  hypothetical protein  32.5 
 
 		 257 aa  60.5  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3100  hypothetical protein  28.11 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.496882 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03185  putative transport protein (ABC superfamily, membrane)  27.88 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0282  hypothetical protein  25.09 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2219  hypothetical protein  29.22 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1172  ABC transporter permease  33.1 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4570  protein of unknown function DUF140  36.36 
 
 		 266 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3608  hypothetical protein  31.18 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0388  ABC transporter inner membrane protein  31.47 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0289  protein of unknown function DUF140  25.4 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.16381  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3303  hypothetical protein  31.36 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3239  protein of unknown function DUF140  30.54 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1039  hypothetical protein  29.69 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2892  protein of unknown function DUF140  30.54 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12860  organic solvent tolerance ABC efflux transporter, permease component  26 
 
 		 265 aa  59.3  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2101  hypothetical protein  33.06 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0904  hypothetical protein  27.93 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0873  hypothetical protein  27.93 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0980  hypothetical protein  27.23 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0738  protein of unknown function DUF140  26.51 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0794  hypothetical protein  26.26 
 
 		 264 aa  58.5  0.00000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.213597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3461  protein of unknown function DUF140  26.61 
 
 		 244 aa  58.5  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0854516 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2412  hypothetical protein  27.31 
 
 		 260 aa  58.5  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.819451  normal  0.102751 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0447  ABC-type toluene export protein  28.19 
 
 		 269 aa  58.2  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000256221  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0513  hypothetical protein  28.83 
 
 		 260 aa  58.5  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0449  putative ABC transporter, permease protein YrbE  28.83 
 
 		 260 aa  58.5  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.487258  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03657  hypothetical protein  31.25 
 
 		 263 aa  58.2  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0497  hypothetical protein  27.16 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000163083  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1145  hypothetical protein  28.83 
 
 		 260 aa  58.5  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57870  ABC transporter permease  28.23 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0734  hypothetical protein  31.18 
 
 		 260 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.336602 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2708  hypothetical protein  26.61 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0864  hypothetical protein  29.17 
 
 		 265 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3570  protein of unknown function DUF140  30.46 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392913  hitchhiker  0.0000192838 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0741  protein of unknown function DUF140  26.94 
 
 		 267 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.121135  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0560  hypothetical protein  31.58 
 
 		 259 aa  57.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4232  hypothetical protein  31.36 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.212693  hitchhiker  0.000290444 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>