114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0874 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_0874  sulfate adenylyltransferase  100 
 
 
402 aa  840    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0353  sulfate adenylyltransferase  73.32 
 
 
402 aa  631  1e-180  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1587  sulfate adenylyltransferase  66.17 
 
 
404 aa  555  1e-157  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.369869  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1111  sulfate adenylyltransferase  65.85 
 
 
419 aa  556  1e-157  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1839  sulfate adenylyltransferase  66 
 
 
404 aa  555  1e-157  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0886206  normal  0.0259449 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1069  sulfate adenylyltransferase  63.88 
 
 
419 aa  538  9.999999999999999e-153  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1393  sulfate adenylyltransferase  63.88 
 
 
417 aa  539  9.999999999999999e-153  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0041  sulfate adenylyltransferase  64.65 
 
 
403 aa  540  9.999999999999999e-153  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1046  sulfate adenylyltransferase  63.39 
 
 
410 aa  514  1e-144  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000167111  normal  0.0142718 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0454  sulfate adenylyltransferase  58.27 
 
 
423 aa  495  1e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0200501  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3196  sulfate adenylyltransferase  56.9 
 
 
422 aa  488  1e-137  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000304807  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2265  sulfate adenylyltransferase  56.06 
 
 
427 aa  475  1e-133  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0505163  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1002  sulfate adenylyltransferase  54.35 
 
 
424 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000329469  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0074  sulfate adenylyltransferase  54.44 
 
 
428 aa  456  1e-127  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.548613 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1968  sulfate adenylyltransferase  53.92 
 
 
434 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.678215  normal  0.0535908 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1771  sulfate adenylyltransferase  54.21 
 
 
427 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.517985  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1076  sulfate adenylyltransferase  54.19 
 
 
420 aa  444  1e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0121027  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0635  sulfate adenylyltransferase  52.33 
 
 
389 aa  427  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3579  sulfate adenylyltransferase  48.96 
 
 
391 aa  402  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000159277  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0966  sulfate adenylyltransferase  47.35 
 
 
393 aa  374  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.399094  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0039  sulfate adenylyltransferase  45.31 
 
 
392 aa  369  1e-101  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0758  sulfate adenylyltransferase  48.17 
 
 
391 aa  364  1e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0556  sulfate adenylyltransferase  46.34 
 
 
391 aa  356  3.9999999999999996e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0573  sulfate adenylyltransferase  46.34 
 
 
391 aa  356  3.9999999999999996e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2625  sulfate adenylyltransferase  47.09 
 
 
388 aa  355  1e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.601961 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0062  sulfate adenylyltransferase  46.33 
 
 
396 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.794108  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0254  sulfate adenylyltransferase  47.14 
 
 
397 aa  352  7e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.249447 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0295  sulfate adenylyltransferase  45.81 
 
 
395 aa  351  2e-95  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3316  hypothetical protein  44.21 
 
 
391 aa  347  2e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.181694  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0864  sulfate adenylyltransferase  44.81 
 
 
386 aa  342  5.999999999999999e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.904733  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2186  sulfate adenylyltransferase  44.47 
 
 
392 aa  340  4e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2382  sulfate adenylyltransferase  44.8 
 
 
392 aa  339  5e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000978481 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22660  sulfate adenylyltransferase  41.95 
 
 
383 aa  336  3.9999999999999995e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1579  sulfate adenylyltransferase  43.8 
 
 
396 aa  334  1e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1410  sulfate adenylyltransferase  44.82 
 
 
389 aa  330  3e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.346803 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0856  sulfate adenylyltransferase  42.05 
 
 
389 aa  330  3e-89  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.894587  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0412  sulfate adenylyltransferase  44 
 
 
386 aa  329  5.0000000000000004e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1748  sulfate adenylyltransferase  42.08 
 
 
383 aa  325  9e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.510281  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0713  sulfate adenylyltransferase  40.73 
 
 
384 aa  325  1e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000184325  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3867  sulfate adenylyltransferase  44 
 
 
378 aa  324  2e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0197 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1292  sulfate adenylyltransferase  43.33 
 
 
386 aa  324  2e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1477  sulfate adenylyltransferase  43.71 
 
 
378 aa  323  5e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1345  sulfate adenylyltransferase  43.43 
 
 
378 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.60565  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1304  sulfate adenylyltransferase  42.51 
 
 
378 aa  319  6e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1305  sulfate adenylyltransferase  44.71 
 
 
378 aa  319  7e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1513  sulfate adenylyltransferase  44.71 
 
 
378 aa  318  7.999999999999999e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000913539 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1583  sulfate adenylyltransferase  42.62 
 
 
378 aa  318  1e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0167667  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1545  sulfate adenylyltransferase  44.41 
 
 
378 aa  317  3e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1331  sulfate adenylyltransferase  44.12 
 
 
378 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1441  sulfate adenylyltransferase  44.12 
 
 
378 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1144  sulfate adenylyltransferase  42.21 
 
 
375 aa  311  1e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.913627  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0231  sulfate adenylyltransferase  37.5 
 
 
378 aa  261  2e-68  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000117327  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0963  sulfate adenylyltransferase  37.89 
 
 
369 aa  257  2e-67  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000704233  normal  0.355944 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0050  sulfate adenylyltransferase  36.94 
 
 
380 aa  255  8e-67  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1856  sulfate adenylyltransferase  36.52 
 
 
578 aa  241  2e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0255  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  36.75 
 
 
577 aa  238  1e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.537615 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1575  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  36.75 
 
 
587 aa  238  2e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0227  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  36.75 
 
 
568 aa  238  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.507724  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0707  sulfate adenylyltransferase  35.26 
 
 
406 aa  236  6e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2656  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  35.44 
 
 
691 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1550  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  36.15 
 
 
569 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3340  sulfate adenylyltransferase  35.48 
 
 
690 aa  234  2.0000000000000002e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10273  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4308  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  36.39 
 
 
569 aa  234  3e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0612  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  36.48 
 
 
572 aa  233  5e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.398101  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3336  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  35.4 
 
 
578 aa  230  3e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.442858 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1573  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  34.03 
 
 
582 aa  226  4e-58  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1078  sulfate adenylyltransferase  34.95 
 
 
420 aa  220  3.9999999999999997e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000174228  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04769  Sulfate adenylyltransferase (EC 2.7.7.4)(Sulfate adenylate transferase)(SAT)(ATP-sulfurylase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q12555]  35.28 
 
 
574 aa  207  3e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03560  phosphoadenosine-phosphosulfate synthase (PAPS) bifunctional enzyme, putative  35.41 
 
 
581 aa  206  9e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.163154  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0696  Sulfate adenylyltransferase., Adenylyl-sulfate kinase  34.15 
 
 
557 aa  202  8e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0250735  unclonable  0.000000000138306 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0539  sulfate adenylyltransferase, putative/adenylylsulfate kinase  34.15 
 
 
557 aa  202  8e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03071  ATP-sulfurylase  34.18 
 
 
405 aa  196  6e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1596  ATP-sulfurylase  34.43 
 
 
416 aa  196  8.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75451  Sulfate adenylyltransferase (Sulfate adenylate transferase) (SAT) (ATP-sulfurylase)  34 
 
 
523 aa  196  8.000000000000001e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.20752  normal  0.0971418 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0300  sulfate adenylyltransferase  34.09 
 
 
390 aa  194  3e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02491  ATP-sulfurylase  34.01 
 
 
390 aa  192  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0714  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  31.88 
 
 
585 aa  189  5e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2044  ATP-sulfurylase  33.84 
 
 
390 aa  189  7e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_42282  predicted protein  34.18 
 
 
383 aa  188  1e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02591  ATP-sulfurylase  32.83 
 
 
391 aa  185  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23841  ATP-sulfurylase  34.27 
 
 
390 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.114558 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0818  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  31.68 
 
 
553 aa  183  4.0000000000000006e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0274  sulfate adenylyltransferase  30.75 
 
 
458 aa  181  2.9999999999999997e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000435649  hitchhiker  0.000000829155 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02481  ATP-sulfurylase  31.3 
 
 
391 aa  179  8e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.256568  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1772  Sulfate adenylyltransferase  29.83 
 
 
419 aa  179  9e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.88152  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37879  ATP sulfurylase (sulfate adenylyltransferase)  33.59 
 
 
394 aa  176  5e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.624538  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0229  ATP-sulfurylase  30.56 
 
 
391 aa  174  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02491  ATP-sulfurylase  29.68 
 
 
391 aa  173  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.23115  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1712  sulfate adenylyltransferase  29.44 
 
 
451 aa  172  1e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1511  sulfate adenylyltransferase  29.84 
 
 
442 aa  171  3e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.114559  normal  0.599485 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1424  sulfate adenylyltransferase  32.54 
 
 
453 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0496453 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1013  sulfate adenylyltransferase  31.88 
 
 
570 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1240  sulfate adenylyltransferase  29.87 
 
 
456 aa  159  1e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2034  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  29.29 
 
 
571 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000871956  decreased coverage  0.0000299137 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0210  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  31.1 
 
 
544 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.189837 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1489  Sulfate adenylyltransferase  26.07 
 
 
394 aa  114  3e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2207  binfunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  28.17 
 
 
270 aa  111  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1709  Sulfate adenylyltransferase  25.37 
 
 
397 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4403  Sulfate adenylyltransferase  26.6 
 
 
298 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_19901  predicted protein  26.81 
 
 
900 aa  101  3e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>