29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0527 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0527  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  337  8e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.222006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0068  heptaprenyl diphosphate synthase component I  66.47 
 
 		 176 aa  216  1e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0773  Heptaprenyl diphosphate synthase component I  62.71 
 
 		 183 aa  179  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0124947  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0351  heptaprenyl diphosphate synthase component I  47.65 
 
 		 181 aa  118  3.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2908  Heptaprenyl diphosphate synthase component I  50.97 
 
 		 170 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.634002  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0037  hypothetical protein  42.96 
 
 		 196 aa  95.1  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2404  Heptaprenyl diphosphate synthase component I  52.17 
 
 		 190 aa  82.8  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.604994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1955  heptaprenyl diphosphate synthase component I  37.11 
 
 		 184 aa  73.6  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0235  heptaprenyl diphosphate synthase component I  36.24 
 
 		 169 aa  72  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0511  Heptaprenyl diphosphate synthase component I  35.34 
 
 		 177 aa  64.7  0.0000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00260185  decreased coverage  0.0000000000443177 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21280  predicted membrane protein  35.93 
 
 		 408 aa  58.5  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0213  heptaprenyl diphosphate synthase component I  25.53 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14270  heptaprenyl diphosphate synthase component I  34.65 
 
 		 175 aa  57.8  0.00000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  6.02688e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2361  hypothetical protein  32.67 
 
 		 171 aa  57.4  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1320  Heptaprenyl diphosphate synthase component I  29.25 
 
 		 177 aa  55.5  0.0000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000587453  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1525  Heptaprenyl diphosphate synthase component I  26.11 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0348  Heptaprenyl diphosphate synthase component I  30.18 
 
 		 177 aa  52.4  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1463  heptaprenyl diphosphate synthase component I  25.88 
 
 		 173 aa  50.4  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1501  Heptaprenyl diphosphate synthase component I  27.97 
 
 		 207 aa  48.5  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000102642  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1529  heptaprenyl diphosphate synthase component I  29.29 
 
 		 157 aa  48.5  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000681929  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1098  Heptaprenyl diphosphate synthase component I  30.4 
 
 		 177 aa  46.2  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00124747  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1218  heptaprenyl diphosphate synthase component I  29.49 
 
 		 181 aa  46.2  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1237  heptaprenyl diphosphate synthase component I  28.85 
 
 		 181 aa  45.1  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1464  hypothetical protein  28.46 
 
 		 176 aa  44.3  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0347661  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1926  hypothetical protein  29.27 
 
 		 362 aa  43.1  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.777208  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0563  heptaprenyl diphosphate synthase component I  33.02 
 
 		 170 aa  43.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.752463  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0671  heptaprenyl diphosphate synthase component I  27.41 
 
 		 184 aa  42  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00676924  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3701  heptaprenyl diphosphate synthase component I  32.48 
 
 		 168 aa  42  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00431641  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2189  Heptaprenyl diphosphate synthase component I  23.03 
 
 		 176 aa  42  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0420355  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>