163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_R0016 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_R0016  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000514764  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0035  tRNA-Arg  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000000581838  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  89.61 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0473563  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0034  tRNA-Arg  89.61 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000100399  hitchhiker  0.00520953 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0071  tRNA-Arg  89.61 
 
 
76 bp  81.8  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0216295  normal  0.909849 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0062  tRNA-Arg  91.53 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0906817  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0033  tRNA-Arg  90.16 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000397698  normal  0.298215 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0050  tRNA-Arg  87.5 
 
 
77 bp  71.9  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000128438 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0041  tRNA-Arg  87.5 
 
 
77 bp  71.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000701691  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0023  tRNA-Arg  89.83 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.45343  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0058  tRNA-Arg  87.84 
 
 
78 bp  67.9  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0048  tRNA-Arg  89.66 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0022  tRNA-Arg  91.38 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000193997 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0771  tRNA-Arg  89.47 
 
 
79 bp  65.9  0.000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0055  tRNA-Arg  85.71 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000183529  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19600  tRNA-Arg  91.23 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0108959  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0042  tRNA-Arg  91.23 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0038  tRNA-Arg  85.71 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000250994  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0056  tRNA-Lys  93.62 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240873  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0844  tRNA-Arg  87.3 
 
 
79 bp  61.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.998646  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0016  tRNA-Arg  87.3 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.625219  normal  0.104037 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0056  tRNA-Arg  87.93 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000671008  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0042  tRNA-Arg  91.3 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000000705596  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0032  tRNA-Arg  87.72 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.191014  normal  0.309777 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0065  tRNA-Arg  87.72 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000631385  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0029  tRNA-Arg  88.68 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0007  tRNA-Arg  84.42 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.688543  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0023  tRNA-Arg  84.42 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000416946  unclonable  9.7747e-19 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0004  tRNA-Arg  88.68 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0084  tRNA-Arg  88.68 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000200461  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0022  tRNA-Arg  84.42 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000850812  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0038  tRNA-Arg  87.72 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.495611  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0015  tRNA-Arg  91.11 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0299622  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0022  tRNA-Arg  84.42 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000177446  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0023  tRNA-Lys  90.91 
 
 
76 bp  56  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06510  tRNA-Arg  89.58 
 
 
76 bp  56  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000338303  normal  0.349036 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0036  tRNA-Arg  90.91 
 
 
74 bp  56  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  1.49468e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0042  tRNA-Lys  90.91 
 
 
75 bp  56  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000336952  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0009  tRNA-Arg  86.44 
 
 
77 bp  54  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0052  tRNA-Lys  91.49 
 
 
73 bp  54  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00451964  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0037  tRNA-Arg  84.51 
 
 
77 bp  54  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.678102  normal  0.176002 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0003  tRNA-Arg  86.21 
 
 
77 bp  52  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0088  tRNA-Arg  92.11 
 
 
77 bp  52  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.706466  normal  0.421027 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1416  tRNA-Arg  86.21 
 
 
77 bp  52  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0042  tRNA-Arg  86.21 
 
 
77 bp  52  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.15622 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0025  tRNA-Arg  84.29 
 
 
74 bp  52  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000633418  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0001  tRNA-Met  85.48 
 
 
77 bp  52  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0001  tRNA-Met  85.48 
 
 
77 bp  52  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.764109  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0026  tRNA-Lys  90.48 
 
 
73 bp  52  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Arg-2  tRNA-Arg  83.12 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0012  tRNA-Lys  87.72 
 
 
76 bp  50.1  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0067  tRNA-Arg  83.12 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0624  tRNA-Arg  85.96 
 
 
79 bp  50.1  0.00008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00406719  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0052  tRNA-Arg  90.24 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000000819113  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA46  tRNA-Arg  85.96 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.198158  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06840  tRNA-Lys  86.89 
 
 
76 bp  50.1  0.00008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0035  tRNA-Lys  87.72 
 
 
76 bp  50.1  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.206932  normal  0.941173 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna45  tRNA-Arg  83.12 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0023  tRNA-Arg  84.38 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0598975  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0021  tRNA-Lys  87.5 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.682911  normal  0.0277835 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0023  tRNA-Arg  83.82 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.2030600000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0047  tRNA-Thr  89.58 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0058  tRNA-Arg  85.71 
 
 
79 bp  48.1  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0048  tRNA-Lys  85.71 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0058  tRNA-Arg  85.71 
 
 
79 bp  48.1  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0012  tRNA-Arg  84.38 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.255284 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0011  tRNA-Lys  87.5 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0532  tRNA-Thr  86.44 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.7224099999999997e-31 
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  88.37 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000427256  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0002  tRNA-Arg  96.3 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.259161  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5678  tRNA-Thr  86.44 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000591942  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5717  tRNA-Thr  86.44 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0497374  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5731  tRNA-Thr  86.44 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000447208  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  86.44 
 
 
79 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000810946  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Thr-3  tRNA-Thr  86.44 
 
 
79 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0015534  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Thr-4  tRNA-Thr  86.44 
 
 
79 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000512626  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  86.44 
 
 
79 bp  46.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Thr-6  tRNA-Thr  86.44 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000599237  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  86.44 
 
 
79 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000228312  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  86.44 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.181325  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Thr-4  tRNA-Thr  86.44 
 
 
79 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000285821  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0013  tRNA-Lys  88.37 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.882004  normal 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  86.44 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000472522  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Thr-3  tRNA-Thr  86.44 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000298609  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Thr-4  tRNA-Thr  86.44 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0435847  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Thr-5  tRNA-Thr  86.44 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000791725  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5740  tRNA-Thr  86.44 
 
 
78 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00013213  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4770  tRNA-Thr  86.44 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000025693  hitchhiker  6.21743e-16 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0015  tRNA-Arg  83.58 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000291538  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4563  tRNA-Thr  86.44 
 
 
78 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000215679  normal  0.0839515 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0010  tRNA-Thr  86.44 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000409146  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0045  tRNA-Thr  86.44 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0061  tRNA-Thr  86.44 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5818  tRNA-Thr  86.44 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000508092  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0010  tRNA-Thr  86.44 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000231874  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0045  tRNA-Thr  86.44 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0227  tRNA-Thr  86.44 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000274573  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0039  tRNA-Lys  88.37 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0030  tRNA-Lys  88.37 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0471674  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0096  tRNA-Thr  86.44 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00156576  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>