281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0046 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_0046  Tetrapyrrole biosynthesis, glutamyl-tRNA reductase-like protein  100 
 
 
287 aa  577  1e-164  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.627045  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08301  glutamyl-tRNA reductase  24.51 
 
 
436 aa  72.4  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08281  glutamyl-tRNA reductase  24.68 
 
 
436 aa  71.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1374  glutamyl-tRNA reductase  30.53 
 
 
440 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143142  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1362  glutamyl-tRNA reductase  29.53 
 
 
446 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0249  glutamyl-tRNA reductase  27.54 
 
 
410 aa  70.9  0.00000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0776  glutamyl-tRNA reductase  23.61 
 
 
436 aa  70.1  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  28.1 
 
 
443 aa  68.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2493  glutamyl-tRNA reductase  30.4 
 
 
446 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1296  glutamyl-tRNA reductase  28.51 
 
 
425 aa  68.2  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.353465  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1254  glutamyl-tRNA reductase  28.29 
 
 
432 aa  68.2  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.094771  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1459  glutamyl-tRNA reductase  30 
 
 
446 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1228  glutamyl-tRNA reductase  26.74 
 
 
432 aa  67.4  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2088  glutamyl-tRNA reductase  32.6 
 
 
343 aa  66.2  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.225095 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16841  glutamyl-tRNA reductase  27.71 
 
 
436 aa  66.2  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3544  glutamyl-tRNA reductase  28.49 
 
 
414 aa  65.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.037813  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0706  glutamyl-tRNA reductase  22.31 
 
 
368 aa  64.7  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1892  glutamyl-tRNA reductase  26.18 
 
 
460 aa  64.7  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5878  glutamyl-tRNA reductase  25.99 
 
 
446 aa  64.3  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.179812  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0685  glutamyl-tRNA reductase  24.91 
 
 
398 aa  63.9  0.000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.310076  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  25.6 
 
 
441 aa  63.9  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1590  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  26.59 
 
 
461 aa  62.8  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08151  glutamyl-tRNA reductase  24.35 
 
 
435 aa  62.8  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.374123  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0317  glutamyl-tRNA reductase  25.84 
 
 
395 aa  61.6  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0174  glutamyl-tRNA reductase  25.84 
 
 
441 aa  61.6  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08061  glutamyl-tRNA reductase  25.5 
 
 
441 aa  62  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.752768  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  24.79 
 
 
458 aa  61.2  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2026  glutamyl-tRNA reductase  32.52 
 
 
425 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.244155  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1979  glutamyl-tRNA reductase  32.91 
 
 
422 aa  61.2  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.001246  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09941  glutamyl-tRNA reductase  24.32 
 
 
435 aa  60.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.521011 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1528  glutamyl-tRNA reductase  29.23 
 
 
424 aa  60.8  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0581  glutamyl-tRNA reductase  31.25 
 
 
435 aa  60.5  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.226139 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1423  glutamyl-tRNA reductase  32.89 
 
 
418 aa  60.1  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.40052  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2492  glutamyl-tRNA reductase  34.67 
 
 
416 aa  60.1  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.59007  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2473  glutamyl-tRNA reductase  33.11 
 
 
414 aa  60.1  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3689  glutamyl-tRNA reductase  33.79 
 
 
416 aa  59.7  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  26.21 
 
 
434 aa  60.1  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  25.41 
 
 
464 aa  59.3  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2211  glutamyl-tRNA reductase  34.42 
 
 
432 aa  59.3  0.00000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.271306  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0993  glutamyl-tRNA reductase  29.65 
 
 
449 aa  59.3  0.00000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0851  glutamyl-tRNA reductase  27.3 
 
 
426 aa  59.3  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.307966  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  25.1 
 
 
434 aa  58.9  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0510  glutamyl-tRNA reductase  25.29 
 
 
421 aa  58.9  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0503  glutamyl-tRNA reductase  25.2 
 
 
434 aa  58.5  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000781545  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  25.31 
 
 
434 aa  58.2  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0722  glutamyl-tRNA reductase  33.33 
 
 
427 aa  58.2  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.419682 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004204  glutamyl-tRNA reductase  32.61 
 
 
418 aa  58.2  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000179715  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  24.9 
 
 
443 aa  57.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  25.31 
 
 
434 aa  57.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3238  glutamyl-tRNA reductase  24.02 
 
 
438 aa  57.4  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.173569  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0870  glutamyl-tRNA reductase  27.07 
 
 
454 aa  57.8  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  32.52 
 
 
443 aa  57.4  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2122  glutamyl-tRNA reductase  34.42 
 
 
432 aa  57.4  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0115057  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0286  glutamyl-tRNA reductase  27.14 
 
 
419 aa  57.4  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5475  glutamyl-tRNA reductase  32.28 
 
 
441 aa  57  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  28.64 
 
 
464 aa  57.4  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0265  glutamyl-tRNA reductase  24.54 
 
 
358 aa  57  0.0000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.090274 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  24.21 
 
 
446 aa  57  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01249  glutamyl-tRNA reductase  35.71 
 
 
418 aa  57  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2489  glutamyl-tRNA reductase  33.33 
 
 
419 aa  56.6  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1757  glutamyl-tRNA reductase  38.94 
 
 
419 aa  57  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000105006  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0524  glutamyl-tRNA reductase  34.34 
 
 
443 aa  56.6  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.534347 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3554  glutamyl-tRNA reductase  33.64 
 
 
422 aa  56.2  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0359238  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0810  glutamyl-tRNA reductase  32.35 
 
 
459 aa  56.2  0.0000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  24.5 
 
 
434 aa  55.8  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1051  glutamyl-tRNA reductase  31.76 
 
 
427 aa  55.8  0.0000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00451156  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0091  glutamyl-tRNA reductase  25.78 
 
 
340 aa  55.8  0.0000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0333  glutamyl-tRNA reductase  32.79 
 
 
425 aa  55.5  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0781  glutamyl-tRNA reductase  28.19 
 
 
436 aa  55.5  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.593416  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3501  glutamyl-tRNA reductase  37 
 
 
432 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.451054 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0764  glutamyl-tRNA reductase  27.06 
 
 
428 aa  55.5  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.014297  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1229  glutamyl-tRNA reductase  25.64 
 
 
422 aa  55.1  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000302896  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0776  glutamyl-tRNA reductase  32.67 
 
 
429 aa  55.5  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.163428 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54134  glutamyl-trna reductase  26.1 
 
 
512 aa  55.5  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0214782  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1845  glutamyl-tRNA reductase  28.74 
 
 
445 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.346182 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3127  glutamyl-tRNA reductase  28.38 
 
 
416 aa  54.3  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000225636  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4584  glutamyl-tRNA reductase  25.27 
 
 
444 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4205  glutamyl-tRNA reductase  31.79 
 
 
423 aa  54.3  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0650  glutamyl-tRNA reductase  25.27 
 
 
444 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0789  glutamyl-tRNA reductase  29.65 
 
 
418 aa  54.7  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143605  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2642  glutamyl-tRNA reductase  25.68 
 
 
420 aa  54.7  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2564  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  31.45 
 
 
423 aa  54.7  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6499  glutamyl-tRNA reductase  23.13 
 
 
440 aa  54.7  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.595047 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1588  glutamyl-tRNA reductase  24.26 
 
 
382 aa  54.7  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.082883  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1618  glutamyl-tRNA reductase  25.4 
 
 
440 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5315  glutamyl-tRNA reductase  29.05 
 
 
422 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3738  glutamyl-tRNA reductase  29.01 
 
 
416 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000445074  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4557  glutamyl-tRNA reductase  25.27 
 
 
444 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3460  glutamyl-tRNA reductase  32.23 
 
 
426 aa  53.9  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000782916  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1043  glutamyl-tRNA reductase  30.67 
 
 
421 aa  54.3  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4749  glutamyl-tRNA reductase  35.14 
 
 
428 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168503  normal  0.0710553 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2132  glutamyl-tRNA reductase  23.29 
 
 
447 aa  53.9  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2929  glutamyl-tRNA reductase  31.17 
 
 
432 aa  53.9  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3547  glutamyl-tRNA reductase  29.01 
 
 
416 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000884413  decreased coverage  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4311  glutamyl-tRNA reductase  25.27 
 
 
443 aa  53.5  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61710  glutamyl-tRNA reductase  29.05 
 
 
422 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624585  normal  0.0109768 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2381  glutamyl-tRNA reductase  34.38 
 
 
443 aa  53.9  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.370864 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0800  glutamyl-tRNA reductase  29.01 
 
 
416 aa  54.3  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000139394  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0695  glutamyl-tRNA reductase  29.01 
 
 
416 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000150429  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2361  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  27.22 
 
 
429 aa  53.9  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>