More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1255 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1255  50S ribosomal protein L20  100 
 
 
118 aa  231  3e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0057765  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1201  50S ribosomal protein L20  97.46 
 
 
118 aa  201  4e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130476  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0925  50S ribosomal protein L20  77.78 
 
 
118 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00218095  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0711  50S ribosomal protein L20  72.65 
 
 
121 aa  153  8e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000004038  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0662  50S ribosomal protein L20  70.94 
 
 
118 aa  150  5.9999999999999996e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000854967  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0449  50S ribosomal protein L20  57.76 
 
 
118 aa  130  3.9999999999999996e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000370171  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2144  50S ribosomal protein L20  57.39 
 
 
119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000000208623  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1856  50S ribosomal protein L20  57.39 
 
 
119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000191565  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1303  50S ribosomal protein L20  56.52 
 
 
133 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.201739  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1092  50S ribosomal protein L20  53.04 
 
 
118 aa  128  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000110509  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1206  50S ribosomal protein L20  55.17 
 
 
119 aa  125  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000522592  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2052  50S ribosomal protein L20  55.65 
 
 
119 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00996082  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5481  ribosomal protein L20  54.7 
 
 
129 aa  124  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402875  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3259  50S ribosomal protein L20  54.78 
 
 
118 aa  123  8.000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000143022  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15180  LSU ribosomal protein L20P  54.78 
 
 
117 aa  123  9e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00260509  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0487  50S ribosomal protein L20  53.85 
 
 
118 aa  122  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000568702  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0203  50S ribosomal protein L20  53.91 
 
 
119 aa  122  1e-27  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1318  ribosomal protein L20  55.56 
 
 
128 aa  122  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.231483  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0217  50S ribosomal protein L20  52.99 
 
 
120 aa  122  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000274969  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0800  50S ribosomal protein L20  55.65 
 
 
119 aa  122  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21890  LSU ribosomal protein L20P  53.91 
 
 
126 aa  122  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.509644  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2170  ribosomal protein L20  53.91 
 
 
121 aa  122  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00052538  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1235  ribosomal protein L20  55.65 
 
 
117 aa  121  3e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000439682  normal  0.0943757 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1342  ribosomal protein L20  55.75 
 
 
117 aa  121  3e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00397655  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2416  ribosomal protein L20  54.7 
 
 
126 aa  121  3e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2658  50S ribosomal protein L20  54.78 
 
 
119 aa  121  4e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000886061  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25670  LSU ribosomal protein L20P  52.99 
 
 
125 aa  121  4e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.826175  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2141  ribosomal protein L20  52.99 
 
 
125 aa  120  5e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0032438  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0046  ribosomal protein L20  53.51 
 
 
117 aa  120  5e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4404  50S ribosomal protein L20  53.04 
 
 
118 aa  120  5e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000358516  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1615  50S ribosomal protein L20  52.59 
 
 
118 aa  120  5e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000423443  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05610  ribosomal protein L20  53.45 
 
 
119 aa  120  5e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312556  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2398  ribosomal protein L20  52.59 
 
 
118 aa  120  7e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0041866  normal  0.275247 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1381  ribosomal protein L20  56.41 
 
 
120 aa  120  7e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000161333  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1441  50S ribosomal protein L20  54.24 
 
 
139 aa  120  7e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000287682  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1267  50S ribosomal protein L20  54.31 
 
 
124 aa  120  7e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.369057 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4142  ribosomal protein L20  53.85 
 
 
135 aa  120  8e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000151582  hitchhiker  0.000263316 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4681  50S ribosomal protein L20  52.17 
 
 
118 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000654651  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4704  50S ribosomal protein L20  52.17 
 
 
118 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000111354  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4469  50S ribosomal protein L20  52.17 
 
 
118 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000222511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4304  50S ribosomal protein L20  52.17 
 
 
118 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.71931e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4315  50S ribosomal protein L20  52.17 
 
 
118 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000569694  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3069  ribosomal protein L20  53.85 
 
 
123 aa  119  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1482  50S ribosomal protein L20  55.56 
 
 
153 aa  119  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000928711 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4817  50S ribosomal protein L20  52.17 
 
 
118 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000468944  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0556  50S ribosomal protein L20  52.17 
 
 
118 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000506915  hitchhiker  1.2511e-24 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4688  50S ribosomal protein L20  52.17 
 
 
118 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.35886e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4697  50S ribosomal protein L20  52.17 
 
 
118 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443116  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3326  50S ribosomal protein L20  53.91 
 
 
129 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.588527  normal  0.356317 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl190  50S ribosomal protein L20  52.99 
 
 
120 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000102569  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3037  ribosomal protein L20  53.57 
 
 
127 aa  118  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.206291  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1414  50S ribosomal protein L20  53.04 
 
 
117 aa  118  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000403686  normal  0.489901 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1479  50S ribosomal protein L20  54.7 
 
 
157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0382376  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14570  LSU ribosomal protein L20P  52.14 
 
 
128 aa  118  3e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf194  50S ribosomal protein L20  54.7 
 
 
119 aa  118  3e-26  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.00718228  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12270  LSU ribosomal protein L20P  52.68 
 
 
163 aa  118  3e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.128357  normal  0.140057 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1821  LSU ribosomal protein L20P  49.57 
 
 
117 aa  117  3.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00014178  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5471  ribosomal protein L20  50.43 
 
 
129 aa  117  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1756  50S ribosomal protein L20  53.45 
 
 
121 aa  117  3.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000228708  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3180  50S ribosomal protein L20  53.64 
 
 
126 aa  117  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0268094  normal  0.168846 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2461  50S ribosomal protein L20  52.99 
 
 
130 aa  117  4.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1736  50S ribosomal protein L20  53.04 
 
 
118 aa  117  6e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000116439  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2383  ribosomal protein L20  53.04 
 
 
126 aa  117  6e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.226272  normal  0.273471 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1770  50S ribosomal protein L20  53.04 
 
 
118 aa  117  6e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000104745  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3041  50S ribosomal protein L20  50.88 
 
 
116 aa  117  7e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000250393  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1242  50S ribosomal protein L20  53.91 
 
 
118 aa  117  7e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000191981  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2994  50S ribosomal protein L20  53.91 
 
 
129 aa  117  7e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170325  normal  0.0515669 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2979  50S ribosomal protein L20  53.91 
 
 
129 aa  117  7e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0348  ribosomal protein L20  50.43 
 
 
118 aa  117  7e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000203448  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3023  50S ribosomal protein L20  53.91 
 
 
129 aa  117  7e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.612405 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1877  50S ribosomal protein L20  54.31 
 
 
130 aa  117  7.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.348784 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3167  ribosomal protein L20  53.57 
 
 
129 aa  116  9e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.406841  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1518  50S ribosomal protein L20  53.57 
 
 
117 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0150794  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0234  50S ribosomal protein L20  52.17 
 
 
127 aa  116  9.999999999999999e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.163315  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1580  50S ribosomal protein L20  52.14 
 
 
119 aa  116  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1223  50S ribosomal protein L20  51.3 
 
 
117 aa  115  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000332435  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6085  50S ribosomal protein L20  52.14 
 
 
127 aa  116  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1730  50S ribosomal protein L20  54.55 
 
 
126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00695308  hitchhiker  0.00143351 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3054  50S ribosomal protein L20  52.14 
 
 
121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22410  LSU ribosomal protein L20P  52.99 
 
 
128 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1105  ribosomal protein L20  53.04 
 
 
128 aa  115  1.9999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0771886  normal  0.917158 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0710  50S ribosomal protein L20  52.59 
 
 
117 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000670695  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2123  50S ribosomal protein L20  53.45 
 
 
119 aa  115  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000359041  normal  0.016896 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2040  50S ribosomal protein L20  51.28 
 
 
129 aa  114  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0971505  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1626  ribosomal protein L20  54.78 
 
 
128 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.75849 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2029  50S ribosomal protein L20  53.45 
 
 
119 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000108915  hitchhiker  0.0000236508 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2017  50S ribosomal protein L20  47.01 
 
 
119 aa  114  5e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0765  50S ribosomal protein L20P  50.43 
 
 
119 aa  114  5e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.9715  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3222  50S ribosomal protein L20  54.31 
 
 
118 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.888026 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2468  50S ribosomal protein L20  54.31 
 
 
118 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0164678  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1970  50S ribosomal protein L20  54.31 
 
 
118 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0648376  hitchhiker  0.00701004 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2802  50S ribosomal protein L20  48.72 
 
 
119 aa  114  6e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2227  50S ribosomal protein L20  55.77 
 
 
117 aa  114  6e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00200707 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01386  50S ribosomal protein L20  48.72 
 
 
119 aa  114  6e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1993  50S ribosomal protein L20  55.77 
 
 
117 aa  114  6e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.708674  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1239  50S ribosomal protein L20  51.72 
 
 
117 aa  114  6e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000443889  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3478  50S ribosomal protein L20  54.31 
 
 
118 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0800064  hitchhiker  0.00881726 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2096  50S ribosomal protein L20  47.01 
 
 
119 aa  114  6e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2625  50S ribosomal protein L20  51.79 
 
 
117 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000948958  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2496  50S ribosomal protein L20  53.45 
 
 
118 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00192283  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>