112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1230 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_1225  RNA-binding protein  100 
 
 		 75 aa  142  2e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000401296  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1230  RNA-binding protein  100 
 
 		 75 aa  142  2e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000705626  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1804  RNA-binding protein  72 
 
 		 74 aa  103  8e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000242663  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0647  RNA-binding protein  62.67 
 
 		 74 aa  95.5  2e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.534792  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0321  RNA-binding protein  55.26 
 
 		 76 aa  81.3  0.000000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000789402  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1089  nucleic acid binding protein  41.89 
 
 		 83 aa  65.9  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000185572  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1980  RNA-binding protein  41.89 
 
 		 78 aa  65.1  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1513  hypothetical protein  45.45 
 
 		 79 aa  63.9  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.155704 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1802  hypothetical protein  45.07 
 
 		 76 aa  60.5  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.116861  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11050  RNA-binding protein (KH domain)  35.14 
 
 		 80 aa  60.5  0.000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0506658  normal  0.0611739 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2308  hypothetical protein  42.25 
 
 		 78 aa  60.1  0.000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000463939  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3422  KH domain-containing protein  42.19 
 
 		 80 aa  58.2  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0313217  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1828  KH domain protein  40.54 
 
 		 80 aa  57.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0800729 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0644  KH domain-containing protein  40 
 
 		 76 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.20541  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2870  KH, type 1  41.33 
 
 		 76 aa  56.2  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000364358  hitchhiker  0.000000513189 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1370  RNA-binding protein (KH domain)  42.11 
 
 		 76 aa  56.6  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209331  normal  0.279466 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3430  KH, type 1, domain protein  41.33 
 
 		 76 aa  56.2  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000151777  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3492  KH, type 1, domain protein  41.33 
 
 		 76 aa  56.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.05823e-30 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2998  hypothetical protein  45.9 
 
 		 77 aa  55.5  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00000253135  normal  0.811405 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3040  hypothetical protein  45.9 
 
 		 77 aa  55.5  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000354702  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3259  hypothetical protein  37.5 
 
 		 80 aa  55.1  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2143  hypothetical protein  45.9 
 
 		 77 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2495  KH domain-containing protein  41.18 
 
 		 75 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000287664  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2182  KH domain-containing protein  39.06 
 
 		 75 aa  55.1  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.161429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2484  hypothetical protein  38.03 
 
 		 82 aa  55.1  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.307356  normal  0.0960176 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2482  hypothetical protein  39.06 
 
 		 80 aa  55.1  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0272988  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0711  nucleic acid binding protein  36.84 
 
 		 77 aa  54.7  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000841646  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0986  KH domain protein  39.06 
 
 		 79 aa  54.7  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.0000000000116002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2222  hypothetical protein  35.94 
 
 		 80 aa  54.7  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000657625 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4007  hypothetical protein  39.06 
 
 		 78 aa  54.3  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0663  hypothetical protein  40 
 
 		 80 aa  53.5  0.0000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.82455  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0768  nucleic acid binding protein  36.84 
 
 		 76 aa  53.5  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000813244  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0030  hypothetical protein  44.07 
 
 		 78 aa  53.1  0.000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.00000268476  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3694  KH domain-containing protein  37.84 
 
 		 75 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000170601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3584  hypothetical protein  37.84 
 
 		 75 aa  53.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  7.1205e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3602  hypothetical protein  37.84 
 
 		 75 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000183566  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3981  kh domain-containing protein  37.84 
 
 		 75 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000103911  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1399  hypothetical protein  36.49 
 
 		 79 aa  53.1  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00422733 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1195  hypothetical protein  39.06 
 
 		 86 aa  53.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.915237 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1471  KH domain protein  37.88 
 
 		 79 aa  53.1  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0670497 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1301  KH domain protein  41.18 
 
 		 75 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000106186  unclonable  4.49317e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3857  KH domain protein  37.84 
 
 		 75 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.50741e-63 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23740  RNA-binding protein (KH domain)  37.31 
 
 		 79 aa  53.1  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.860329  normal  0.190308 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0882  hypothetical protein  44.62 
 
 		 77 aa  52.4  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000154321  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1560  RNA-binding protein  32.39 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0831203 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1097  KH domain-containing protein  38.67 
 
 		 76 aa  52.4  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00599879  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0980  hypothetical protein  36.49 
 
 		 75 aa  52.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.747535  normal  0.258716 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1168  hypothetical protein  40.32 
 
 		 79 aa  52.4  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225392  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2451  KH, type 1  40 
 
 		 76 aa  52.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000946472  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3762  KH domain-containing protein  41.33 
 
 		 76 aa  52  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000539033  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5925  hypothetical protein  35.94 
 
 		 79 aa  51.6  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.159157  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2886  hypothetical protein  42.62 
 
 		 77 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.404491 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3306  RNA-binding protein (KH domain)  40.98 
 
 		 77 aa  51.6  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2223  RNA-binding protein  41.94 
 
 		 77 aa  50.8  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.17627e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1168  RNA-binding protein (KH domain)  37.31 
 
 		 79 aa  50.8  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3885  KH domain-containing protein  36.49 
 
 		 77 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000801997  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3891  KH domain protein  36.49 
 
 		 75 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000683055  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3942  KH domain protein  41.94 
 
 		 75 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0021  hypothetical protein  31.34 
 
 		 78 aa  50.4  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.055536  normal  0.167537 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1618  hypothetical protein  37.84 
 
 		 82 aa  50.4  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0250504  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0968  hypothetical protein  39.34 
 
 		 76 aa  49.7  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000604549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3593  hypothetical protein  33.8 
 
 		 77 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0225  hypothetical protein  40.62 
 
 		 80 aa  50.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.657133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0325  hypothetical protein  30.67 
 
 		 77 aa  49.7  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.851867 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1306  hypothetical protein  37.5 
 
 		 86 aa  50.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3759  hypothetical protein  39.34 
 
 		 76 aa  50.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0453276  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09160  RNA-binding protein (KH domain)  40.62 
 
 		 81 aa  50.1  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.880979  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2084  hypothetical protein  33.8 
 
 		 80 aa  50.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1496  nucleic acid binding protein  36.84 
 
 		 78 aa  48.9  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0525102  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2539  hypothetical protein  33.78 
 
 		 78 aa  48.9  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160005  normal  0.11735 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1379  KH domain protein  40.68 
 
 		 84 aa  48.9  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000155975  normal  0.609629 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07310  nucleic acid binding protein, containing KH domain  40.98 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.97111e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09980  RNA-binding protein (KH domain)  38.33 
 
 		 80 aa  48.1  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.4486  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2024  hypothetical protein  40.98 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000350692  normal  0.0107931 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3666  RNA binding protein  40.32 
 
 		 75 aa  47.8  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000056756  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1288  RNA-binding protein  36.67 
 
 		 75 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1665  RNA-binding protein  36.67 
 
 		 75 aa  47  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00331015  hitchhiker  0.0035897 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09760  hypothetical protein  34.38 
 
 		 79 aa  47  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0801933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3135  KH domain-containing protein  34.38 
 
 		 77 aa  47  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.020256  normal  0.101558 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1966  hypothetical protein  39.68 
 
 		 80 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.179038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2012  hypothetical protein  39.68 
 
 		 80 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.313357 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1946  hypothetical protein  39.68 
 
 		 80 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.801249  normal  0.846266 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4174  hypothetical protein  39.68 
 
 		 80 aa  47  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3191  hypothetical protein  37.7 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.954364  normal  0.892869 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1149  hypothetical protein  30.99 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0258994 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3681  hypothetical protein  42.11 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.989233 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0689  RNA-binding protein (contains KH domain protein)-like protein  38.71 
 
 		 100 aa  47  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000409438  hitchhiker  0.000420996 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2188  hypothetical protein  38.1 
 
 		 80 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0391463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12922  hypothetical protein  33.87 
 
 		 80 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.856852  normal  0.613221 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1093  R-binding protein (contains KH domain)  35.14 
 
 		 80 aa  46.2  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  5.71907e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1415  hypothetical protein  39.39 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00178468  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1965  hypothetical protein  36 
 
 		 75 aa  45.4  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.780518  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1683  hypothetical protein  36 
 
 		 75 aa  45.4  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000180762  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1098  hypothetical protein  47.54 
 
 		 77 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.337348  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1053  hypothetical protein  29.33 
 
 		 77 aa  44.7  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0969  RNA-binding protein  31.58 
 
 		 77 aa  44.7  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000537782  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1198  hypothetical protein  32 
 
 		 75 aa  44.7  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00403857  normal  0.0990302 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1353  RNA-binding protein (contains KH domain)-like protein  32.79 
 
 		 89 aa  43.5  0.0009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000330341  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2054  hypothetical protein  33.33 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000563212  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2673  RNA-binding protein  32.35 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0307943  hitchhiker  0.000000249091 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>