More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0770 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0770  primosomal protein N'  100 
 
 		 736 aa  1485    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0413265  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0747  primosomal protein N'  100 
 
 		 736 aa  1485    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00195838  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1579  primosomal protein N'  38.36 
 
 		 775 aa  533  1e-150  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0276  primosomal protein N'  40.78 
 
 		 742 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.350097  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1430  primosomal protein N'  34.63 
 
 		 764 aa  423  1e-117  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0145325  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1758  primosomal protein N'  32.78 
 
 		 732 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_278  primosomal protein N, (replication factor Y) (superfamily II helicase)  30 
 
 		 815 aa  329  1.0000000000000001e-88  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0311908  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0337  primosomal protein N'  29.07 
 
 		 815 aa  326  8.000000000000001e-88  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.566686  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1038  primosomal protein N'  37.68 
 
 		 724 aa  324  4e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4062  primosomal protein N'  33.33 
 
 		 804 aa  321  3e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.172877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2156  primosome assembly protein PriA  32.78 
 
 		 781 aa  318  2e-85  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1594  primosomal protein N'  32.8 
 
 		 735 aa  313  6.999999999999999e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1061  primosome assembly protein PriA  29.25 
 
 		 804 aa  313  9e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.964371  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1233  primosomal protein N  28.29 
 
 		 802 aa  312  1e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0109325  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1332  primosomal protein N'  30.62 
 
 		 749 aa  311  2e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000143785  normal  0.287743 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3854  primosomal protein N'  35.25 
 
 		 775 aa  311  2e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0030151  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0566  replication restart DNA helicase PriA  29.53 
 
 		 815 aa  311  4e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00911754  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1197  primosome assembly protein PriA  31.59 
 
 		 849 aa  308  2.0000000000000002e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0959  primosomal protein N'  28.59 
 
 		 790 aa  306  8.000000000000001e-82  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1951  primosome assembly protein PriA  33.16 
 
 		 801 aa  306  1.0000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09880  primosomal protein N'  34.31 
 
 		 745 aa  306  1.0000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0896  replication restart DNA helicase PriA  36.67 
 
 		 821 aa  304  3.0000000000000004e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0600783  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3627  primosome assembly protein PriA  29.7 
 
 		 801 aa  304  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3911  primosome assembly protein PriA  29.99 
 
 		 801 aa  302  1e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0786  replication restart DNA helicase PriA  29.76 
 
 		 803 aa  302  1e-80  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.823514  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3916  primosome assembly protein PriA  29.89 
 
 		 801 aa  302  2e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000142044  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1550  primosomal protein N'  29.31 
 
 		 824 aa  301  2e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.764668  normal  0.503728 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2035  transcriptional regulator, TrmB  31.36 
 
 		 817 aa  301  2e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3484  primosomal protein N'  29.28 
 
 		 815 aa  301  4e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3609  primosome assembly protein PriA  29.43 
 
 		 801 aa  300  4e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3882  primosome assembly protein PriA  29.43 
 
 		 801 aa  300  4e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000345063 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3719  primosome assembly protein PriA  29.43 
 
 		 801 aa  300  6e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4006  primosome assembly protein PriA  29.43 
 
 		 801 aa  300  6e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0316  primosomal protein N'  27.98 
 
 		 815 aa  300  9e-80  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0460314  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1515  replication restart DNA helicase PriA  33.95 
 
 		 803 aa  300  9e-80  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0167  primosomal protein N'  30.28 
 
 		 752 aa  299  1e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00132621 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3774  replication restart DNA helicase PriA  29.11 
 
 		 813 aa  299  1e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0372203  normal  0.148217 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1396  primosome assembly protein PriA  33.9 
 
 		 798 aa  299  1e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3121  primosome assembly protein PriA  31.91 
 
 		 825 aa  299  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2493  primosomal protein N'  32.77 
 
 		 792 aa  298  3e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3691  primosome assembly protein PriA  31.99 
 
 		 801 aa  298  3e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0524  hypothetical protein  35.17 
 
 		 832 aa  298  3e-79  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.669922 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1173  primosomal protein N'  32.21 
 
 		 715 aa  297  5e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2792  primosomal protein N'  29.57 
 
 		 745 aa  296  7e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.240357 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1276  primosome assembly protein PriA  31.99 
 
 		 801 aa  295  1e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3377  primosomal protein N'  28.48 
 
 		 831 aa  296  1e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0159  primosome assembly protein PriA  29.78 
 
 		 753 aa  295  2e-78  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0760  primosomal protein N'  33.33 
 
 		 798 aa  295  2e-78  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000570984  hitchhiker  0.00000745488 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3967  primosome assembly protein PriA  31.81 
 
 		 801 aa  295  3e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.841786  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2520  primosome assembly protein PriA  29.63 
 
 		 801 aa  294  4e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0370343  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0672  primosomal protein N'  27.61 
 
 		 835 aa  293  8e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00593856 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0779  primosomal protein N'  32.27 
 
 		 802 aa  292  1e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0185  primosomal protein N'  29.96 
 
 		 752 aa  293  1e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6575  primosomal protein N'  33.82 
 
 		 815 aa  292  1e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1527  primosomal protein N'  27.85 
 
 		 818 aa  293  1e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.590711  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09963  primosomal protein N' (replication factor Y)  34.11 
 
 		 815 aa  291  2e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1271  primosomal protein N'  29.19 
 
 		 802 aa  290  6e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.58065  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1296  primosomal protein N'  29.19 
 
 		 802 aa  290  6e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1173  replication restart DNA helicase PriA  35.42 
 
 		 809 aa  290  8e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0315  primosome assembly protein PriA  33.33 
 
 		 796 aa  289  1e-76  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.169363  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0025  primosomal protein N'  33.59 
 
 		 679 aa  289  1e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3986  primosomal protein N'  30.72 
 
 		 848 aa  288  2e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0567  primosome assembly protein PriA  31.36 
 
 		 836 aa  288  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.973651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2315  primosomal protein N'  31.82 
 
 		 747 aa  288  4e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.101119  hitchhiker  0.00122833 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2915  primosome assembly protein PriA  29.97 
 
 		 914 aa  287  4e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.1983  normal  0.221114 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1716  primosome assembly protein PriA  32.68 
 
 		 731 aa  287  5.999999999999999e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0764  primosomal protein N'  32.17 
 
 		 736 aa  286  7e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386533  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0043  primosomal protein N'  33.47 
 
 		 738 aa  286  8e-76  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.401318 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0161  primosome assembly protein PriA  30.51 
 
 		 835 aa  286  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.139003 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1703  primosomal protein N'  31.5 
 
 		 732 aa  284  4.0000000000000003e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1998  primosome assembly protein PriA  33.2 
 
 		 731 aa  284  4.0000000000000003e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2594  primosomal protein N`  29.28 
 
 		 733 aa  283  1e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1987  primosomal protein N' (replication factor Y)  31.03 
 
 		 774 aa  282  1e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0374  primosomal protein N'  29.82 
 
 		 754 aa  282  1e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0607469  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2597  primosomal protein N'(replication factor Y)( helicase)  33.01 
 
 		 815 aa  282  1e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.510107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0165  primosome assembly protein PriA  29.89 
 
 		 843 aa  282  2e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0764  primosomal protein N'  32.23 
 
 		 736 aa  281  2e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.129915  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1123  primosome assembly protein PriA  31.03 
 
 		 730 aa  281  3e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0274294  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3737  replication restart DNA helicase PriA  31.38 
 
 		 738 aa  280  6e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228486 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3337  primosomal protein n  29.56 
 
 		 746 aa  279  1e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0128  primosomal protein n`  32.68 
 
 		 751 aa  278  2e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4961  primosome assembly protein PriA  32.16 
 
 		 739 aa  278  3e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0770  primosomal protein N'  31.1 
 
 		 735 aa  277  5e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.654251  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2490  primosomal protein N'  30.5 
 
 		 660 aa  277  6e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5138  primosome assembly protein PriA  34.37 
 
 		 739 aa  277  6e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0727  replication restart DNA helicase PriA  32.23 
 
 		 736 aa  276  7e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.539418  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0651  primosome assembly protein PriA  29.41 
 
 		 806 aa  276  8e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1430  primosomal protein N'  27.28 
 
 		 812 aa  276  9e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5088  primosome assembly protein PriA  32.16 
 
 		 739 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1319  primosomal protein N'  36.99 
 
 		 805 aa  276  1.0000000000000001e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.342383  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1033  primosome assembly protein PriA  29.14 
 
 		 732 aa  275  2.0000000000000002e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0534  primosomal protein N'  30.75 
 
 		 742 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.680664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0377  primosome assembly protein PriA  32.17 
 
 		 746 aa  274  3e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0764  primosomal protein N'  31.3 
 
 		 732 aa  275  3e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000407652  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3657  primosome assembly protein PriA  32.95 
 
 		 738 aa  274  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5549  primosomal protein N'  33.53 
 
 		 858 aa  274  4.0000000000000004e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.293579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0014  primosomal protein N'  32.26 
 
 		 660 aa  274  4.0000000000000004e-72  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1374  primosomal protein N'  32.21 
 
 		 768 aa  274  5.000000000000001e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228362  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001745  helicase PriA essential for oriC/DnaA-independent DNA replication  29.85 
 
 		 733 aa  273  6e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.579492  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00727  primosome assembly protein PriA  29.5 
 
 		 733 aa  274  6e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>