More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0477 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_2106  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  41.06 
 
 		 1384 aa  688    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0644464  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0579  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  48.7 
 
 		 1183 aa  894    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0603  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  48.66 
 
 		 1272 aa  808    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0097  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  50 
 
 		 1177 aa  919    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0578  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  48.88 
 
 		 1240 aa  816    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.219767  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2421  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  53.29 
 
 		 1167 aa  818    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.142717  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0183  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  49.11 
 
 		 1183 aa  896    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0702536  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1066  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  41.33 
 
 		 1358 aa  692    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.369234  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16651  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  53.92 
 
 		 1097 aa  858    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0102  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  50.1 
 
 		 1177 aa  919    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.907147  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0160  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  48.27 
 
 		 1191 aa  880    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1243  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  40.94 
 
 		 1377 aa  680    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.510388  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10681  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  51.88 
 
 		 1178 aa  874    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2196  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  40.78 
 
 		 1384 aa  685    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.035759  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0102  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  50.1 
 
 		 1177 aa  919    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0098  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  50.1 
 
 		 1177 aa  919    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl598  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  45.51 
 
 		 1284 aa  808    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0096  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  50.1 
 
 		 1177 aa  919    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3687  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  48.01 
 
 		 1278 aa  901    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0741  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  54.53 
 
 		 1096 aa  851    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2724  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  58.79 
 
 		 1250 aa  936    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.280863  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0974  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  53.94 
 
 		 1070 aa  867    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000799261  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0312  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  39.51 
 
 		 1427 aa  636    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0286177 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2654  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  56.38 
 
 		 1155 aa  898    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.679256  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1016  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  52.84 
 
 		 1095 aa  850    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0988562  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16071  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  54.05 
 
 		 1096 aa  855    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.614693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0477  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  100 
 
 		 1263 aa  2557    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0965  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  49.72 
 
 		 1187 aa  841    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4207  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  49.02 
 
 		 1117 aa  851    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0680  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  54.36 
 
 		 1171 aa  876    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1782  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  71.89 
 
 		 1182 aa  1187    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0244  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  57.23 
 
 		 1217 aa  678    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0694  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  41.93 
 
 		 1368 aa  654    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.46808  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1751  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  53.84 
 
 		 1103 aa  852    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0605  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  53.92 
 
 		 1097 aa  847    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0357  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  40.1 
 
 		 1300 aa  653    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2067  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  53.42 
 
 		 1097 aa  839    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.883429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1947  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  41.04 
 
 		 1377 aa  680    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2997  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  39.54 
 
 		 1375 aa  650    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1265  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  46.97 
 
 		 1229 aa  754    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716616 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0102  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  50.1 
 
 		 1177 aa  919    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1578  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  51.14 
 
 		 1097 aa  864    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.702205  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1522  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  53.54 
 
 		 1100 aa  852    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.18343 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0070  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  46.28 
 
 		 1287 aa  827    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1598  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  47.13 
 
 		 1245 aa  817    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0310456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2468  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  61.59 
 
 		 1141 aa  950    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716537 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0216  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  56.25 
 
 		 1183 aa  929    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.846031  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0573  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  53.16 
 
 		 1141 aa  894    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0186  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  51.47 
 
 		 1174 aa  944    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.648806 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6057  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  53.86 
 
 		 1141 aa  894    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0749  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  40.19 
 
 		 1384 aa  686    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.910245  normal  0.541943 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2036  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  39.16 
 
 		 1372 aa  639    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.947917 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0462  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  98.5 
 
 		 1263 aa  2531    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0490  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  39.8 
 
 		 1362 aa  656    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000121478 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1016  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  49.35 
 
 		 1122 aa  848    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04361  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  54.05 
 
 		 1097 aa  855    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1339  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  40.62 
 
 		 1497 aa  701    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16891  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  52.96 
 
 		 1097 aa  862    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0391  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  53.55 
 
 		 1155 aa  827    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0320  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  39.8 
 
 		 1362 aa  656    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0565  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  48.59 
 
 		 1183 aa  889    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4325  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  52.89 
 
 		 1143 aa  879    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.716075  normal  0.0767673 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4676  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  37.7 
 
 		 1489 aa  645    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.765247  hitchhiker  0.00735061 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0636  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  51.06 
 
 		 1152 aa  824    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0502  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  64.86 
 
 		 1172 aa  1204    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.145308  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04530  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  40.47 
 
 		 1383 aa  696    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0997174  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16761  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  54.05 
 
 		 1097 aa  862    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0969  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  52.1 
 
 		 1166 aa  878    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2162  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  57.11 
 
 		 1141 aa  882    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.906254  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2679  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  39.71 
 
 		 1303 aa  647    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.20242  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2722  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  51.56 
 
 		 1234 aa  968    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.304828  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2408  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  51.56 
 
 		 1234 aa  967    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0154863  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18861  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  52.96 
 
 		 1095 aa  853    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.816976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2939  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  49.34 
 
 		 1102 aa  831    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0207  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  53.28 
 
 		 1145 aa  953    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000841151  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0997  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  52.1 
 
 		 1172 aa  878    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3364  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  40.65 
 
 		 1358 aa  674    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.209145 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2341  DNA-directed RNA polymerase  57.46 
 
 		 1107 aa  915    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0355  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  65.04 
 
 		 1187 aa  1104    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0133  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  50.1 
 
 		 1177 aa  919    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000446144  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1205  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  40.94 
 
 		 1377 aa  679    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.130962  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1981  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  48.75 
 
 		 1196 aa  884    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1375  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit/140 kD subunit  47.09 
 
 		 1197 aa  859    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0284  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  48.19 
 
 		 1212 aa  872    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000140323 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1825  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  47.36 
 
 		 1202 aa  855    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1845  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  48.54 
 
 		 1193 aa  886    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2984  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  55.42 
 
 		 1171 aa  869    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.816436  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3933  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  53.37 
 
 		 1143 aa  884    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.854688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0859  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  52.47 
 
 		 1238 aa  998    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.111826  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5097  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  51.58 
 
 		 1174 aa  871    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0605321 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0299  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  56.31 
 
 		 1169 aa  896    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.289387 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0177  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  39.17 
 
 		 1343 aa  637    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0862378  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0233  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  40.08 
 
 		 1312 aa  654    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0123  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  49.79 
 
 		 1177 aa  917    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00273838  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0711  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  53.77 
 
 		 1166 aa  877    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0987  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  52.1 
 
 		 1172 aa  877    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.65546 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1257  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  52.11 
 
 		 1161 aa  877    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.568598 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1492  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  47.07 
 
 		 1202 aa  870    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf212  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  42.11 
 
 		 1197 aa  728    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0865  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  40.3 
 
 		 1381 aa  660    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>