217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3856 on replicon NC_008042
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008042  TM1040_3856  RNA polymerase ECF-subfamily sigma factor  100 
 
 		 415 aa  839    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3349  RNA polymerase ECF-subfamily sigma factor  42.37 
 
 		 436 aa  271  1e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.220451  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1556  putative RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  41.28 
 
 		 429 aa  267  2e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00576969  normal  0.0421989 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3322  RNA polymerase ECF-subfamily sigma-70 factor  39.26 
 
 		 420 aa  266  7e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000453852 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1336  RNA polymerase ECF-subfamily sigma factor  42.22 
 
 		 412 aa  262  1e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.341377 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1753  putative RNA polymerase sigma-24 subunit, ECF subfamily  41.48 
 
 		 406 aa  259  8e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.620196  normal  0.802735 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4553  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  41.9 
 
 		 406 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5547  ECF subfamily RNA polymerase sigma-70 factor  41.11 
 
 		 425 aa  256  4e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151151  normal  0.328912 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4060  RNA polymerase ECF-subfamily sigma factor  41.48 
 
 		 412 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1484  RNA polymerase ECF-subfamily sigma factor  43.73 
 
 		 411 aa  253  3e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.159854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4326  hypothetical protein  41.46 
 
 		 414 aa  253  6e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.91814  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4578  putative RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  44.88 
 
 		 419 aa  252  8.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.638987  normal  0.470788 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4226  putative RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  43.92 
 
 		 410 aa  252  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.094038 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4453  RNA polymerase ECF-subfamily sigma factor  40.34 
 
 		 415 aa  251  2e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6184  putative RNA polymerase sigma factor  41.46 
 
 		 418 aa  250  4e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.805414  normal  0.819785 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3848  RNA polymerase ECF-subfamily sigma factor  40.63 
 
 		 412 aa  246  6e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4650  RNA polymerase ECF-subfamily sigma factor  42.39 
 
 		 409 aa  245  9e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.267181  normal  0.578872 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0814  putative RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  41.25 
 
 		 403 aa  244  3e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.839992  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3462  ECF subfamily RNA polymerase sigma-70 factor  39.9 
 
 		 413 aa  243  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.671193  hitchhiker  0.000910596 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4762  putative RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  39.18 
 
 		 419 aa  241  2e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.931274  normal  0.952904 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2234  putative RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  37.96 
 
 		 436 aa  241  2e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.532877  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2465  putative RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  41.46 
 
 		 408 aa  240  4e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00327105  hitchhiker  0.00432991 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3058  putative RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  41.81 
 
 		 407 aa  239  5e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00390728  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2508  putative RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  41.81 
 
 		 390 aa  239  5e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.536896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4032  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  41.34 
 
 		 414 aa  238  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.268064  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3137  putative RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  38.88 
 
 		 416 aa  237  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4614  sigma-70 region 2 domain-containing protein  40.15 
 
 		 413 aa  236  4e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3417  putative RNA polymerase sigma-24 subunit, ECF subfamily  41.59 
 
 		 429 aa  235  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.133297  normal  0.0141412 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3126  putative RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  40.72 
 
 		 419 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0562  putative RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  37.73 
 
 		 431 aa  233  4.0000000000000004e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112757 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1554  putative RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  37.04 
 
 		 411 aa  233  5e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.230024  normal  0.603262 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4217  sigma-70 region 2 domain-containing protein  46.18 
 
 		 413 aa  231  1e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4345  putative RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  38.05 
 
 		 415 aa  231  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.756748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0199  putative RNA polymerase sigma-24 subunit, ECF subfamily  42.05 
 
 		 405 aa  229  5e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.646192  normal  0.0689885 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0004  RNA polymerase ECF-subfamily sigma factor  39.61 
 
 		 427 aa  229  6e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122751  hitchhiker  0.000113113 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46810  RNA polymerase ECF-subfamily sigma-70 factor  40.84 
 
 		 407 aa  229  7e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.325328  decreased coverage  0.000000102241 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0825  RNA polymerase ECF-subfamily sigma factor  33.5 
 
 		 422 aa  229  9e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2857  putative RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  39.28 
 
 		 419 aa  228  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125085  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2091  putative RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  41.33 
 
 		 408 aa  227  3e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.319212  normal  0.876924 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1109  RNA polymerase ECF-subfamily sigma factor  39.6 
 
 		 414 aa  226  6e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5201  putative RNA polymerase sigma-24 subunit, ECF subfamily  39.33 
 
 		 393 aa  226  8e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.603065  normal  0.598241 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2177  RNA polymerase ECF-subfamily sigma factor  38.42 
 
 		 410 aa  225  1e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1701  putative RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  38.67 
 
 		 418 aa  224  2e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3324  putative RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  39.74 
 
 		 412 aa  223  4e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.025109  normal  0.227856 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4759  putative RNA polymerase sigma-24 subunit, ECF subfamily  38.4 
 
 		 413 aa  223  4.9999999999999996e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00302536  hitchhiker  0.000266269 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4085  putative RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  41.84 
 
 		 429 aa  222  9.999999999999999e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.535273 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0958  putative RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  38.48 
 
 		 413 aa  218  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6290  putative RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  38.25 
 
 		 424 aa  217  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8666  putative RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  38.2 
 
 		 404 aa  217  4e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1473  RNA polymerase ECF-subfamily sigma factor  38.64 
 
 		 421 aa  216  5e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.378859  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1748  putative RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  39.55 
 
 		 416 aa  216  7e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1299  putative RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  40.26 
 
 		 422 aa  216  8e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.831736  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1109  putative RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  37.5 
 
 		 413 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.107204 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2337  putative RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  36.63 
 
 		 419 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000298794  hitchhiker  0.000148317 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4127  putative RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  37.8 
 
 		 446 aa  214  1.9999999999999998e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5266  putative RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  35.41 
 
 		 433 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3550  putative RNA polymerase, sigma 70 family subunit  36.59 
 
 		 416 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6897  RNA polymerase ECF-type sigma factor  38.18 
 
 		 421 aa  213  7e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0831712 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5825  putative RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  37.62 
 
 		 435 aa  212  7.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3475  putative RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  37.63 
 
 		 409 aa  212  7.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.242606  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5459  RNA polymerase sigma-70 factor, ECF subfamily  39.31 
 
 		 415 aa  212  7.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419159  normal  0.10807 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6407  RNA polymerase ECF-subfamily sigma factor  40.25 
 
 		 423 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.240201  normal  0.750838 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1885  putative RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  37.56 
 
 		 439 aa  211  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248059  normal  0.283313 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0381  putative RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  36.9 
 
 		 401 aa  209  6e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0518343  decreased coverage  0.00694319 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4160  sigma-70 region 2  39.02 
 
 		 419 aa  209  6e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0282  putative RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  39.6 
 
 		 431 aa  209  6e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1363  putative RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  38.64 
 
 		 416 aa  209  7e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0825491  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4187  RNA polymerase ECF-subfamily sigma factor  38.5 
 
 		 419 aa  209  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4397  putative sigma-70 factor, ECF subfamily  39.84 
 
 		 428 aa  209  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0260182  normal  0.0263489 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2146  putative RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  35.9 
 
 		 434 aa  208  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2209  putative RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  39.55 
 
 		 417 aa  208  2e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3762  putative RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  39.16 
 
 		 447 aa  208  2e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4075  putative RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  36.69 
 
 		 419 aa  206  8e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4259  putative sigma factor  38.14 
 
 		 421 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.294953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0829  RNA polymerase ECF-subfamily sigma factor  37.66 
 
 		 418 aa  203  4e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18240  RNA polymerase, sigma subunit, ECF family  36.6 
 
 		 428 aa  203  5e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.542706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2714  sigma-70, region 4 type 2  37.56 
 
 		 436 aa  203  5e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.528766 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0738  RNA polymerase ECF-subfamily sigma factor  38.64 
 
 		 416 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.481415  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0752  RNA polymerase ECF-subfamily sigma factor  38.64 
 
 		 416 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.197672 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5550  putative RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  36.25 
 
 		 420 aa  201  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2628  putative RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  40.72 
 
 		 421 aa  200  3.9999999999999996e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0101109  normal  0.489603 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0732  RNA polymerase ECF-subfamily sigma factor  38.35 
 
 		 416 aa  199  5e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.290174  normal  0.524632 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2832  RNA polymerase ECF-subfamily sigma factor  36.74 
 
 		 429 aa  199  7e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.72369  normal  0.923005 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0869  putative RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  34.14 
 
 		 651 aa  199  7e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456252  normal  0.192635 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3253  putative RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  36.05 
 
 		 416 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.178478 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0473  putative RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  40.11 
 
 		 413 aa  197  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.540952  normal  0.154309 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3537  putative RNA polymerase sigma-24 subunit, ECF subfamily  41.42 
 
 		 413 aa  197  3e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0382  putative RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  37.93 
 
 		 420 aa  196  7e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3921  putative sigma factor  37.5 
 
 		 435 aa  196  8.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.67535  normal  0.14729 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8875  putative RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  38.56 
 
 		 432 aa  196  8.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2313  sigma-70 region 2 domain-containing protein  39.26 
 
 		 437 aa  196  9e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.326435 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4226  RNA polymerase sigma factor containing a TPR repeat domain-like protein  36.01 
 
 		 680 aa  195  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338891  normal  0.0144943 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4027  putative sigma factor  35.9 
 
 		 436 aa  194  4e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1483  RNA polymerase ECF-subfamily sigma factor  37.35 
 
 		 433 aa  192  7e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.860065 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2135  putative RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  37.18 
 
 		 428 aa  192  8e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.387852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2504  putative RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  36.87 
 
 		 410 aa  192  9e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0019  putative RNA polymerase sigma factor  38.33 
 
 		 428 aa  192  1e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.962895  normal  0.592717 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3641  RNA polymerase ECF-subfamily sigma factor  36.63 
 
 		 434 aa  192  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.679852 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5744  putative RNA polymerase sigma-24 subunit, ECF subfamily  37.78 
 
 		 438 aa  191  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.643719  normal  0.514642 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3355  RNA polymerase ECF-subfamily sigma factor  34.74 
 
 		 406 aa  190  4e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.717574  normal  0.451695 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>