More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3750 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008043  TM1040_3750  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
172 aa  355  1.9999999999999998e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0613  hypothetical protein  56.89 
 
 
170 aa  209  2e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2498  GCN5-related N-acetyltransferase  34.5 
 
 
181 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.441517  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2771  acetyltransferase, GNAT family  33.33 
 
 
176 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.2078  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1503  GCN5-related N-acetyltransferase  33.55 
 
 
170 aa  88.2  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.528782 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1080  Prolyl aminopeptidase  28.03 
 
 
331 aa  76.3  0.0000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2455  GCN5-related N-acetyltransferase  35.8 
 
 
188 aa  71.6  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.189095  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2537  tRNA (guanine-N1)-methyltransferase  29.93 
 
 
464 aa  70.9  0.000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.106194  normal  0.161269 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1146  GCN5-related N-acetyltransferase  35.38 
 
 
175 aa  66.2  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0707  GCN5-related N-acetyltransferase  32.22 
 
 
177 aa  65.9  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2471  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
173 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.583315 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0568  GCN5-related N-acetyltransferase  26.14 
 
 
180 aa  65.9  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2274  GCN5-related N-acetyltransferase  27.06 
 
 
207 aa  65.5  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.096304  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3879  GCN5-related N-acetyltransferase  27.75 
 
 
173 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.259985 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4721  GCN5-related N-acetyltransferase  27.49 
 
 
173 aa  62  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.961994  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3642  GCN5-related N-acetyltransferase  27.49 
 
 
173 aa  62  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.309003  normal  0.524921 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2221  GCN5-related N-acetyltransferase  29.13 
 
 
179 aa  60.8  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.93797  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2267  GCN5-related N-acetyltransferase  29.13 
 
 
179 aa  60.8  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0656952  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2210  GCN5-related N-acetyltransferase  29.13 
 
 
179 aa  60.8  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245509  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3731  GCN5-related N-acetyltransferase  23.13 
 
 
172 aa  60.8  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1998  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 1  26.42 
 
 
172 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0363  GCN5-related N-acetyltransferase  29.01 
 
 
175 aa  60.1  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791622  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0431  Prolyl aminopeptidase  24.5 
 
 
170 aa  60.1  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2492  GCN5-related N-acetyltransferase  28.47 
 
 
178 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.314517 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3282  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 1  24.53 
 
 
172 aa  58.2  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3275  acetyltransferase  24.53 
 
 
172 aa  57.4  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.266027  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3252  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 1  24.53 
 
 
172 aa  57.4  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0486  GCN5-related N-acetyltransferase  29.82 
 
 
172 aa  57.4  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0457  GCN5-related N-acetyltransferase  28 
 
 
310 aa  56.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.414907 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0180  GCN5-related N-acetyltransferase  43.75 
 
 
159 aa  56.6  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3135  GCN5-related N-acetyltransferase  24.84 
 
 
166 aa  56.6  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12684  hypothetical protein  27.78 
 
 
156 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0010108  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6080  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  30.57 
 
 
319 aa  55.8  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2741  GCN5-related N-acetyltransferase  26.44 
 
 
181 aa  55.1  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.432705  normal  0.0282239 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3645  GCN5-related N-acetyltransferase  20.92 
 
 
174 aa  55.1  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0720  GCN5-related N-acetyltransferase  30.26 
 
 
188 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000642357  normal  0.302145 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1088  acetyltransferase  36.78 
 
 
187 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0925332  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2396  GCN5-related N-acetyltransferase  24.46 
 
 
193 aa  54.3  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3512  beta-lactamase  27.33 
 
 
547 aa  54.3  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.265184  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2639  GCN5-related N-acetyltransferase  23.67 
 
 
173 aa  54.3  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.806103 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2363  Prolyl aminopeptidase  21.89 
 
 
171 aa  54.3  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3902  GCN5-related N-acetyltransferase  33.14 
 
 
166 aa  54.3  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22280  acetyltransferase  31.07 
 
 
186 aa  54.3  0.0000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0146  GCN5-related N-acetyltransferase  40.91 
 
 
160 aa  54.3  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.144689  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0878  acetyltransferase, GNAT family  29.71 
 
 
170 aa  53.9  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.241509  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1584  GCN5-related N-acetyltransferase  27.81 
 
 
158 aa  53.9  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.806577 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1001  GCN5-related N-acetyltransferase  29.71 
 
 
170 aa  53.9  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000116544 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0485  GCN5-related N-acetyltransferase  28.92 
 
 
183 aa  53.9  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.331913  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0957  putative acetyltransferase  28.67 
 
 
174 aa  53.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.554989  normal  0.477108 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0611  GCN5-related N-acetyltransferase  27.88 
 
 
183 aa  53.5  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.433939  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4320  MarR family transcriptional regulator  31.94 
 
 
345 aa  52.8  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0208  hypothetical protein  27.22 
 
 
171 aa  52.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3030  GCN5-related N-acetyltransferase  28.48 
 
 
174 aa  53.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25589  hitchhiker  0.00490416 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0818  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.44 
 
 
156 aa  52.8  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1184  GCN5-related N-acetyltransferase  34.29 
 
 
180 aa  53.1  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00161881  hitchhiker  0.00363544 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1897  putative acetyltransferase protein  35.29 
 
 
187 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.385143  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3911  GCN5-related N-acetyltransferase  28.47 
 
 
178 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.17227  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2952  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 1  23.9 
 
 
172 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.538845  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1703  GCN5-related N-acetyltransferase  33.65 
 
 
153 aa  52.8  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.573614  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3433  GCN5-related N-acetyltransferase  27.7 
 
 
173 aa  52.8  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1150  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.53 
 
 
158 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.372343  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37660  mycothiol biosynthesis acetyltransferase  38.96 
 
 
306 aa  52.4  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.133182 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4262  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.29 
 
 
162 aa  52.4  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3300  GCN5-related N-acetyltransferase  22.09 
 
 
175 aa  52.8  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0928337  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3457  GCN5-related N-acetyltransferase  45.61 
 
 
112 aa  52.8  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1167  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.53 
 
 
158 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.508689 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1177  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.53 
 
 
158 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0246629 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1811  acetyltransferase  35.29 
 
 
169 aa  52.4  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0214  hypothetical protein  26.67 
 
 
171 aa  52  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4337  GCN5-related N-acetyltransferase  34.67 
 
 
168 aa  52  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.473125 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3224  acetyltransferase, GNAT family  25.68 
 
 
161 aa  52  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.503052 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0870  acetyltransferase  23.6 
 
 
173 aa  51.6  0.000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0427112  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0119  acetyltransferase  28.93 
 
 
152 aa  51.2  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2081  acetyltransferase, GNAT family  25.68 
 
 
161 aa  51.2  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06630  acetyltransferase, N-acetylglutamate synthase  33.33 
 
 
155 aa  51.2  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.300608  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0250  acetyltransferase  22.02 
 
 
158 aa  51.2  0.000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.416446  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1908  acetyltransferase  25.17 
 
 
161 aa  51.2  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15247  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2603  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  34.38 
 
 
152 aa  51.2  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1519  GCN5-related N-acetyltransferase  26.17 
 
 
141 aa  51.2  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0922659  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2157  GCN5-related N-acetyltransferase  27.42 
 
 
163 aa  51.2  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.11171  normal  0.0345658 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1574  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35 
 
 
164 aa  51.2  0.000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0676  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  38.81 
 
 
195 aa  51.2  0.000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.895048  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1944  acetyltransferase  25.68 
 
 
161 aa  50.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0940  acetyltransferase  34.12 
 
 
169 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2091  acetyltransferase  25.68 
 
 
161 aa  50.4  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1715  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.33 
 
 
168 aa  50.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2478  GCN5-related N-acetyltransferase  22.7 
 
 
167 aa  50.4  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.263988  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4496  GCN5-related N-acetyltransferase  43.64 
 
 
179 aa  50.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000087115  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0442  acetyltransferase  34.12 
 
 
169 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0205  acetyltransferase  34.12 
 
 
187 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1401  acetyltransferase  34.12 
 
 
187 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277124  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1651  GCN5-related N-acetyltransferase  28.39 
 
 
296 aa  50.4  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2176  acetyltransferase  25.68 
 
 
161 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.144066  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2122  acetyltransferase, GNAT family  25.68 
 
 
161 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3468  GCN5-related N-acetyltransferase  27.06 
 
 
197 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2117  GCN5-related N-acetyltransferase  31.37 
 
 
187 aa  49.3  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1307  GCN5-related N-acetyltransferase  23.7 
 
 
184 aa  49.7  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1287  GCN5-related N-acetyltransferase  26.49 
 
 
175 aa  49.7  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0436  GCN5-related N-acetyltransferase  29.92 
 
 
143 aa  49.7  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189459  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2725  mycothiol biosynthesis acetyltransferase  39.71 
 
 
323 aa  50.1  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00719898 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>