More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3424 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3424  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 321 aa  674    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0971545  normal  0.525072 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1508  glycosyl transferase family protein  28.8 
 
 		 350 aa  105  8e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0142825  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  29.69 
 
 		 1035 aa  100  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5735  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.03 
 
 		 294 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1419  glycosyl transferase family protein  30.86 
 
 		 296 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.12984 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4803  alpha-1,6-rhamnosyltransferase MigA  27.8 
 
 		 300 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66110  putative glycosyl transferase  29.31 
 
 		 294 aa  94  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1146  glycosyl transferase family protein  30.04 
 
 		 294 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.811113 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2506  b-glycosyltransferase  32.5 
 
 		 309 aa  92.4  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55180  glycosyl transferase  26.97 
 
 		 299 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.678126  hitchhiker  0.00000000000937683 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0590  glycosyl transferase family protein  28.09 
 
 		 294 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  37.41 
 
 		 337 aa  90.5  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2763  glycosyl transferase family protein  45.9 
 
 		 324 aa  89.7  6e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.32347  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  28.76 
 
 		 235 aa  87.8  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51220  glycosyl transferase  37.23 
 
 		 330 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00120111  hitchhiker  0.000215045 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  30.96 
 
 		 313 aa  87  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0478  glycosyl transferase family protein  27.57 
 
 		 300 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1615  glycosyl transferase family 2  30.65 
 
 		 331 aa  86.3  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.665959  normal  0.16082 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1457  glycosyl transferase family protein  45.26 
 
 		 341 aa  84  0.000000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00556553  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1962  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.17 
 
 		 312 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4680  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 		 367 aa  83.2  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.359899 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0301  glycosyltransferase  41.38 
 
 		 309 aa  82.4  0.000000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.4815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  30 
 
 		 300 aa  82  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  26.56 
 
 		 333 aa  81.3  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0024  glycosyl transferase family 2  36.28 
 
 		 358 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  37.3 
 
 		 322 aa  80.5  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.51 
 
 		 295 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2504  glycosyl transferase family protein  32.42 
 
 		 373 aa  80.1  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.695425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  27.59 
 
 		 334 aa  80.1  0.00000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00201  glycosyl transferase  26.45 
 
 		 316 aa  80.1  0.00000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.31889  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1013  glycosyl transferase group 1  35.29 
 
 		 812 aa  79.7  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  34.78 
 
 		 373 aa  79.3  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  27.62 
 
 		 306 aa  79.3  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2600  glycosyl transferase family 2  35.61 
 
 		 311 aa  79.3  0.00000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  31.44 
 
 		 581 aa  78.6  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1697  glycosyl transferase family protein  29.35 
 
 		 336 aa  78.6  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.591253  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1330  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.39 
 
 		 294 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.472766  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4316  glycosyl transferase family 2  38.6 
 
 		 450 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1152  glycosyl transferase family 2  35 
 
 		 370 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.186653  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2099  glycosyl transferase, family 2  27.17 
 
 		 267 aa  78.2  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0852  b-glycosyltransferase  31.11 
 
 		 318 aa  78.2  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0139255  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0136  glycosyl transferase family 2  37.14 
 
 		 746 aa  78.2  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000940813  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1645  glycosyl transferase family 2  39.71 
 
 		 253 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3362  glycosyl transferase family 2  37.72 
 
 		 235 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0060739  normal  0.350588 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  39.64 
 
 		 320 aa  77  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  40.2 
 
 		 326 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2461  glycosyl transferase family 2  37.01 
 
 		 289 aa  76.3  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0660635  normal  0.806604 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1778  glycosyl transferase family 2  30.56 
 
 		 292 aa  76.6  0.0000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.345176  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0306  glycosyl transferase family protein  31.01 
 
 		 268 aa  76.3  0.0000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  29.89 
 
 		 544 aa  76.3  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1402  glycosyl transferase family 2  40 
 
 		 372 aa  75.9  0.0000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000124327  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1479  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  35.61 
 
 		 307 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0517693  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0110  putative glycosyl transferase  24.9 
 
 		 327 aa  75.1  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.755571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  26.78 
 
 		 398 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  27.87 
 
 		 327 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0636  family 2 glycosyl transferase  40 
 
 		 785 aa  74.7  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.678698 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2014  glycosyl transferase family protein  36.36 
 
 		 303 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0488163 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  37.07 
 
 		 334 aa  73.9  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1120  glycosyl transferase family 2  36.94 
 
 		 303 aa  73.9  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0005  glycosyl transferase  38.05 
 
 		 708 aa  73.9  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.164795  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  37.59 
 
 		 727 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0351  glycosyl transferase family protein  35.58 
 
 		 393 aa  73.9  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.856721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2950  glycosyl transferase family protein  32.71 
 
 		 376 aa  73.9  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.268496 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4345  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 847 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.321273  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  29.29 
 
 		 308 aa  73.6  0.000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1106  glycosyl transferase  33.63 
 
 		 215 aa  73.6  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.648038  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  29.49 
 
 		 312 aa  73.9  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  37.25 
 
 		 326 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2025  glycosyl transferase family 2  38.18 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  hitchhiker  0.00838436 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0542  glycosyl transferase family protein  34.75 
 
 		 983 aa  73.6  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.211097  normal  0.295918 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  30.43 
 
 		 347 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2241  glycosyl transferase family protein  36.27 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  34.82 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2781  glycosyl transferase family 2  28.3 
 
 		 295 aa  73.6  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.217678 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5156  family 2 glycosyl transferase  34.51 
 
 		 216 aa  73.2  0.000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1728  glycosyl transferase family 2  33.06 
 
 		 573 aa  73.2  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.230858 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  38.26 
 
 		 390 aa  73.2  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1697  glycosyl transferase family 2  28.94 
 
 		 366 aa  72.8  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.696391  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1200  glycosyl transferase family 2  33.02 
 
 		 319 aa  72.8  0.000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0281003  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  35.17 
 
 		 1032 aa  72.4  0.000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3275  glycosyl transferase family 2  32.12 
 
 		 362 aa  72.4  0.000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.355424  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08980  glycosyl transferase  34.81 
 
 		 329 aa  72.4  0.000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.150997 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4906  family 2 glycosyl transferase  30.86 
 
 		 342 aa  72  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44450  Glycosyl transferase, family 2 protein  31.06 
 
 		 340 aa  72.4  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3698  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.39 
 
 		 327 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1541  glycosyl transferase family 2  30.15 
 
 		 304 aa  72  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.297515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3100  glycosyl transferase family protein  38.46 
 
 		 325 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0346657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0148  glycosyl transferase family protein  37.07 
 
 		 350 aa  72.4  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.341853  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  28.17 
 
 		 597 aa  72  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  30.64 
 
 		 331 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0259  glycosyl transferase family protein  31.62 
 
 		 643 aa  72  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158733  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0769  glycosyl transferase family 2  28.86 
 
 		 352 aa  72  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  33.91 
 
 		 672 aa  71.6  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1741  glycosyl transferase family 2  40.38 
 
 		 275 aa  71.6  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.675758 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  42.86 
 
 		 1177 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1547  glycosyl transferase family 2  39.09 
 
 		 326 aa  71.2  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3099  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 303 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.122373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2676  glycosyl transferase family protein  29.02 
 
 		 294 aa  71.2  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  42.86 
 
 		 1177 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3305  glycosyl transferase family protein  27.38 
 
 		 342 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.240811 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>