More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2724 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2724  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 613 aa  1254    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.524296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2819  signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 597 aa  308  1.0000000000000001e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.753757 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3834  signal transduction histidine kinase  34.5 
 
 		 578 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.391649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3564  signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 		 594 aa  286  5.999999999999999e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.186387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2929  signal transduction histidine kinase  34.04 
 
 		 593 aa  271  4e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1271  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.86 
 
 		 593 aa  268  2e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2700  signal transduction histidine kinase  33.21 
 
 		 592 aa  252  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3288  Signal transduction histidine kinase  27.98 
 
 		 662 aa  112  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.390564  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4136  signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 		 790 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3525  signal transduction histidine kinase  32.03 
 
 		 603 aa  107  4e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 1714 aa  107  8e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 		 746 aa  106  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0325493 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  32.54 
 
 		 439 aa  106  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  34.34 
 
 		 878 aa  105  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0092  signal transduction histidine kinase  30.73 
 
 		 570 aa  102  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0277499 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  29.1 
 
 		 991 aa  100  7e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  33.16 
 
 		 681 aa  100  8e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3504  signal transduction histidine kinase  31.02 
 
 		 585 aa  99.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0759377  normal  0.354882 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3911  signal transduction histidine kinase  31.34 
 
 		 1093 aa  100  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  0.0971599 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  32.87 
 
 		 932 aa  97.8  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4851  signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 		 752 aa  98.2  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0114486 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 		 1183 aa  97.8  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  31.98 
 
 		 674 aa  97.8  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  29.73 
 
 		 1560 aa  97.8  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  32.46 
 
 		 215 aa  97.1  9e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0148  Signal transduction histidine kinase  34.83 
 
 		 350 aa  95.9  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.332902  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  32.24 
 
 		 815 aa  96.3  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1781  signal transduction histidine kinase  34.83 
 
 		 350 aa  95.9  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  29.76 
 
 		 1654 aa  95.1  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4449  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.52 
 
 		 875 aa  95.1  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  31.41 
 
 		 1676 aa  94.4  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4364  signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 		 807 aa  94.4  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.217771 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  29.08 
 
 		 2693 aa  93.6  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  30.37 
 
 		 532 aa  94  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  32.03 
 
 		 1253 aa  94  8e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0498  signal transduction histidine kinase  32.66 
 
 		 420 aa  93.6  9e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4081  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  34.01 
 
 		 895 aa  93.6  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.628066  normal  0.498394 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4326  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 782 aa  93.2  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.173856 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4562  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 874 aa  93.6  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0865092  normal  0.846022 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 		 347 aa  93.2  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  29.08 
 
 		 613 aa  92.8  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3723  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.16 
 
 		 871 aa  92  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.086011 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  29.9 
 
 		 1093 aa  92.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 913 aa  91.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  30.81 
 
 		 1093 aa  92  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 		 1177 aa  91.7  3e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  26.11 
 
 		 1227 aa  91.7  3e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  33 
 
 		 783 aa  91.7  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 764 aa  91.3  5e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  28.22 
 
 		 732 aa  91.3  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5678  signal transduction histidine kinase  28.32 
 
 		 747 aa  91.3  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  29.56 
 
 		 771 aa  90.9  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  31.44 
 
 		 1663 aa  90.9  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2705  signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 		 856 aa  90.5  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  27.32 
 
 		 382 aa  90.5  8e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5382  signal transduction histidine kinase  29.38 
 
 		 511 aa  90.5  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11268  histidine kinase sensor protein  29.67 
 
 		 624 aa  90.1  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0327  histidine kinase, dimerisation/phosphoacceptor  33.68 
 
 		 400 aa  89.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0659976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 		 526 aa  89.7  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2408  signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 472 aa  89.7  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0051  signal transduction histidine kinase  21.29 
 
 		 585 aa  90.1  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725839 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  32.12 
 
 		 909 aa  89.4  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 		 767 aa  89.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  39.39 
 
 		 1051 aa  88.6  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1636  two component sensor kinase  32.64 
 
 		 342 aa  88.6  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.264656  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  30.6 
 
 		 834 aa  88.6  3e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3192  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.94 
 
 		 864 aa  88.2  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0309229 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 		 945 aa  88.2  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08676  hypothetical protein  35.42 
 
 		 650 aa  88.2  4e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0972974  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  39.57 
 
 		 980 aa  87.8  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  29.33 
 
 		 964 aa  87.8  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0119  signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 		 757 aa  87.8  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2279  signal transduction histidine kinase  29.9 
 
 		 392 aa  87.8  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0130228 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1953  signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 		 382 aa  87.4  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  31.95 
 
 		 1668 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3670  signal transduction histidine kinase  31.89 
 
 		 832 aa  86.7  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  28.4 
 
 		 1390 aa  86.7  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0324  signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 		 398 aa  87  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.732156  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2165  signal transduction histidine kinase  27.14 
 
 		 358 aa  86.3  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2023  signal transduction histidine kinase  27.59 
 
 		 596 aa  85.9  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.175935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1487  signal transduction histidine kinase  29.77 
 
 		 924 aa  85.9  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.588746 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  29.27 
 
 		 744 aa  85.5  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2288  signal transduction histidine kinase  29.27 
 
 		 400 aa  85.5  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.184339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0515  signal transduction histidine kinase  29.9 
 
 		 416 aa  85.1  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.498763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2255  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 648 aa  84.7  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.56353  normal  0.716596 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3529  signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 		 405 aa  84.3  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.170223 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0118  signal transduction histidine kinase  28.24 
 
 		 774 aa  84  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.844509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 872 aa  84  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5414  signal transduction histidine kinase  28.1 
 
 		 348 aa  83.2  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  29.31 
 
 		 723 aa  83.2  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4308  signal transduction histidine kinase  26.6 
 
 		 739 aa  83.2  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.057717 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 		 912 aa  83.2  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  32.98 
 
 		 1246 aa  83.6  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1343  signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 		 350 aa  83.6  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.54395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4164  hypothetical protein  26.24 
 
 		 344 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 		 551 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4408  signal transduction histidine kinase  29.84 
 
 		 408 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.488817 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0384  two component sensor kinase  30.39 
 
 		 344 aa  82.4  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  28.43 
 
 		 3706 aa  82.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0298  signal transduction histidine kinase  28.28 
 
 		 349 aa  82.8  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228007  hitchhiker  0.00285782 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>