11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1378 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1378  hypothetical protein  100 
 
 		 269 aa  561  1.0000000000000001e-159  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1592  hypothetical protein  71.43 
 
 		 290 aa  401  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.466935  normal  0.17451 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2165  hypothetical protein  61.98 
 
 		 289 aa  347  1e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0009  hypothetical protein  61.6 
 
 		 289 aa  346  3e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0954529  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1639  hypothetical protein  61.6 
 
 		 289 aa  345  3e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.513589 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4498  hypothetical protein  61.89 
 
 		 300 aa  339  2e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.464588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2349  hypothetical protein  54.51 
 
 		 301 aa  298  9e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862108 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2460  hypothetical protein  47.57 
 
 		 283 aa  257  1e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0496  hypothetical protein  48.11 
 
 		 279 aa  244  9e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2702  hypothetical protein  43.35 
 
 		 281 aa  225  5.0000000000000005e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0245  hypothetical protein  44.03 
 
 		 283 aa  223  4e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>