More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0476 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008044  TM1040_0476  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
589 aa  1182    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1798  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.83 
 
 
615 aa  340  5.9999999999999996e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.371991  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2181  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.4 
 
 
606 aa  335  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.440189  normal  0.953277 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1613  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.38 
 
 
603 aa  325  2e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.183078  normal  0.160096 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0580  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  35.84 
 
 
606 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.237889  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0537  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.95 
 
 
605 aa  320  6e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.180661 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2464  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  37.82 
 
 
605 aa  320  7e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0958  methyl-accepting chemotaxis protein  36.04 
 
 
610 aa  318  2e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0581  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  36.12 
 
 
607 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.893675 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1387  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.94 
 
 
615 aa  304  4.0000000000000003e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3209  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.11 
 
 
782 aa  286  8e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.684679  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1200  methyl-accepting chemotaxis protein  41.23 
 
 
728 aa  285  2.0000000000000002e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0051  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.63 
 
 
796 aa  283  6.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000874578 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2608  methyl-accepting chemotaxis protein  42.86 
 
 
655 aa  282  9e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.445883  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0236  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.18 
 
 
660 aa  282  1e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.105118  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0214  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.37 
 
 
663 aa  281  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.287216 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0185  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.82 
 
 
669 aa  281  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0520  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.01 
 
 
636 aa  280  7e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1208  methyl-accepting chemotaxis protein  41.79 
 
 
604 aa  277  5e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2590  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.15 
 
 
642 aa  276  9e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.156907  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5554  methyl-accepting chemotaxis protein  37.04 
 
 
653 aa  275  2.0000000000000002e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0672502  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1201  methyl-accepting chemotaxis protein  38.51 
 
 
728 aa  274  4.0000000000000004e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3620  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.93 
 
 
677 aa  271  2e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0125911 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0052  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.19 
 
 
778 aa  271  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0947231 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.68 
 
 
698 aa  272  2e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000832175  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2990  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.05 
 
 
631 aa  268  2e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4113  methyl-accepting chemotaxis protein  43.21 
 
 
778 aa  267  2.9999999999999995e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.433818  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0984  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.09 
 
 
608 aa  267  4e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0666136  normal  0.983928 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1159  methyl-accepting chemotaxis protein  41.47 
 
 
671 aa  266  5.999999999999999e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.573311  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0980  methyl-accepting chemotaxis protein  43.43 
 
 
611 aa  265  1e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.442512  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1117  methyl-accepting chemotaxis protein  38.52 
 
 
657 aa  264  4e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.593573  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3714  methyl-accepting chemotaxis protein  39.61 
 
 
679 aa  263  4.999999999999999e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0885803  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0626  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  39.91 
 
 
726 aa  263  6e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6126  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.79 
 
 
650 aa  262  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.375381  normal  0.0878449 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.3 
 
 
665 aa  262  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.713215  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5372  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.24 
 
 
627 aa  261  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.756404 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4524  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.12 
 
 
661 aa  261  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.66296 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0276  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.35 
 
 
657 aa  261  4e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.461968  normal  0.560518 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2177  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.88 
 
 
602 aa  260  4e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.180362  normal  0.483778 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5092  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.95 
 
 
626 aa  259  7e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.359668  normal  0.0114189 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1449  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.9 
 
 
647 aa  259  8e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0793  methyl-accepting chemotaxis protein  38.91 
 
 
740 aa  259  1e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5354  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.95 
 
 
714 aa  258  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.642158  normal  0.0994281 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3923  methyl-accepting chemotaxis protein  39.28 
 
 
843 aa  257  4e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3194  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.86 
 
 
614 aa  256  5e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.311641  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0988  methyl-accepting chemotaxis protein  38.06 
 
 
695 aa  257  5e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6402  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.13 
 
 
688 aa  256  7e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.579482  normal  0.320846 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0368  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.4 
 
 
843 aa  256  8e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0662296 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9076  methyl-accepting chemotaxis protein  40.05 
 
 
612 aa  256  8e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5641  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.49 
 
 
519 aa  256  9e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3177  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.47 
 
 
749 aa  256  1.0000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.726311  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3729  methyl-accepting chemotaxis protein  41.22 
 
 
644 aa  255  2.0000000000000002e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.554142  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3511  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.77 
 
 
771 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.595827 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5069  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.95 
 
 
714 aa  254  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.277036  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5166  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.47 
 
 
669 aa  254  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0083  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.21 
 
 
665 aa  254  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0972557  normal  0.565594 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3216  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.77 
 
 
771 aa  254  4.0000000000000004e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.556382 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9088  methyl-accepting chemotaxis protein  41.05 
 
 
761 aa  254  4.0000000000000004e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4686  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.04 
 
 
601 aa  253  6e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.115608  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0369  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.04 
 
 
615 aa  253  6e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00881781 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0996  methyl-accepting chemotaxis protein  41.38 
 
 
647 aa  253  6e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0806  methyl-accepting chemotaxis protein  39.8 
 
 
842 aa  253  6e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3179  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.18 
 
 
885 aa  252  1e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.498273 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0400  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.65 
 
 
843 aa  253  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170819 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5151  methyl-accepting chemotaxis protein  39.24 
 
 
776 aa  251  2e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2453  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.23 
 
 
788 aa  251  2e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.925334  normal  0.122382 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0994  methyl-accepting chemotaxis protein  40.4 
 
 
649 aa  251  3e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  40.66 
 
 
785 aa  250  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1383  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.3 
 
 
705 aa  250  6e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5547  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.27 
 
 
520 aa  249  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2860  methyl-accepting chemotaxis protein  35.92 
 
 
668 aa  249  1e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0943  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  39.85 
 
 
793 aa  248  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.27721  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0359  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.35 
 
 
927 aa  248  2e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0401  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.81 
 
 
615 aa  248  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000192098 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0305  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.6 
 
 
841 aa  247  4e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2791  methyl-accepting chemotaxis protein  46.71 
 
 
622 aa  247  4.9999999999999997e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0082  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.43 
 
 
665 aa  247  4.9999999999999997e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3647  methyl-accepting chemotaxis protein  39.22 
 
 
680 aa  246  9e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4159  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.45 
 
 
611 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4013  methyl-accepting chemotaxis protein  36.34 
 
 
756 aa  245  9.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6172  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.32 
 
 
542 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0173  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.94 
 
 
545 aa  244  3e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.074609 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0557  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.9 
 
 
627 aa  244  3e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.191348  normal  0.480006 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4670  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.95 
 
 
625 aa  244  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.817515 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5142  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.65 
 
 
599 aa  243  5e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.367406  normal  0.838811 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1078  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.32 
 
 
587 aa  243  5e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00101669 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0110  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  45.51 
 
 
588 aa  244  5e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.885184  normal  0.0508963 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3005  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.13 
 
 
665 aa  243  6e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1547  methyl-accepting chemotaxis protein  38.69 
 
 
635 aa  243  7e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0672502  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2751  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.85 
 
 
521 aa  242  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0289  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.39 
 
 
598 aa  243  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.759991 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0212  methyl-accepting chemotaxis protein  33.98 
 
 
464 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.387539  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2927  methyl-accepting chemotaxis protein  39.3 
 
 
730 aa  241  2e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0257741  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0839  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.36 
 
 
927 aa  242  2e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.587759  normal  0.752939 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2051  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.4 
 
 
717 aa  242  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.245091  normal  0.347836 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2893  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.43 
 
 
589 aa  241  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1710  methyl-accepting chemotaxis protein  33.6 
 
 
517 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1623  methyl-accepting chemotaxis protein  33.6 
 
 
517 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2144  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.55 
 
 
556 aa  241  2.9999999999999997e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3360  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.66 
 
 
648 aa  240  5e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.59059  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>