139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2103 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE2103  glycosyl transferase, group 2 family protein  100 
 
 
288 aa  599  1e-170  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00031787  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2241  glycosyl transferase, group 2 family protein  43.3 
 
 
381 aa  245  6e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.244208  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0132  glycosyl transferase family 2  28.23 
 
 
403 aa  86.7  4e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.227934  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3520  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  29.6 
 
 
323 aa  81.3  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1430  beta-1,4-galactosyltransferase, putative  23.97 
 
 
333 aa  76.6  0.0000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2040  glycosyl transferase family 2  24.83 
 
 
386 aa  77  0.0000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.12763  normal  0.970209 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1433  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.45 
 
 
340 aa  75.9  0.0000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.835917  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1203  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  30.7 
 
 
616 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.811759 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0757  glycosyl transferase family 2  28.78 
 
 
384 aa  68.6  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.122576  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1280  lipooligosaccharide biosynthesis galactosyltransferase, putative  26.94 
 
 
323 aa  66.6  0.0000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.265819  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2583  glycosyl transferase family 2  29.45 
 
 
809 aa  63.9  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2965  glycosyl transferase family 2  31.37 
 
 
309 aa  63.5  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0614913  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0456  glycosyl transferase family protein  27.31 
 
 
370 aa  60.1  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.965003  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1112  glycosyl transferase family 8  29.83 
 
 
1014 aa  58.9  0.00000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3393  glycosyl transferase family protein  26.04 
 
 
324 aa  58.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0941  glycosyl transferase family 2  34.18 
 
 
376 aa  58.2  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3987  putative glycosyl transferase  27.27 
 
 
344 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4032  putative glycosyl transferase  27.27 
 
 
344 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0315657  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3906  putative glycosyl transferase  27.75 
 
 
344 aa  57  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.66206  normal  0.305957 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0186  glycosyl transferase family protein  28.02 
 
 
348 aa  55.5  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4093  putative glycosyl transferase  27.27 
 
 
344 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08980  glycosyl transferase  27.45 
 
 
329 aa  55.5  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.150997 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3925  putative glycosyl transferase  27.27 
 
 
344 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0945  glycosyl transferase family 2  27.5 
 
 
358 aa  53.5  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.761656  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0585  beta-1,3-galactosyltransferase  25.41 
 
 
287 aa  53.1  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3999  ribonuclease III  35.42 
 
 
312 aa  53.1  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329271  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1307  glycosyl transferase family protein  28.72 
 
 
335 aa  53.1  0.000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0636  family 2 glycosyl transferase  27.83 
 
 
785 aa  52.8  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.678698 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4118  putative glycosyl transferase  25.98 
 
 
344 aa  52.4  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.910618  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1429  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.58 
 
 
327 aa  52.4  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0642  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  28.68 
 
 
1157 aa  52  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4042  putative glycosyl transferase  25.98 
 
 
344 aa  52  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.24261  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03473  predicted glycosyl transferase  25.49 
 
 
344 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.320225  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0090  glycosyl transferase family 2  25.49 
 
 
344 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1758  glycosyltransferase  35.42 
 
 
259 aa  50.8  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1059  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  35.96 
 
 
326 aa  51.2  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.113475  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0898  sugar transferase  28.23 
 
 
333 aa  50.8  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.137243  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1457  glycosyl transferase family protein  29.01 
 
 
341 aa  51.2  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00556553  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03424  hypothetical protein  25.49 
 
 
344 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.245637  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0093  putative glycosyl transferase  25.49 
 
 
344 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.516407  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2255  glycosyl transferase, group 1/glycosyl transferase, group 2  26.26 
 
 
740 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3951  putative glycosyl transferase  25.49 
 
 
344 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.174357  normal  0.660654 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3457  glycosyl transferase family protein  28.29 
 
 
313 aa  51.2  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4098  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  27.88 
 
 
1148 aa  50.8  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0637  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  36.36 
 
 
965 aa  51.2  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.384924  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  26.67 
 
 
302 aa  50.8  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1480  putative glycosyltransferase  24.77 
 
 
327 aa  50.4  0.00003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0285208  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0297  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  35.96 
 
 
970 aa  50.4  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1085  glycosyl transferase family 2  27.41 
 
 
329 aa  50.8  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1296  glycosyl transferase family protein  26.13 
 
 
343 aa  50.1  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1278  lipooligosaccharide biosynthesis galactosyltransferase, putative  25.5 
 
 
295 aa  50.1  0.00005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0908017  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0745  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosphotransferase  24.68 
 
 
1169 aa  50.1  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3827  putative glycosyl transferase  25.49 
 
 
344 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0526095  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3780  glycosyl transferase family 2  25.61 
 
 
327 aa  49.3  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1267  putative glycosyl transferase  37.66 
 
 
300 aa  49.3  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0614  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  35.29 
 
 
529 aa  48.9  0.00009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.597487 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3933  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.83 
 
 
329 aa  48.9  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27900  glycosyl/glycerophosphate transferase, teichoic acid biosynthesis  26.18 
 
 
1157 aa  48.9  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.860069  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3317  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  36.21 
 
 
314 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.172735  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2921  glycosyl transferase family protein  27.36 
 
 
880 aa  48.9  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3690  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.83 
 
 
329 aa  48.5  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3960  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.91 
 
 
327 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0389703  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  30.11 
 
 
327 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1437  capsular polysaccharide biosynthesis protein  25.33 
 
 
324 aa  48.1  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0148  glycosyl transferase family protein  25.25 
 
 
350 aa  47.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.341853  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.11 
 
 
327 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.11 
 
 
327 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  30.11 
 
 
327 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  30.11 
 
 
327 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0943  glycosyl transferase family 2  26.42 
 
 
351 aa  47.8  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.799144  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.11 
 
 
327 aa  47.8  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3066  glycosyl transferase family protein  40 
 
 
402 aa  47  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1431  glycosyltransferase-like protein  31.76 
 
 
323 aa  47  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3959  glycosyl transferase family 2  34.04 
 
 
236 aa  47.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.568122  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1616  glycosyl transferase family 2  31.53 
 
 
350 aa  47.4  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0585  glycosyl transferase  29.9 
 
 
358 aa  47.4  0.0003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2371  glycosyltransferase  25.4 
 
 
326 aa  47  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26480  glycosyl transferase  30.56 
 
 
672 aa  47  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  26.46 
 
 
326 aa  47  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3187  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
320 aa  46.6  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.225557  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  27.01 
 
 
326 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0808  glycosyl transferase family 2  32.58 
 
 
334 aa  46.6  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000227461  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0291  glycosyl transferase family 2  29.29 
 
 
312 aa  46.6  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0738  glycosyl transferase family 2  28.99 
 
 
319 aa  46.6  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0554497  hitchhiker  0.00271528 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0511  family 2 glycosyl transferase  34.83 
 
 
586 aa  46.6  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.287818  normal  0.265278 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0703  glycosyl transferase family 2  24.87 
 
 
348 aa  46.6  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  6.39468e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
268 aa  46.6  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  33.03 
 
 
1250 aa  46.2  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0058  glycosyl transferase family 2  27.04 
 
 
337 aa  46.2  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.246717 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1381  glycosyl transferase family protein  36.14 
 
 
326 aa  46.2  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5165  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  25.56 
 
 
1168 aa  46.2  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.390829 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1975  hypothetical protein  35.14 
 
 
348 aa  46.2  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2038  glycosyl transferase family 2  25.94 
 
 
340 aa  46.2  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.723912 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2363  glycosyltransferase  29.17 
 
 
301 aa  45.8  0.0008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1268  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
369 aa  45.8  0.0008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.6355  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4535  glycosyl transferase family protein  25.67 
 
 
760 aa  45.8  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0741652  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1578  cell wall membrane glycosyltransferase  31.15 
 
 
349 aa  45.8  0.0008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  27.54 
 
 
330 aa  45.8  0.0009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1847  glycosyl transferase family 2  29.77 
 
 
1116 aa  45.8  0.0009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.944284  normal  0.0115409 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  26.44 
 
 
326 aa  45.8  0.0009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>