More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2029 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2029  TatD family hydrolase  100 
 
 		 284 aa  588  1e-167  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000225222  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1615  Mg-dependent DNase  35.26 
 
 		 265 aa  129  4.0000000000000003e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1782  TatD family deoxyribonuclease  40.31 
 
 		 260 aa  123  3e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0481  TatD-related deoxyribonuclease  33.47 
 
 		 256 aa  122  8e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1347  TatD-related deoxyribonuclease  36.13 
 
 		 268 aa  120  3e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0910  TatD family hydrolase  36.17 
 
 		 251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1776  hydrolase, TatD family  32.51 
 
 		 263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  32.06 
 
 		 257 aa  117  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  35.2 
 
 		 256 aa  116  5e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0051  TatD family hydrolase  35.38 
 
 		 255 aa  116  5e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.563269  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  36.7 
 
 		 457 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2855  hydrolase, TatD family  31.17 
 
 		 269 aa  114  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0774  hydrolase, TatD family  34.04 
 
 		 271 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1774  deoxyribonuclease, putative  38.54 
 
 		 258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1656  hydrolase, TatD family  35.83 
 
 		 269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  33.16 
 
 		 258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3900  TatD family hydrolase  35.75 
 
 		 262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164799  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  28.52 
 
 		 256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  35.2 
 
 		 256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  27.34 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  32.77 
 
 		 464 aa  113  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2516  TatD-related deoxyribonuclease  31.17 
 
 		 265 aa  113  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11024  normal  0.0103613 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0567  hydrolase, TatD family  30 
 
 		 256 aa  113  4.0000000000000004e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0316  TatD family hydrolase  33.85 
 
 		 257 aa  112  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207917  normal  0.040307 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  35.12 
 
 		 268 aa  112  5e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0587  hydrolase, TatD family  36.93 
 
 		 328 aa  112  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  27.69 
 
 		 255 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3219  hydrolase, TatD family  30.27 
 
 		 272 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1585  putative metallodependent hydrolase  35.03 
 
 		 269 aa  112  8.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000288307  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3491  putative metallodependent hydrolase  35.03 
 
 		 269 aa  112  8.000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000629456  normal  0.0349317 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1693  putative metallodependent hydrolase  35.03 
 
 		 269 aa  112  8.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0223862  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2230  hydrolase, TatD family  32.08 
 
 		 273 aa  112  9e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1951  TatD family hydrolase  34.41 
 
 		 265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.974575 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2068  hydrolase, TatD family  29.96 
 
 		 257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0740  hydrolase, TatD family  32.07 
 
 		 270 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2940  Sec-independent protein translocase TatD  31.84 
 
 		 273 aa  112  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.355408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1984  hydrolase, TatD family  33 
 
 		 269 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.902783  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  30.08 
 
 		 461 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  32.64 
 
 		 256 aa  110  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0715  Mg-dependent DNase  36.13 
 
 		 258 aa  110  3e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.514357  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0194  hydrolase, TatD family protein  28.62 
 
 		 269 aa  110  3e-23  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0500604  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0398  TatD-related deoxyribonuclease  32.8 
 
 		 306 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2730  TatD-related deoxyribonuclease  32.64 
 
 		 305 aa  109  4.0000000000000004e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.191975  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2258  TatD-related deoxyribonuclease  32.47 
 
 		 264 aa  109  5e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  32.46 
 
 		 256 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3391  TatD family hydrolase  31.12 
 
 		 290 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00650196 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1799  hydrolase, TatD family  29.24 
 
 		 257 aa  108  1e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.339563  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1630  putative metallodependent hydrolase  32.66 
 
 		 264 aa  107  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000015742  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1720  TatD family hydrolase  32.5 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.149268 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  32.11 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1787  hypothetical protein  31.41 
 
 		 267 aa  107  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.36132  normal  0.0764381 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  39.31 
 
 		 261 aa  107  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0017  deoxyribonuclease, TatD family  31.28 
 
 		 265 aa  107  3e-22  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  30.8 
 
 		 256 aa  106  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0074  TatD-related deoxyribonuclease  32.08 
 
 		 276 aa  107  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1654  ATPase  34.74 
 
 		 258 aa  107  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.544583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1422  hydrolase, TatD family  31.05 
 
 		 267 aa  106  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.236836 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1248  hydrolase, TatD family  33.69 
 
 		 326 aa  106  5e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116067 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18871  TatD family deoxyribonuclease  40.71 
 
 		 263 aa  106  5e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1017  putative deoxyribonuclease, TatD family  40.71 
 
 		 263 aa  106  5e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1437  TatD-related deoxyribonuclease  31.94 
 
 		 265 aa  106  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1956  TatD-related deoxyribonuclease  31.89 
 
 		 303 aa  106  5e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.942839 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  38.32 
 
 		 261 aa  106  5e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0780  hydrolase, TatD family  34.41 
 
 		 273 aa  106  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1463  hydrolase, TatD family  30.53 
 
 		 267 aa  105  6e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.145299  normal  0.0126411 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  33.18 
 
 		 267 aa  105  6e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1881  TatD family hydrolase  32.09 
 
 		 258 aa  105  6e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0796453 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1594  putative metallodependent hydrolase  33.68 
 
 		 265 aa  105  6e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.118654  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3661  TatD family hydrolase  29.63 
 
 		 269 aa  105  7e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0030  hydrolase, TatD family  35.94 
 
 		 263 aa  105  8e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.572785  normal  0.0962999 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1825  TatD-related deoxyribonuclease  31.12 
 
 		 265 aa  105  9e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0332643  hitchhiker  0.00471039 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1239  hydrolase, TatD family  39.31 
 
 		 454 aa  105  1e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1857  putative deoxyribonuclease  31.02 
 
 		 270 aa  105  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.417967 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1913  putative metallodependent hydrolase  33.33 
 
 		 258 aa  104  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000168502  hitchhiker  0.00000614927 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2247  putative TatD-related deoxyribonuclease  34.76 
 
 		 256 aa  104  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.152142  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  33.7 
 
 		 606 aa  104  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1700  TatD-related deoxyribonuclease  32.38 
 
 		 270 aa  104  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.294138  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2040  TatD family hydrolase  33.16 
 
 		 262 aa  103  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  31.85 
 
 		 262 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0819  TatD family hydrolase  33.68 
 
 		 257 aa  103  3e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.193936  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0262  hydrolase, TatD family  29.95 
 
 		 251 aa  103  3e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000135646  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  32.49 
 
 		 462 aa  103  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1600  hypothetical protein  32.98 
 
 		 255 aa  103  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0964  TatD family hydrolase  28.93 
 
 		 263 aa  103  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.913879  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4802  TatD family hydrolase  32.42 
 
 		 283 aa  103  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1655  TatD-related deoxyribonuclease  32.8 
 
 		 261 aa  103  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0399887  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1381  TatD-related deoxyribonuclease  27.98 
 
 		 254 aa  102  5e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2706  TatD-related deoxyribonuclease  33.51 
 
 		 263 aa  102  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.799074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3409  TatD family hydrolase  30.77 
 
 		 264 aa  102  5e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.329144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0090  hydrolase, TatD family  36.46 
 
 		 255 aa  102  6e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00880503  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0706  TatD family hydrolase  32.29 
 
 		 255 aa  102  7e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2496  putative metallodependent hydrolase  36.99 
 
 		 265 aa  102  9e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00642491  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0903  hydrolase, TatD family  29.63 
 
 		 287 aa  102  9e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.153201  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1497  TatD-related deoxyribonuclease  32.74 
 
 		 258 aa  102  9e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.119222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2800  putative metallodependent hydrolase  36.99 
 
 		 264 aa  102  9e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.150723  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0206  Mg-dependent DNase  30.93 
 
 		 256 aa  102  9e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000791491  normal  0.0173908 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1018  TatD family hydrolase  32.46 
 
 		 261 aa  102  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.195274  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0185  TatD family hydrolase  35.15 
 
 		 278 aa  101  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1497  TatD family hydrolase  33.33 
 
 		 260 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.109711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  32.75 
 
 		 458 aa  101  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>