More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1426 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE1426  aminotransferase  100 
 
 
368 aa  763    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1781  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  56.44 
 
 
366 aa  432  1e-120  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1403  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  52.7 
 
 
371 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2237  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  52.05 
 
 
366 aa  399  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.602251  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1304  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  51.9 
 
 
370 aa  389  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.298475  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2658  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  52.05 
 
 
367 aa  388  1e-107  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3026  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  50.27 
 
 
367 aa  388  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.252777  normal  0.181816 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1325  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  52.86 
 
 
368 aa  383  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0290  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  48.11 
 
 
376 aa  379  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0634  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  52.33 
 
 
374 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.797926 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1610  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  50.41 
 
 
367 aa  375  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.988475  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3415  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  49.73 
 
 
364 aa  372  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09388  aminotransferase, DegT/DnrJ/EryC1/StrS family protein  48.63 
 
 
367 aa  370  1e-101  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0977443  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3190  glutamine--scyllo-inositol transaminase  51.37 
 
 
366 aa  365  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1290  glutamine--scyllo-inositol transaminase  50.69 
 
 
372 aa  367  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0790  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  49.86 
 
 
368 aa  361  1e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1698  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  50 
 
 
373 aa  358  9.999999999999999e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00203  aminotransferase  49.46 
 
 
370 aa  354  1e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.460173  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1239  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  49.31 
 
 
368 aa  351  1e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.868639  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1191  glutamine--scyllo-inositol transaminase  47.54 
 
 
365 aa  347  2e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0689  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  49.17 
 
 
369 aa  342  8e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.530508  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2941  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  48.63 
 
 
374 aa  340  2e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3423  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  45.5 
 
 
366 aa  332  9e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0969116  normal  0.511513 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2308  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  46.01 
 
 
365 aa  318  9e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.20992 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2016  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  45.9 
 
 
365 aa  316  3e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288429  hitchhiker  0.000869808 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0204  glutamine--scyllo-inositol transaminase  44.96 
 
 
385 aa  311  1e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2810  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  45.71 
 
 
380 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1353  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  44.62 
 
 
370 aa  298  9e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3868  glutamine--scyllo-inositol transaminase  44.69 
 
 
372 aa  298  1e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.335317  normal  0.538373 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0709  glutamine--scyllo-inositol transaminase  42.43 
 
 
368 aa  294  2e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3491  aminotransferase, DegT/DnrJ/EryC1/StrS faily  44.74 
 
 
376 aa  292  8e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1081  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  40.05 
 
 
390 aa  290  3e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.014867  normal  0.0169301 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2874  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  42.78 
 
 
371 aa  288  1e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1934  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  39.95 
 
 
387 aa  285  9e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2510  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  40.43 
 
 
378 aa  282  6.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3596  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  40.16 
 
 
378 aa  280  2e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1237  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  41.58 
 
 
369 aa  280  3e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.101913  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1067  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  40.65 
 
 
366 aa  280  3e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2700  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  43.37 
 
 
372 aa  279  6e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2694  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  41.51 
 
 
377 aa  278  2e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0105564 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1406  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  40.64 
 
 
373 aa  276  3e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0200514 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1610  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  41.14 
 
 
357 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3194  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  40.11 
 
 
366 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5774  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  42.98 
 
 
369 aa  273  3e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0703  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  39.04 
 
 
394 aa  272  6e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000106143  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3928  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  43.29 
 
 
369 aa  272  8.000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0951688  normal  0.298031 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1257  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  38.61 
 
 
364 aa  271  1e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.393773  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4056  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  40.11 
 
 
377 aa  271  1e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4276  glutamine--scyllo-inositol transaminase  38.9 
 
 
391 aa  271  1e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3689  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  42.86 
 
 
376 aa  270  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.90601  normal  0.249584 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0405  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  43.7 
 
 
368 aa  267  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.543187 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2351  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  40.38 
 
 
366 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1727  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  38.99 
 
 
377 aa  266  2.9999999999999995e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.698804  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2151  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  41.29 
 
 
377 aa  264  2e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599316 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2511  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  39.3 
 
 
393 aa  264  2e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.783199 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13373  pigmentation and extracellular proteinase regulator  37.92 
 
 
385 aa  263  3e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0399  aminotransferase  38.15 
 
 
364 aa  263  4e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03081  putative pleiotropic regulatory protein  40.31 
 
 
401 aa  263  4.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1737  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  42.11 
 
 
365 aa  261  8.999999999999999e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2262  pleiotropic regulatory protein  40.11 
 
 
363 aa  261  1e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3259  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  41.78 
 
 
372 aa  261  1e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4000  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  42.78 
 
 
376 aa  261  1e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.952082  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0214  putative pleiotropic regulatory protein  38.64 
 
 
413 aa  261  2e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.777207  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4493  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  40.17 
 
 
370 aa  261  2e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000221733  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2777  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  41.57 
 
 
372 aa  260  3e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000279721  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0679  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  39.62 
 
 
374 aa  260  3e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.153836  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1398  glutamine--scyllo-inositol transaminase  41.21 
 
 
420 aa  260  3e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1173  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  39.15 
 
 
364 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0972  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  38.11 
 
 
397 aa  259  6e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0603476  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2912  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  38.81 
 
 
395 aa  258  9e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0252109  hitchhiker  0.00353646 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0241  putative pleiotropic regulatory protein  38.83 
 
 
408 aa  258  1e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.819498  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0941  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  38.33 
 
 
375 aa  257  2e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000993087 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1650  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase family protein  38.56 
 
 
389 aa  257  3e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0933  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  40.4 
 
 
376 aa  257  3e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03641  putative pleiotropic regulatory protein  38.56 
 
 
389 aa  256  3e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0562447  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0540  thioesterase family protein  38.9 
 
 
362 aa  256  4e-67  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0824  glutamine--scyllo-inositol transaminase  38.81 
 
 
378 aa  256  4e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0286  putative pleiotropic regulatory protein  40.05 
 
 
401 aa  256  6e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3307  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  38.33 
 
 
374 aa  255  8e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2210  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  39.08 
 
 
368 aa  255  8e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25161  putative pleiotropic regulatory protein  37.44 
 
 
408 aa  255  8e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1514  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  36.7 
 
 
379 aa  255  9e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6418  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  39.44 
 
 
367 aa  255  9e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.50729  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8497  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  41.03 
 
 
375 aa  254  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.36272  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0724  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  39.03 
 
 
387 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.297651  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4614  glutamine--scyllo-inositol transaminase  39.3 
 
 
371 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0955854 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03071  putative pleiotropic regulatory protein  39.54 
 
 
401 aa  254  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.743429  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2422  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  38.63 
 
 
374 aa  253  3e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0902  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  39.45 
 
 
363 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.754619  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0356  glutamine--scyllo-inositol transaminase  40.87 
 
 
371 aa  253  5.000000000000001e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0672  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  40.06 
 
 
367 aa  251  1e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.225626  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1174  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  39.22 
 
 
369 aa  251  1e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.12286  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1458  pleiotropic regulatory protein, putative  39.22 
 
 
369 aa  251  1e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0280  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  39.01 
 
 
375 aa  250  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3037  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  37.33 
 
 
367 aa  249  4e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.418977  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1483  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  37.64 
 
 
365 aa  249  4e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.207853  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0245  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  38.61 
 
 
357 aa  249  4e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.4037 
 
 
-
 
NC_002950  PG1138  pigmentation and extracellular proteinase regulator  38.56 
 
 
384 aa  248  8e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1072  aminotransferase, DegT/DnrJ/EryC1/StrS family  40.38 
 
 
371 aa  248  9e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1071  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase family enzyme  39.39 
 
 
360 aa  248  1e-64  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>