More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1314 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE1314  penicillin-binding protein  100 
 
 
620 aa  1263    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0136  penicillin-binding protein  31.13 
 
 
629 aa  285  2.0000000000000002e-75  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  32.44 
 
 
657 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1442  stage V sporulation protein D  30.65 
 
 
740 aa  268  2e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.542093  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  29.38 
 
 
656 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  28.91 
 
 
657 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  29.95 
 
 
657 aa  256  8e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  30.15 
 
 
660 aa  252  1e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.52 
 
 
662 aa  250  5e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1570  stage V sporulation protein D  30.02 
 
 
708 aa  249  9e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1048  stage V sporulation protein D  31.5 
 
 
708 aa  248  2e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.68 
 
 
654 aa  247  6e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0837  stage V sporulation protein D  32.03 
 
 
711 aa  241  2.9999999999999997e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.677302 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0669  stage V sporulation protein D  28.28 
 
 
713 aa  238  2e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1614  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.46 
 
 
582 aa  236  7e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0820  peptidoglycan glycosyltransferase  30.28 
 
 
705 aa  233  8.000000000000001e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2793  peptidoglycan glycosyltransferase  30.7 
 
 
586 aa  232  2e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121115  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1298  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.03 
 
 
704 aa  231  3e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2771  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.88 
 
 
672 aa  227  4e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.47482  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3980  peptidoglycan glycosyltransferase  28.93 
 
 
657 aa  226  1e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0979  peptidoglycan glycosyltransferase  29.72 
 
 
723 aa  224  2e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3635  peptidoglycan glycosyltransferase  28.11 
 
 
729 aa  223  7e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09030  stage V sporulation protein D  28.23 
 
 
695 aa  220  7e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3465  penicillin-binding protein, transpeptidase  28.84 
 
 
703 aa  218  2.9999999999999998e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00575858 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2015  peptidoglycan glycosyltransferase  27.98 
 
 
649 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1887  stage V sporulation protein D  29.52 
 
 
644 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1107  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.62 
 
 
710 aa  214  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10750  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  28.87 
 
 
581 aa  212  1e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0761789  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3821  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.65 
 
 
675 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3905  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.65 
 
 
675 aa  211  3e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2706  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.62 
 
 
689 aa  209  9e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0219846  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0740  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.44 
 
 
645 aa  209  1e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.641793  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1068  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.32 
 
 
579 aa  208  2e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.724517 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3765  peptidoglycan glycosyltransferase  27.1 
 
 
675 aa  208  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.870412  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2528  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.57 
 
 
670 aa  208  3e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2612  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.41 
 
 
644 aa  206  9e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.45331  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4069  stage V sporulation protein D  28.33 
 
 
682 aa  206  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1401  peptidoglycan glycosyltransferase  28.94 
 
 
727 aa  204  3e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677151  normal  0.0298794 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2727  peptidoglycan glycosyltransferase  27.29 
 
 
684 aa  204  3e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1590  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.78 
 
 
692 aa  204  5e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150258  normal  0.450478 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2116  peptidoglycan glycosyltransferase  26.93 
 
 
673 aa  203  9e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0866  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.74 
 
 
562 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.07417  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0528  stage V sporulation protein D  26.75 
 
 
728 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1015  stage V sporulation protein D  29.7 
 
 
646 aa  201  3e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0544  stage V sporulation protein D  26.87 
 
 
721 aa  201  3e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.6503  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0735  peptidoglycan glycosyltransferase  27.2 
 
 
690 aa  200  5e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0180376  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2134  stage V sporulation protein D  27.45 
 
 
727 aa  200  7e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0772  stage V sporulation protein D  26.65 
 
 
719 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.655623  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1272  stage V sporulation protein D  29.28 
 
 
645 aa  198  3e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.144454  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2275  peptidoglycan synthetase FtsI  29.54 
 
 
583 aa  198  3e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.482519 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1846  stage V sporulation protein D  27.15 
 
 
727 aa  197  6e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1036  peptidoglycan glycosyltransferase  27.18 
 
 
675 aa  197  7e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22860  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  28.89 
 
 
754 aa  195  2e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.499812  normal  0.0374839 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3878  peptidoglycan glycosyltransferase  25.94 
 
 
671 aa  195  2e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1278  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.68 
 
 
618 aa  196  2e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.907115  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3433  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.83 
 
 
588 aa  195  2e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2932  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.21 
 
 
702 aa  194  5e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00757517  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0961  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.29 
 
 
654 aa  194  5e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171125 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1172  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.97 
 
 
656 aa  193  6e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1112  peptidoglycan glycosyltransferase  29.08 
 
 
553 aa  192  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0521932  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0057  peptidoglycan glycosyltransferase  31.05 
 
 
582 aa  192  1e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0254868  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2565  stage V sporulation protein D  29.15 
 
 
638 aa  192  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.18233  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3961  sporulation specific penicillin-binding protein  28.84 
 
 
638 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0017  Peptidoglycan glycosyltransferase  24.84 
 
 
635 aa  190  5e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.603122  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3968  sporulation specific penicillin-binding protein  28.84 
 
 
638 aa  190  7e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.313702  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2269  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.52 
 
 
680 aa  189  1e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3766  sporulation specific penicillin-binding protein  28.75 
 
 
638 aa  189  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1789  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.57 
 
 
561 aa  189  1e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.816247  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4054  sporulation specific penicillin-binding protein  28.75 
 
 
638 aa  189  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0057  peptidoglycan glycosyltransferase  30.88 
 
 
582 aa  189  1e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.208475  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2431  penicillin-binding protein transpeptidase domain-containing protein  26.96 
 
 
712 aa  188  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00172457  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3657  sporulation specific penicillin-binding protein  28.59 
 
 
638 aa  188  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3674  sporulation specific penicillin-binding protein  28.59 
 
 
638 aa  188  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3775  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.35 
 
 
553 aa  189  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.061336  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1225  sporulation specific penicillin-binding protein  28.68 
 
 
638 aa  188  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00126151  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2566  peptidoglycan glycosyltransferase  28.78 
 
 
717 aa  189  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0759  peptidoglycan glycosyltransferase  27.92 
 
 
631 aa  189  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4016  sporulation specific penicillin-binding protein  28.68 
 
 
638 aa  188  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.622695  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3504  peptidoglycan synthetase FtsI  29.54 
 
 
582 aa  188  3e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.152932 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3742  stage V sporulation protein D  28.37 
 
 
638 aa  187  3e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1004  peptidoglycan glycosyltransferase  27.27 
 
 
638 aa  186  8e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.855584  normal  0.147704 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0597  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.45 
 
 
614 aa  186  9e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3930  sporulation specific penicillin-binding protein  28.75 
 
 
638 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00892193 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2864  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.18 
 
 
583 aa  185  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539951  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2717  penicillin-binding protein  26.68 
 
 
712 aa  186  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.211599  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2207  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.32 
 
 
571 aa  184  3e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.345655  normal  0.115802 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3268  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.95 
 
 
607 aa  184  3e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0424379  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2677  penicillin-binding protein  26 
 
 
712 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2679  penicillin-binding protein  26 
 
 
712 aa  184  6e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.314189  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2666  penicillin-binding protein  26.39 
 
 
712 aa  184  6e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000149104 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2467  penicillin-binding protein  26.39 
 
 
712 aa  183  7e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00794581  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2648  penicillin-binding protein  26.39 
 
 
712 aa  183  7e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2476  peptidoglycan glycosyltransferase  27.46 
 
 
649 aa  183  7e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2097  peptidoglycan glycosyltransferase  28.41 
 
 
575 aa  183  9.000000000000001e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0375891  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1989  cell division protein  26.51 
 
 
552 aa  182  2e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0400114  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2899  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.58 
 
 
680 aa  182  2e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0113727  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0916  peptidoglycan synthetase FtsI  29.22 
 
 
575 aa  181  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.59 
 
 
570 aa  182  2e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3459  peptidoglycan glycosyltransferase  28.79 
 
 
578 aa  182  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0440693 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1254  peptidoglycan glycosyltransferase  27.36 
 
 
562 aa  182  2e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>