More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1080 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE1080  dimethyladenosine transferase  100 
 
 
293 aa  595  1e-169  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0603  dimethyladenosine transferase  36.11 
 
 
281 aa  167  2.9999999999999998e-40  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3899  dimethyladenosine transferase  35.23 
 
 
290 aa  166  5e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247606  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1772  dimethyladenosine transferase  33.7 
 
 
290 aa  162  7e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2325  dimethyladenosine transferase  33.82 
 
 
279 aa  160  3e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000317998  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0037  dimethyladenosine transferase  30.93 
 
 
291 aa  153  4e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0131  dimethyladenosine transferase  32.28 
 
 
284 aa  152  5.9999999999999996e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.684706  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1779  dimethyladenosine transferase  31.88 
 
 
290 aa  151  1e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0718  dimethyladenosine transferase  31.27 
 
 
294 aa  149  7e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616682  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1509  dimethyladenosine transferase  32.98 
 
 
280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000452453  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1848  dimethyladenosine transferase  33.33 
 
 
264 aa  147  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0035  dimethyladenosine transferase  30.07 
 
 
293 aa  146  5e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0514  dimethyladenosine transferase  32.25 
 
 
297 aa  145  6e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00510308  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0527  dimethyladenosine transferase  32.25 
 
 
297 aa  145  6e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0439475  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0131  dimethyladenosine transferase  32.5 
 
 
296 aa  145  7.0000000000000006e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.273731  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2840  dimethyladenosine transferase  32.6 
 
 
285 aa  144  1e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2526  dimethyladenosine transferase  32.6 
 
 
285 aa  144  1e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0045  dimethyladenosine transferase  34.18 
 
 
299 aa  144  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0077  dimethyladenosine transferase  31.82 
 
 
293 aa  143  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000377526  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3913  dimethyladenosine transferase  31.66 
 
 
269 aa  142  5e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2288  dimethyladenosine transferase  33.96 
 
 
275 aa  142  5e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.311251  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0213  dimethyladenosine transferase  30.82 
 
 
297 aa  141  9.999999999999999e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1277  dimethyladenosine transferase  32.6 
 
 
285 aa  141  9.999999999999999e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.772647  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21720  dimethyladenosine transferase  30 
 
 
301 aa  141  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.700032  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0518  dimethyladenosine transferase  32.69 
 
 
259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0036  dimethyladenosine transferase  31.8 
 
 
292 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1935  dimethyladenosine transferase  33.58 
 
 
275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0046  dimethyladenosine transferase  32.2 
 
 
302 aa  140  3e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0036  dimethyladenosine transferase  30.66 
 
 
292 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0039  dimethyladenosine transferase  31.45 
 
 
292 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0040  dimethyladenosine transferase  31.45 
 
 
292 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0546968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0037  dimethyladenosine transferase  31.45 
 
 
292 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0037  dimethyladenosine transferase  31.45 
 
 
292 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00019411  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5270  dimethyladenosine transferase  31.45 
 
 
292 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0046  dimethyladenosine transferase  31.45 
 
 
292 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0039  dimethyladenosine transferase  31.45 
 
 
292 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0050  dimethyladenosine transferase  31.45 
 
 
292 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0111  dimethyladenosine transferase  32.52 
 
 
305 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.294487  hitchhiker  0.00410281 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0046  dimethyladenosine transferase  31.45 
 
 
292 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0074  dimethyladenosine transferase  32.85 
 
 
278 aa  139  7e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000211917  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4092  dimethyladenosine transferase  31.12 
 
 
288 aa  137  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114953  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0907  dimethyladenosine transferase  32.33 
 
 
296 aa  137  2e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000552021  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0985  dimethyladenosine transferase  30.69 
 
 
316 aa  137  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2309  dimethyladenosine transferase  32.33 
 
 
275 aa  137  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000265248  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0858  dimethyladenosine transferase  35.25 
 
 
258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1143  dimethyladenosine transferase  33.56 
 
 
281 aa  137  3.0000000000000003e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.114498  normal  0.0559603 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03390  dimethyladenosine transferase  31.65 
 
 
302 aa  136  4e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0905  dimethyladenosine transferase  31.34 
 
 
268 aa  136  5e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.983231  normal  0.2455 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07730  dimethyladenosine transferase  33.33 
 
 
268 aa  136  5e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0104234 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3209  dimethyladenosine transferase  30.97 
 
 
268 aa  136  5e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.601511  normal  0.884447 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3115  dimethyladenosine transferase  30.97 
 
 
268 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5229  dimethyladenosine transferase  28.32 
 
 
293 aa  135  7.000000000000001e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0245049  hitchhiker  0.00538295 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0171  dimethyladenosine transferase  33.09 
 
 
290 aa  135  8e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5135  dimethyladenosine transferase  33.58 
 
 
272 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0062  dimethyladenosine transferase  33.1 
 
 
302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.142341 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1613  dimethyladenosine transferase  30.25 
 
 
295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0645  dimethyladenosine transferase  29.89 
 
 
298 aa  134  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3639  dimethyladenosine transferase  30.6 
 
 
268 aa  134  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0736  dimethyladenosine transferase  32.59 
 
 
268 aa  133  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09471  dimethyladenosine transferase  33.72 
 
 
291 aa  133  3e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0967055 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3421  dimethyladenosine transferase  34.44 
 
 
268 aa  133  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.747318  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0668  dimethyladenosine transferase  30.1 
 
 
267 aa  133  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.777402  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2492  dimethyladenosine transferase  32.18 
 
 
271 aa  133  3e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000182898  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1513  dimethyladenosine transferase  28.77 
 
 
305 aa  133  3.9999999999999996e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.352212  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4627  dimethyladenosine transferase  31.87 
 
 
268 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1492  dimethyladenosine transferase  32 
 
 
279 aa  132  5e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0208  dimethyladenosine transferase  27.97 
 
 
298 aa  132  6e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000398679  normal  0.017695 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1171  dimethyladenosine transferase  32.73 
 
 
276 aa  132  6e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00874938  normal  0.712777 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0392  dimethyladenosine transferase  33.33 
 
 
291 aa  132  6e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00405196  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1864  dimethyladenosine transferase  32.46 
 
 
276 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131942  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0551  dimethyladenosine transferase  31.87 
 
 
268 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0278  dimethyladenosine transferase  33.33 
 
 
291 aa  131  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.525697  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0432  dimethyladenosine transferase  32.7 
 
 
266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.509897  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4013  dimethyladenosine transferase  31.68 
 
 
269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0879  dimethyladenosine transferase  30.45 
 
 
269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.865136 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4801  dimethyladenosine transferase  32.7 
 
 
266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8618  dimethyladenosine transferase  29.6 
 
 
281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601194  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1901  dimethyladenosine transferase  31.4 
 
 
272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.13527 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0989  dimethyladenosine transferase  30.97 
 
 
268 aa  130  3e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1288  dimethyladenosine transferase  31.42 
 
 
297 aa  129  4.0000000000000003e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0401  dimethyladenosine transferase  32.7 
 
 
267 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1352  dimethyladenosine transferase  31.42 
 
 
297 aa  129  4.0000000000000003e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.212433  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0726  dimethyladenosine transferase  29.78 
 
 
289 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.810967  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3313  dimethyladenosine transferase  30.22 
 
 
268 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.273934  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0708  dimethyladenosine transferase  29.41 
 
 
281 aa  129  4.0000000000000003e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32460  dimethyladenosine transferase  31.65 
 
 
284 aa  129  4.0000000000000003e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.956525 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0977  dimethyladenosine transferase  30.22 
 
 
268 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0224326  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0435  dimethyladenosine transferase  32.7 
 
 
267 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1283  dimethyladenosine transferase  32.05 
 
 
274 aa  129  5.0000000000000004e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2092  dimethyladenosine transferase  31.64 
 
 
284 aa  129  5.0000000000000004e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000751415  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1079  dimethyladenosine transferase  30.22 
 
 
268 aa  129  6e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.292406  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1046  dimethyladenosine transferase  30.22 
 
 
268 aa  129  6e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0615563  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4074  dimethyladenosine transferase  29.93 
 
 
279 aa  129  7.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3507  dimethyladenosine transferase  29.59 
 
 
276 aa  129  7.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.450284  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3079  dimethyladenosine transferase  29.1 
 
 
268 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001665  dimethyladenosine transferase  30.71 
 
 
269 aa  128  9.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30300  dimethyladenosine transferase  31.17 
 
 
320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.222246 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1571  dimethyladenosine transferase  34.8 
 
 
264 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.836645  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0892  dimethyladenosine transferase  33.33 
 
 
262 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00808  dimethyladenosine transferase  30.34 
 
 
269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>