49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0651 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0651    100 
 
 		 2072 bp  4107    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000172129  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1888  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  86.45 
 
 		 2760 bp  141  9e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.640223  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0486  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  84.18 
 
 		 1965 bp  115  5e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000246606  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6198  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  83.44 
 
 		 2262 bp  109  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.771465  normal  0.139813 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2013  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  82.68 
 
 		 1962 bp  109  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000446892  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1826  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  90.36 
 
 		 2397 bp  101  8e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000190573  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3931  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  82.89 
 
 		 2118 bp  95.6  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000543237  normal  0.470613 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1001  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  81.82 
 
 		 2307 bp  95.6  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1378  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  85.86 
 
 		 2157 bp  85.7  0.00000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0081  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  83.33 
 
 		 2115 bp  83.8  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1231  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  87.5 
 
 		 2040 bp  79.8  0.000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1804  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  80.43 
 
 		 2121 bp  79.8  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000195761  normal  0.426501 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0746  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  81.82 
 
 		 2673 bp  77.8  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.34227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1173  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  80.75 
 
 		 2085 bp  73.8  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.229725  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0005  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  80.75 
 
 		 2085 bp  73.8  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0629  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  81.43 
 
 		 2226 bp  71.9  0.0000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1479  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  84.78 
 
 		 2544 bp  71.9  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.926443  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3559  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  85.54 
 
 		 2340 bp  69.9  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0306706  normal  0.266916 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0829  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  84.21 
 
 		 2349 bp  69.9  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00399457 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1342  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  85.54 
 
 		 1950 bp  69.9  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0044  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  80.37 
 
 		 2025 bp  69.9  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0186  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  84.09 
 
 		 2016 bp  63.9  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1067  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  88.14 
 
 		 2154 bp  61.9  0.0000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0766  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  83.72 
 
 		 2127 bp  60  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0013002  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0566  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  86.15 
 
 		 2043 bp  58  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1983  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  79.5 
 
 		 2235 bp  58  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0934  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  86.15 
 
 		 2064 bp  58  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0756  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  86.15 
 
 		 2136 bp  58  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.145691  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1837  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  87.5 
 
 		 2139 bp  56  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000332783  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15760  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  89.36 
 
 		 1959 bp  54  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000521315  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2253  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  79.72 
 
 		 2010 bp  54  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.627571  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1349  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  81.31 
 
 		 2019 bp  54  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.528352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3239  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  83.78 
 
 		 2055 bp  52  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000998265  normal  0.0229297 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0579  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  90.24 
 
 		 2064 bp  50.1  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000633179 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0739  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  81.19 
 
 		 2034 bp  50.1  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00661783  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2001  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  82.02 
 
 		 2025 bp  50.1  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0591536  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0657  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  86.79 
 
 		 2136 bp  50.1  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0215912 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0992  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  84.62 
 
 		 1983 bp  50.1  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.701205  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1812  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  82.02 
 
 		 2085 bp  50.1  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1425  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  86.79 
 
 		 2085 bp  50.1  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.29497  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1500  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  83.82 
 
 		 2040 bp  48.1  0.01  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3291  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  81.52 
 
 		 2043 bp  48.1  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00806153  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0418  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  90 
 
 		 2049 bp  48.1  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0928775 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2481  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  85.71 
 
 		 2328 bp  48.1  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.618403 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1101  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  88.64 
 
 		 2079 bp  48.1  0.01  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.930953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3003  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  83.82 
 
 		 2079 bp  48.1  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0646  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  79.29 
 
 		 2046 bp  48.1  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000127282  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0692  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  82.5 
 
 		 2127 bp  48.1  0.01  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000200015  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2985  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  81.52 
 
 		 2103 bp  48.1  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000074507  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>